Molecular diversity and phylogenetic analysis of Azerbaijan oaks (Quercus spp.) revealed by RAPD markers

Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:
Although Azerbaijan is a center of natural distribution and diversity of genus Quercus around the world, less published data can be found about PCR-based genetic diversity in prevalent oak accessions. The present study aims at finding molecular variation among the Quercus species using RAPD markers. In this study, genomic fingerprinting in five Azerbaijan oak species (Quercus spp.) was carried out using 10 RAPD markers. The result showed that a total of 113 DNA fragments were amplified, of those, 91 bands were polymorphic. The highest PIC, EMR and MI values was observed in the primers OPD-05, OPB-01 and OPB-03. The genetic similarity among the genotypes examined ranged from 0.333 to 0.818 with an average of 0.498. Species-specific DNA fragments were found in all species examined. Based on the cluster analysis using UPGMA method and Jaccard’s similarity index, all the examined oak species fell into three main groups and principal coordinate analysis (PCoA) supported the clustering result. High genetic diversity was found in the tested genetic germplasm of oak species. The results of this study would be very useful for oak improvement program.
Language:
English
Published:
Caspian Journal of Environmental Sciences, Volume:19 Issue: 3, Summer 2021
Pages:
457 to 468
magiran.com/p2314168  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 1,390,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!