A Novel and Rapid Isothermal Nucleic Acid Based Detection Assay of Vibrio cholerae by Polymerase Spiral Reaction (PSR) in Emergency Situations
Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:
Background

The purpose of this survey was to develop a novel and rapid isothermal nucleic acid based detection assay of Vibrio cholerae by polymerase spiral reaction (PSR) in emergency situations.

Methods

The current study was conducted in Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran in 2021. The conserved ctxA gene sequence of V. cholerae was used as a target of designed two pairs of primers. Amplification of nucleic acids performed under isothermal temperature of 65 oC in 55 min by using Bst DNA polymerase. PSR amplified products were real-time visualized under UV transilluminator and also on agarose gel electrophoresis.

Results

Seven non- V. cholerae bacteria were negative for detection, which indicated the specificity of PSR assay was 100%. A 10- fold serial dilution of V. cholerae genomic DNA was subjected to conventional polymerase chain reaction (PCR) and real-time PCR to compare their sensitivities with PSR. The detection limit of PSR was 3 × 10-5 ng/ μL within 60 min, which 100-fold higher than that of PCR (3 × 10-3 ng/μL), but the sensitivity of real-time PCR was found as same as it.

Conclusion

The PSR assay developed in this study can provide a simple, cost-effective, rapid, and precise diagnosis technique in endemic cholera outbreaks, especially in low-income with limited access provinces.

Language:
English
Published:
Iranian Journal of Public Health, Volume:51 Issue: 6, Jun 2022
Pages:
1364 - 1370
magiran.com/p2444412  
برخی از خدمات از جمله دانلود متن مقالات تنها به مشترکان مگیران ارایه می‌گردد. شما می‌توانید به یکی از روش‌های زیر مشترک شوید:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 700,000ريال می‌توانید 100 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • دسترسی به متن مقالات این پایگاه در قالب ارایه خدمات کتابخانه دیجیتال و با دریافت حق عضویت صورت می‌گیرد و مگیران بهایی برای هر مقاله تعیین نکرده و وجهی بابت آن دریافت نمی‌کند.
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.