مطالعه پویش کل ژنوم بر پایه مدل هاپلوتیپ و تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه-های ژنی مرتبط با سن اولین زایش در گاو نلور

در این پژوهش از رکوردهای فنوتیپی صفت سن اولین گوساله زایی گاوهای نلور برای مطالعه پویش ژنوم بر پایه تجزیه و تحلیل غنی سازی جهت شناسایی ساز و کار های زیستی استفاده شد. ارزیابی پویش کل ژنوم با بسته نرم افزاری GHap بر پایه مدل هاپلوتیپی در برنامه R انجام شد. تجزیه غنی سازی مجموعه های ژنی با بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی طبقات عملکردی و مسیرهای زیستی ژن های نزدیک در مناطق ژنومی کاندیدا انجام شد و در نهایت برای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی از پایگاه های GO، KEGG، DAVID و PANTHER استفاده شد. با تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی، مسیرهای هستی شناسی)ژن های کاندیدا(Estrogen metabolic process (HSD17B12)، Synapse organization (KIRREL3 و PPFIA2)، Sensory perception of mechanical stimulus (MYO3A و KCNMA1)، Protein tyrosine kinase activity (IGF1R)، cell-cell junction (FRMD4A)، GnRH signaling pathway (ADCY5) و Focal adhesion (PPP1R12A) شناسایی شدند. ژن های کاندیدا نقش مهمی در باروری، سن اولین گوساله زایی، بیوسنتز استروژن، نرخ آبستنی تلیسه ها، رشد ابتدایی جنین، سن بلوغ و تنظیم هموستازی گلوکز در تخمدان داشتند. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته های این پژوهش می تواند در انتخاب ژنتیکی گاو مفید باشد.