پویش کل ژنومی صفات مرتبط با وزن تخم مرغ در نژاد رد آیلند رد با استفاده از روش های بیزی
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
تحقیق حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی و ژن های کاندیدای مرتبط با صفات وزن تخم مرغ، بر اساس پویش ژنومی با استفاده از تراشه پربرون داد Affymetrix 600K chip در 1078 پرنده نسل یازدهم مرغ نژاد رد آیلند رد انجام شد. برای هر پرنده، هفت صفت شامل وزن تخم مرغ در اولین تخم گذاری، و وزن تخم مرغ در سنین 28، 36، 56، 66، 72 و 80 هفتگی جمع آوری شده بود. ارتباط بین هر یک از نشانگرهای چندشکل تک نوکلیوتیدی (SNP) و صفات مختلف با استفاده از روش های بیز A و B در نرم افزار GenSel نسخه 90/4 بررسی شد. در مجموع، نتایج این تحقیق نشان داد روش بیز A از نظر میزان واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده در مقایسه با روش بیز B دارای عملکرد بهتری بود. تعداد نه نشانگر حاصل از روش بیزA با بیشترین میزان واریانس ژنتیکی روی کروموزوم های شماره 1، 3، 5 و 20 قرار داشتند. SNP های شناسایی شده در نزدیکی 35 ژن قرار گرفته بودند که از این میان، ژن های کاندیدای BPIFB2، OCX36، CPT1A، TCF15، CECR2، SIAH3، FADS1، FADS2 و SGK1 عملکردهای مهمی را در فرآیند تولید تخم مرغ از راه تشکیل پروتیین آلبومین، سوخت و ساز اسیدهای چرب و تشکیل پوسته تخم مرغ داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان می دهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولا روش بیز A بر روش بیز B برتری دارد. علاوه بر این، با توجه به شناسایی مناطق ژنومی جدید و نقش کلیدی ژن های ذکر شده در ایجاد وزن تخم مرغ، می توان کارآیی روش بیز A برای پویش ژنومی در صفات وزن تخم مرغ را تایید کرد.
کلیدواژگان:
زبان:
فارسی
صفحات:
41 تا 53
لینک کوتاه:
https://www.magiran.com/p2522126