توالی یابی de novo ترانسکریپتوم و آنالیز عملکردی ژن های با بیان متفاوت بذرهای بزرگ و کوچک گیاه توق خاردار (.Xanthium strumarium L) در دوره نمو

گیاه توق خاردار (Xanthium strumarium L.) گیاهی هرز با ارزش دارویی بالا است که به دلیل وجود خواب عمیق فقط در یکی از دو بذر درون یک کپسول این گیاه، برای مطالعات خواب بذر بسیار مورد علاقه پژوهشگران است. با این وجود، نبود اطلاعات ژنومیک در این گیاه، سبب شده است که دانسته ها در مورد آن در سطح بسیار پایینی باشد. در این تحقیق، ترانسکریپتوم بذرهای کوچک و بزرگ این گیاه در طول دوره نمو با استفاده از پلتفرم Illumina، با هدف شناسایی و بررسی عملکردی رونوشت های با بیان متفاوت میان دو بذر، توالی یابی شد. توالی های شناسایی شده بین دو بذر با یکدیگر مقایسه شدند و رونوشت های با بیان متفاوت بین دو بذر مورد تفسیر عملکردی قرار گرفتند. در این پژوهش تعداد 191192 توالی ژن با میانگین طول 69/989 جفت باز شناسایی شد. آنالیزهای تشابه توالی و تفسیر عملکردی این توالی ها برعلیه پایگاه داده nr، آنالیز GO و KEGG انجام شد. ژن های با بیان متفاوت، از نظر top hits، بیشترین تشابه را با آفتابگردان زراعی (41/83 درصد) داشتند. آنالیز GO سبب شناسایی 615 تفسیر عملکردی در 36 گروه شد. فراوان ترین GO یافت شده در دسته فرایند بیولوژیک، فرایندهای بیوسنتزی بود. نتایج این تحقیق فرایندهای بیوسنتزی و متابولیک بیشتر را در بذر بزرگ نسبت به بذر کوچک تر و نقش تنظیمی کلیدی رونویسی را در دوره نمو بذر نشان داد.