مطالعه ی مورفولوژیکی و فیلوژنتیکی قارچ های میکوریز آربوسکولار همزیست با ریشه ی برخی گیاهان دارویی استان کرمان

 گیاهانی که ریشه ی آن ها با قارچ های میکوریز آربوسکولار رابطه ی همزیستی دارند، نسبت به گیاهان غیرمیکوریزی، توانایی بالاتری دربرابر تنش های مختلف زنده و غیرزنده ی محیطی همچون خشکی، شوری و آفات و بیماریهای گیاهی دارند. هدف از این مطالعه، بررسی گونه های مختلف AMF در استان کرمان است. شناسایی این میکروارگانیسم ها مبنایی برای مطالعات بیشتر در مورد استفاده از این میکروارگانیسم ها در جوانه زنی ، رشد و تکثیر گیاهان دارویی است. 

 به منظور شناسایی مولکولی و مورفولوژیکی قارچهای میکوریز آربوسکولار، نمونه برداری از منطقه ی ریزوسفر گیاهان دارویی در برخی مناطق استان کرمان انجامشد. اسپورهای قارچ میکوریز آربوسکولار از خاکهای نمونه برداری شده با استفاده از روش الک مرطوب جداسازی شدند.  گروه بندی بر اساس اسلاید میکروسکوپی و ویژگیهای مورفولوژیکی مانند رنگ اسپور، شکل، تزیینات سطح، اندازه و ساختار دیواره آنها و خصوصیات اسپور ها در آب انجام شد. استخراج DNA از تک اسپور انجام شد. بخشی از  DNA ریبوزومی با روش PCR آشیانه ای، با استفاده از آغازگرهای SSUmaf و LSUmAr در مرحله اول و SSUmCf و LSUmBr در مرحله دوم تکثیر گردید و محصول PCR پس از الکتروفورز افقی ژل آگاروز و مشاهده ی باند مربوطه برای توالی یابی ارسال شد. سپس نتایج توالی یابی با استفاده از نرم افزارهای BLAST، Gene Runner و Clustal Omega مورد بررسی قرار گرفت و  با استفاده از نرم افزار MEGA 7، درخت فیلوژنی رسم شد.

 براساس بررسی های مورفولوژیکی و مولکولی، گونه های Viscospora viscosa،Septoglomus deserticola ، Funneliformis caledonius،Funneliformis mosseae و Diversispora spurca شناسایی گردید. در انتها، وجود و چگونگی قرابت گونه های شناسایی شده در درخت فیلوژنی مورد بررسی قرار گرفت.

 ازآن جا که ویژگی های مورفولوژیکی مورد استفاده در شناسایی و رده بندی قارچ های میکوریز محدود می باشند، می توان برای رده بندی مطمین تر از روش های مولکولی استفاده کرد و از این طریق تمایز گونه های مشابه از نظر مورفولوژیکی و یا تشابه نمونه های متفاوت از نظر ظاهری را تشخیص داد.