بررسی پایداری برخی ژن های مرجع در ارقام سبز و قرمز گیاه ریحان شیرین (Ocimum basilicum L.) تحت تنش های غیر زیستی

روش PCR در زمان واقعی یک تکنیک بسیار قدرتمند برای تجزیه و تحلیل بیان ژن در موجودات گوناگون است. با این حال، نرمال سازی داده های بیان ژن حاصل از این تکنیک و همچنین به دست آوردن نتایج قابل اعتماد تا حد زیادی به انتخاب ژن های مرجع مناسب و پایدار بستگی دارد. در این مطالعه، پایداری بیان شش ژن مرجع پرکاربرد (EF-1α ، 18S rRNA ، ACTIN ، β-Tubulin ، HSP و GAPDH) در ارقام سبز و قرمز ریحان شیرین تحت پنج تنش غیرزیستی (سرما، خشکی، گرما، شوری و تاریکی) مورد بررسی قرار گرفت. پایداری ژن های مرجع مذکور با استفاده از نرم افزارهای BestKeeper و NormFinder مورد تجزیه و تحلیل قرار داده شد. نتایج نشان داد که تمامی ژن های مرجع مورد بررسی دارای سطوح بیان متفاوتی در تنش های غیرزیستی در گیاه ریحان شیرین هستند. ژن های مرجع مورد بررسی از نظر میزان بیان تفاوت معنی داری بین ارقام سبز و قرمز نشان ندادند. بالاترین و پایین ترین مقادیر بیان ژن در ارقام سبز و قرمز ریحان شیرین تحت تنش های غیرزیستی به ترتیب برای ژن های مرجع β-Tubulin و18S rRNA محاسبه شد. نتایج بررسی با نرم افزار BestKeeper به ترتیب ژن های HSP و ACTIN را به عنوان ژن مرجع پایدار مشخص کرد. نرم افزار NormFinder ژن β-Tubulin را به عنوان ژن مرجع پایدار شناسایی کرد. رتبه بندی نهایی نتایج نرم افزار های BestKeeper و NormFinder ژن ACTIN را به عنوان پایدارترین ژن مرجع برای مطالعات بیان ژن در ارقام سبز و قرمز ریحان شیرین با استفاده از تکنیک PCR در زمان واقعی مشخص کرد.