مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم با صفات تولید شیر و معیار سلول های بدنی گاوهای هلشتاین ایران

در پرورش گاوشیری هدف اصلی افزایش سود است. افزایش بیماری ورم پستان از مشکلات اصلی پرورش گاوشیری با کاهش طول عمر تولیدی و افزایش هزینه ها، سبب تحمیل زیان های اقتصادی جدی به این صنعت شده است. این مطالعه باهدف بررسی معماری ژنتیکی و شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات تولیدشیر و تعداد سلول های بدنی به عنوان یکی از شاخص های ارزیابی کیفیت شیر و معیاری غیرمستقیم از بیماری ورم پستان، انجام شده است. برای بررسی ارتباط و شناسایی پنجره های ژنومی اصلی، از روش مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم یک مرحله ای با داده های ژنومی 1938 راس گاو نر استفاده شد. نتایج براساس واریانس ژنتیکی افزایشی پنجره های 5/1 مگابازی از SNPهای مجاور ارایه شده است. پنجره هایی که بیش از 1% واریانس را کنترل می کنند به عنوان نواحی ژنومی اصلی و جهت یافتن ژن های کاندیدا استفاده شدند. تعداد 11 پنجره ژنومی اصلی روی 9 کروموزوم اتوزوم، حاوی 94 ژن کاندیدا حدود 20% واریانس ژنتیکی معیار سلول های بدنی را توصیف می کردند. بیشترین واریانس مربوط به پنجره ای روی کروموزوم 14 (85/3%) بود. تعداد 6 پنجره اصلی روی 6 کروموزوم شامل 89 ژن کاندیدا، مرتبط با تولیدشیر بودند. این پنجره ها 8/8% واریانس و مهم ترین پنجره روی کروموزوم 10، حدود 08/2% واریانس را کنترل می نمودند. درخصوص مقدار چربی و پروتئین شیر، به ترتیب تعداد 9 منطقه روی 7 کروموزوم، حدود 6/15% و 9 پنجره روی 8 کروموزوم، حدود 6/10% از  واریانس را توصیف می کردند. نتایج نشان داد که 4 ناحیه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. یافته های این تحقیق می تواند به عنوان منبع اطلاعاتی مهمی در ارزیابی های ژنومی صفات تولید شیر و تعداد سلول های بدنی باشد.