شناسایی خانواده ژنی ERF در گیاه شورزیست Aeluropus littoralis و بررسی الگوی بیان آن‌ها در پاسخ به تنش شوری

تنش شوری یکی از تنش های غیرزیستی محدودکننده رشد و نمو گیاهان می باشد. عامل پاسخ دهنده به اتیلن (ERF) خانواده ای از عوامل رونویسی دخیل در رشد و نمو گیاهان و نیز پاسخ دهنده به تنش های زیستی و غیرزیستی بوده و با توجه به اهمیت این خانواده در پاسخ به تنش شوری، در این تحقیق شناسایی ژن های این خانواده در گیاه شورزیست چمن شور آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis) مدنظر قرار گرفت. در مجموع، 36 ژن غیر تکراری ERF در ژنوم آلوروپوس لیتورالیس شناسایی شد. ترسیم درخت فیلوژنتیک بر مبنای همولوژی با گیاه آرابیدوپسیس، خانواده ژنی AlERF را به شش گروه مشخص (B1 تا B6) طبقه بندی نمود. تجزیه و تحلیل ساختار ژنی نشان داد که تعداد اینترون در ژن های AlERF بین صفر تا دو متغیر بود. تجزیه و تحلیل موتیف های حفاظت شده و جستجوی دمین در توالی های پروتیینی AlERF نشان داد از ده موتیف شناسایی شده، تنها موتیف های یک و دو در ساختار دمین AP2/ERF مشارکت دارند. بر اساس داده های ترانسکریپتوم و نمودار Heatmap، ژن AlERF6.3 ببیشترین بیان را در شرایط تنش شوری در بافت ریشه نشان داد و بیشترین کاهش بیان نیز در ژن AlERF6.7 در شرایط بازیابی در بافت برگی مشاهده شد. این الگوی متفاوت بیان ژن ها در بافت های برگ و ریشه در مواجهه با تنش شوری، حاکی از وجود مکانیسم های تنظیمی متفاوت در بیان این ژن ها می باشد. نتایج این مطالعه به عنوان اولین گزارش در مورد خانواده ژنی ERF در آلوروپوس لیتورالیس، اطلاعات پایه ای را برای مطالعات بیشتر در مورد خصوصیات کارکردی ژن های AlERF فراهم می نماید.