بررسی مسیرهای متابولیکی مرتبط با جایگاه صفات کمی مربوط به صفت مقاومت به انگل در ژنوم گوسفند با استفاده از رسم شبکه ژنی و هستی شناسی ژن
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
طی دهه های اخیر، پیشرفت در فن آوری نشانگرهای مبتنی بر DNA و در دسترس بودن داده های ژنومی مانند جایگاه صفات کمی و بررسی کاربرد ژن ها از طریق روش های بیوانفورماتیک نقش مهمی در درک پتانسیل ژنتیکی صفات مختلف داشته است. در این مطالعه QTL های مربوط به صفت مقاومت به انگل در گوسفند از طریق پایگاه داده AnimalQTL تهیه شد. سپس ژن های مربوط به هر QTL نیز از ژنوم مرجع گوسفند در پایگاه داده NCBI به دست آمد. در ادامه، به منظور درک ارتباط بین ژن های به دست آمده، شبکه های ژنی برای هر صفت با استفاده از نرم افزار Cytoscape_v3.8.0 ترسیم شد و نهایتا به منظور تفسیر شبکه های ژنی و بررسی هستی شناسی ژن ها از نرم افزار Cytoscape استفاده شد. نتایج این مطالعه نشان داد درمجموع 71 QTL برای صفت مقاومت به انگل وجود دارد که تحت کنترل 198 ژن می باشند. اکثرا این نشانگرها با استفاده از روش هایی چون مطالعه هم خوانی سراسر ژنوم (GWAS)، نقشه برداری وراثت پذیری منطقه ای (RHM) و یا با استفاده از چندشکلی های تک نوکلیوتیدی (SNP) نقشه یابی شده بودند. آنالیز هستی شناسی در این تحقیق 20 مسیر بیولوژیکی را نشان داد که چهار مسیر عمده سهم بیشتری داشتند و شامل: فرآیند متابولیک پیرووات، فرآوری آنتی ژن و عرضه آنتی ژن پپتید از طریق مولکول های اصلی سازگار بافتی کلاس I، مهاجرت سلول های عصبی و اتصال مولکول چسبندگی سلولی بودند. در این تحقیق برای اولین بار ژن های درگیر، هستی شناسی ژن ها، بررسی و یافتن مسیرهای متابولیکی مرتبط باصفت مقاومت به انگل در گونه گوسفند از طریق داده های QTL توصیف شد. با استفاده از روش و نتایج این تحقیق می توان ژن ها و نیز هستی شناسی را برای صفات مهم و اقتصادی در گوسفند و حتی سایر حیوانات اهلی مشخص و ارزیابی کرد.
کلیدواژگان:
هستی شناسی ، QTL ، نشانگر ، انگل
زبان:
فارسی
انتشار در:
صفحات:
83 تا 90
لینک کوتاه:
magiran.com/p2557989
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!