توالی یابی نسل جدید و کاربرد آن در مطالعه میکروبیوم در خاک های مهارکننده بیماری های گیاهی

پیشرفت در تعیین توالی نسل جدید نقش به سزایی در مطالعات مربوط به اکولوژی جمعیت های میکروبی داشته است. این پیشرفت ها منجر به توسعه سریع در تحقیقات متاژنومیکس (تحلیل دی.ان.ای جمعیت های میکروبی بدون نیاز به کشت) شده است. بسیاری از ابزارهای آماری و محاسباتی و پایگاه های اطلاعاتی متاژنومیکس منجر به کشف حجم عظیمی از داده ها شده است. در این تحقیق علاوه بر مرور روش تعیین توالی نسل جدید، ابزارها و روش های بیوانفورماتیک مورد استفاده، موارد مطالعه شده درباره میکروبیوم خاک های بازدارنده و دست ورزی میکروبیوم جهت مقابله با بیماری های گیاهی ارایه و مورد بحث قرار می گیرند. خاک بازدارنده به خاکی گفته می شود که در آنها با وجود حضور عوامل بیمارگر شناخته شده، شیوع بیماری های گیاهی بسیار کمتر است. توجه به ساختار و شناسایی دقیق میکروبیوم این خاک ها بسیار مورد علاقه طرفداران کاهش مصرف سموم شیمیایی است.