بررسی تنوع ژنتیکی فوزاریوم های بخش Elegans و Martiella-Ventricosum مرتبط با کدوییان با استفاده از نشانگرهای ISSR در استان تهران

هدف از این تحقیق شناسایی فوزاریوم های بخش های Elegans و Martiella-Ventricosum مرتبط با گیاهان تیره کدوییان در استان تهران و ارزیابی توانایی نشانگرهای ISSR در بررسی روابط خویشاوندی این گروه از فوزاریوم ها بود.
در این پژوهش تعداد پنج آغازگر (ATG)6، (AC)8YA، (AG)8G، (AG)8C و BHB(GA)7 که بر اساس مطالعات محققین مختلف، در تمایز نژادهای مختلف فوزاریوم، کارایی خوبی از خود نشان داده بودند، جهت انجام این آزمایش ها انتخاب شد. جدایه های قارچی پس از جداسازی و خالص سازی بر اساس خصوصیات ریخت شناسی و میکروسکوپی مورد شناسایی قرار گرفتند. جهت بررسی میزان کارایی نشانگرها در بروز چندشکلی، آماره های محتوای اطلاعات چندشکلی آغازگرها Polymorphism Information Content (PIC)، شاخص نشانگری  Marker Index (MI) و نسبت چندگانه موثرEffective Multiplex Ratio (EMR)  محاسبه شد. روابط داخل گونه های Fusarium با استفاده از نرم افزار NTSYS-PC V2.02 و ضریب تشابه SM و ترسیم دندوگرام به روش UPGMA مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.
از مجموع 96 جدایه قارچی، تعداد 48 جدایه به عنوان Fusarium solani، تعداد 25 جدایه به عنوان Fusarium oxysporum و تعداد 23 جدایه به عنوان Fusarium redolens تشخیص داده شدند. تمامی پنج آغازگر ISSR در طول آزمایشات PCR، باندهایی پایدار و قابل تکرار تولید کردند. از تکثیرهای ISSR مجموعا 408 باند به دست آمد. تعداد 130 نوع باند متفاوت تولید شد که از این تعداد، 83 باند پلی مورفیک و 47 باند مونومورفیک بود. . اندازه ی قطعات PCR تولید شده از 273 تا 2428 جفت باز متغیر بود. درصد چندشکلی به دست آمده از بیشترین (73 درصد) برای UBC-864 تا کمترین (56 درصد) برای UBC-808 متغیر بود. آغازگرهای (ATG)6 و BHB(GA)7 در تفکیک بخش های Elegans و Martiella-Ventricosum از همدیگر عملکرد بهتری داشتند. آغازگر UBC-808 ((AG)8C) با تولید 26 جایگاه ژنی بیشترین تولید باند را در جدایه های بخش Elegans و آغازگر UBC-885 (BHB(GA)7) با تولید 25 باند بیشترین تولید باند را در مورد جدایه های بخش Martiella-Ventricosum داشت.
نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگر ISSR یک نشانگر کارآمد جهت آشکارسازی روابط مولکولی بین توده ها و جدایه های قارچ فوزاریوم می باشد.