شناسایی microRNA (miRNA)ها و ژن های هدف آن ها در دو گونه Cichorium intybus و Cichorium endivia

miRNAها مجموعه ای از مولکول های کوچک RNA غیرکد کننده و درونزاد، با طول حدود 22 نوکلیوتید هستند که در تنظیم پس از رونویسی از طریق تخریب mRNAهای هدف و یا سرکوب ترجمه آن ها، نقش دارند. این مولکول ها به صورت تکاملی در قلمرو گیاهی حفاظت شده هستند؛ از این رو، با استفاده از ابزارها و روش های مقایسه ای می توان آن ها و همچنین ژن های هدف آن ها را پیشگویی کرد. در مطالعه حاضر، از روش های بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی و همچنین توالی های EST دو گونه کاسنی و miRNA موجود در بانک های اطلاعاتی، جهت شناسایی miRNAها و ژن های هدف آن ها در دو گونه C. intybus و C. endivia استفاده شد. این توالی ها در ابتدا Blastn شدند و در نهایت و پس از طی مراحل مختلف، چهار miRNA متعلق به خانواده های miR166، miR162، miR156 و miR393 شناسایی شد. همچنین تعداد زیادی ژن از جمله TIR1، ژنهای پروتئین های متصل شونده به پروموتر Squamusa و... به عنوان ژن های هدف این miRNAها شناسایی شدند. نتایج Real Time PCR نشان داد که بیان miR156 در برگ گونه C. endivia، بیشتر از گل آن و همچنین بالاتر از بیان این miRNA در برگ و گل گونه C. intybus است.