تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی ژنومی و پروتئومی دو نوع پروتئین شوک حرارتی (HSP90-a و HSP90-b) نژاد بز تالی و مقایسه آنها در هفت گونه حیوان اهلی

پروتئین های شوک حرارتی (HSPs) نقش مهمی در پاسخ به تنش های محیطی مختلف دارند. در این مطالعه، ویژگی های ژنومی و پروتئومی دو نوع HSP (HSP90-a و HSP90-b) در بز نژاد تالی(Tali goat breed) بعلاوه 7 گونه حیوان اهلی شامل گاو(B. taurus) ، گاومیش (B. bubalis)، گاو زبو (B. indicus)، بز(C. hircus)،گوسفند (O. aries) ، شتر تک کوهانه (C. dromedarius)، شتر دوکوهانه (C. bactrianus)با استفاده از ابزارهای مدلسازی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک، هم ترازی توالی چندگانه وسوییس مدل مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. با استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی جایگاه دو ژن برای گونه های موردیررسی تعیین گردید و مشخص شد جایگاه آنها در ژنوم شتر دوکوهانه تعیین نگردیده است. تعداد اگزون ها برای HSP90-a و HSP90-b در تمام گونه های موردبررسی بجز دو گونه شتر مشابه بود. مقایسه جهش های اتفاق افتاده در نژاد تالی بز با بز رفرنس نشان داد که هیچ کدام از جهش های بروزیافته منجر به تغییر اسیدآمینه نشده است. تجزیه و تحلیل Expasy نشان داد که HSP90-a و HSP90-b به ترتیب 733 و 724 اسید آمینه را برای همه گونه ها، بجز شتر دوکوهانه (649 اسیدآمینه برای توالی HSP90-a) کد می کنند. داده ها نشان داد که پروتئینHSP90-a در گاومیش و شتر تک کوهانه دارای یک اسیدآمینه متغیر و در شتر دوکوهانه دارای شش اسید آمینه متغیر است، در حالی که پروتئینHSP90-b تنها شتر تک کوهانه و دوکوهانه دارای دو اسیدآمینه متغیر می باشند. مطالعه حاضر می تواند در انتخاب ژن های هدف برای سازگاری مولکولی دام کمک کننده باشد.