Molecular Identification of Three Watermelon Mosaic Virus Isolates from Cucurbits of East Azarbaijan and West Provinence
Message:
Abstract:

Watermelon mosaic virus (WMV) is member of the genus Potyvirus in the family Potyviridae. To stady determine distribution and phylogenetic analysis this virus in cucurbits various fields of East Azarbaijan and West province, 305 plant samples suspected to be infected were collected from thriteen regions. Inoculation were done on the diagnostic hosts and propagation hosts cucurbita pepo. Two weeks after inoculation, WMV isolates caused various symptoms including leaf deformation, thin and torn with green blistering and mosaic on the leaf of Cucurbita pepo. Viral RNA was extracted from infected plant according to Rouhani et al’s protocol and cDNA was prepared. RT-PCR reaction was performed on 54 samples selected as representative of the samples, in terms of the diversity of symptoms and the region. Using specific primers, 800bp fragment was amplified of coat protein gene area of WMV. PCR products of three WMV isolates was directly sequenced based on the variety of symptoms and the region and was compared containing 780 nt from coat protein gene, along with 19 sequences selected from GenBank. Phylogenetic analysis based on the nucleotide sequence of coat protein gene placed these isolates in three groups where T1.Ahr and 32.Tab isolates of East Azarbaijan were placed next to some isolates from Isfahan, Kerman, Yazd and some European countries into group I. of course, T1.Ahr and 32.Tab isolates and ESF.ES.2 isolates from Isfahan and isolates from Europe were clustered into group I. T5.Nagd isolate of West Azarbaijan and isolates traced from different parts of the world were classified in group II.

Keywords:

WMV,Biological,RT-PCR,Coat protein,Phylogenetical

Article Type:
Research/Original Article
Language:
Persian
Published:
Journal of Science and Engineering Elites, Volume:5 Issue: 2, 2020
Pages:
180 - 190
magiran.com/p2139659  
برخی از خدمات از جمله دانلود متن مقالات تنها به مشترکان مگیران ارایه می‌گردد. شما می‌توانید به یکی از روش‌های زیر مشترک شوید:
اشتراک شخصی
در سایت عضو شوید و هزینه اشتراک یک‌ساله سایت به مبلغ 400,000ريال را پرداخت کنید. همزمان با برقراری دوره اشتراک بسته دانلود 100 مطلب نیز برای شما فعال خواهد شد!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی همه کاربران به متن مطالب خریداری نمایند!
توجه!
  • دسترسی به متن مقالات این پایگاه در قالب ارایه خدمات کتابخانه دیجیتال و با دریافت حق عضویت صورت می‌گیرد و مگیران بهایی برای هر مقاله تعیین نکرده و وجهی بابت آن دریافت نمی‌کند.
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.