بررسی ایمونوانفورماتیک لیزین های کدشده در باکتریوفاژهای موثر بر باکتری های جنس سودوموناس

گونه های باکتری متعلق به جنس سودوموناس از جمله باکتری های فرصت طلب بیماریزا هستند که بیشترین عامل عفونت های بیمارستانی را شامل می شود. با توجه به افزایش مقاومت این گروه از باکتری ها در برابر اکثر آنتی بیوتیک ها، فاژدرمانی و یا استفاده از لیزین فاژ یکی از جایگزین های درمان است.

شناسایی خانواده ی باکتریوفاژ موثر بر سودوموناس و ارزیابی مقدار ایمنی زایی لیزین ضد میکروبی این نوع فاژها می باشد.

در این تحقیق، با استفاده از پایگاه های داده بیوانفورماتیک و ایمنوانفورماتیک، ویژگی های فیزیکوشیمیایی خانواده های مختلف از فاژهای لیتیک موثر بر جنس سودوموناس، ساختار دوم وسوم لیزین های فاژ و میزان القای پاسخ ایمنی سلولی و هومورال میزبان، مورد مطالعه قرار گرفته است.

در بین خانواده های باکتریوفاژ موثر بر باکتری های از جنس سودوموناس، سه خانواده سیفوویریده، میووریده، پودوویریده با جمعیت بیش از 90 درصد، بیشترین فراوانی را نشان داد. همچنین توالی آمینواسیدی اندولیزین هریک از این سه خانواده، تنها در نیمی از کل اسید آمینه ها با امتیاز برابر نصف حدآستانه نرم افزار، دارای خاصیت انتی ژنی برای سلول های لنفوسیت B و تنها در 1 درصد اسید آمینه ها دارای میل اتصال قوی به مولکول های حامل MHC برای ارایه به سلول های T بودند. هیچ یک از لیزین های مورد مطالعه خاصیت انتی ژنی ندارند.

با توجه به نتایج بدست آمده از مقدار ایمنی زایی پروتئین های لیزین فاژ، آنها می توانند جایگزین آنتی بیوتیک باشند.