آنالیز ژنتیکی و ظهور تیپ 2c پاروویروس سگ در جنوب شرقی نیجریه

آنالیز ژنتیکی واریانت های تیپ 2 پاروویروس سگ (CPV-2) که در جنوب شرقی نیجریه در حال چرخش هستند مورد بررسی قرار گرفت. سویه اصلی CPV-2 ابتدا در سال 1978 پدیدار شد و سپس به CPV-2a جهش یافت و همچنان در حال تغییر است. 

 مشخص کردن ویژگی های ژنتیکی سویه های CPV-2 شناسایی شده در سگ ها در جنوب شرقی نیجریه و گروه بندی فیلوژنتیکی ویروس ها با داده های توالی موجود.

 در مجموع 82 سواب از رکتوم سگ های مشکوک به CPV-2 در منطقه مورد مطالعه جمع آوری و در محیط انتقال ویروس (VTM) نگهداری شدند و با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز  (PCR)مورد بررسی قرار گرفتند. 

 هفتاد و نه نمونه (3/96%) از نظر CPV-2 مثبت بودند و تحلیل توالی قسمتی از ژن VP2 از 20 آمپلیکون، نشان دهنده انتشار CPV-2a (4 عدد) و CPV-2c (16 عدد) در منطقه بود. سویه های به دست آمده با همدیگر خوشه تشکیل دادند. با این حال، این گروه مجدد به دو خوشه واضح متشکل از سویه های 2a و 2c تقسیم شد. سویه واکسن و سویه های مرجع CPV-2 در ایالات متحده آمریکا، یک خوشه مونوفیلتیک تشکیل دادند.

تیپ 2a و 2c پاروویروس های سگ به طور همزمان در منطقه جنوب شرقی نیجریه در حال گردش هستند و در نتیجه نیاز فوری به یک واکسن بهبود یافته برای پوشش دادن سویه های در حال ظهور (CPV-2c) در نیجریه، وجود دارد.