بررسی ارتباط فیلوژنتیکی جدایه های ویروس کوتولگی سبزرد هندوانه (WmCSV) استان سیستان و بلوچستان بر اساس توالی ژن رمز کننده پروتئین پوششی

ویروس کوتولگی سبزرد هندوانه (Watermelon chlorotic stunt virus, WmCSV) به جنس Begomovirus از خانواده Geminiviridae تعلق دارد که بیشترین تعداد گونه را در مقایسه با سایر جنس های آلوده کننده گیاهان در خانواده Geminiviridae دارد و از طریق سفید بالک منتقل می شود. به منظور شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی WmCSV در محصولات کدوییان جنوب شرق کشور در سال های 95 و 96 بازدیدهایی از مزارع شهرستان های زابل، زهک، هامون، هیرمند، نیمروز، زاهدان، سراوان، ایرانشهر، نیک شهر، سرباز، کنارک و چابهار در استان سیستان و بلوچستان انجام گرفت و از محصولات مختلف کدوییان شامل خربزه، طالبی، هندوانه، کدو مسمایی و حلوایی نمونه برداری شد. از گیاهان دارای نشانه های زردی رگبرگ، کوتولگی گیاه، سبزردی و پیسکی شدن برگ ها، بدشکلی شدید و کوچک شدن اندازه میوه نمونه برداری شد و نمونه ها به آزمایشگاه منتقل شدند و سپس استخراج دی ان ای کل گیاه انجام شد. جهت شناسایی WmCSV از آغازگرهای اختصاصی Gem-CP-V-5' و Gem-CP-V-3' شناسایی کننده جنس بگوموویروس در کدوییان استفاده شد. محصولات پی سی آر مورد انتظار، به طول 550 جفت باز از ژن رمزکننده پروتئین پوششی، مورد توالی یابی قرار گرفتند. نتایج تعیین توالی مربوط به 16 نمونه از محصولات پی سی آر متعلق به مناطق مختلف استان آلودگی نمونه ها را به WmCSV تایید کرد. آنالیز فیلوژنتیکی نتایج  توالی یابی، در این پژوهش با برنامه MEGA 5، جدایه های WmCSV از استان سیستان و بلوچستان را در دو گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج نشان داد که این گروه بندی ارتباطی با نوع میزبان و یا منطقه جغرافیایی نداشته و برخی جدایه های استان ارتباط نزدیکی با جدایه های کشورهای عمان و عربستان داشتند.