ارزیابی کمی الگوی تظاهر و تجزیه in silico عناصر موجود در ناحیه راه انداز ژن انتقال دهنده کربوهیدرات در شرایط سرمادهی در گندم (Triticum aestivum L)

اغلب گیاهان برای کسب تحمل به یخ زدگی بایستی در معرض دماهای غیرمنجمدکننده قرار گیرند که به این فرآیند سازگاری به سرما اطلاق می شود. مطالعات نشان داده اند، بیان ژن های القاشونده با سرما در گیاهان، برای تحمل و سازگاری به سرما ضروری است. در این تحقیق الگوی بیان یکی از ژن های دارای بیان افتراقی در شرایط سرمادهی با نام SuT4 از گروه ژن های انتقال دهنده کربوهیدرات در رقم مقاوم به یخ زدگی نورستار و لاین حساس به یخ زدگی PI181268 گندم مورد بررسی قرار گرفت و به منظور مطالعه نحوه بیان ژن، بررسی های بیشتری روی ناحیه ''5 بالادست (راه انداز) ژن مذکور انجام شد. به منظور اعمال تیمار سرمادهی از دمای 4 درجه سانتی گراد روی گیاهچه های دو هفته ای استفاده گردید. نمونه برداری از گیاهان در زمان های پیش از شروع سرمادهی و پس از آن انجام شد. به منظور ارزیابی الگوی بیان ژن نیز از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز کمی در زمان واقعی (QRT-PCR) با استفاده از رنگ فلورسنت سایبرگرین استفاده شد. توالی ناحیه راه انداز ژن نیز با روش پیمایش ژنومی با استفاده از PCR و نرم افزارهای PlantCARE و PLACE جداسازی و مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج ارزیابی الگوی بیان ژن، بیانگر افزایش فعالیت بیان ژن از روزهای آغازین شروع سرمادهی در گیاهان تحت تیمار سرمادهی در مقایسه با گیاهان تیمارنشده بود. ولی در تمام طول آزمایش بیان ژن در رقم مقاوم بیشتر از رقم حساس بود. طول راه انداز این ژن در حدود 1980 جفت باز است که فاقد جعبه TATA و جعبه CAAT می باشد. راه انداز شامل عناصر تنظیم کننده همسوساز مفروض متعددی شامل عناصر پاسخ دهنده به اسیدآبسیزیک (ABRE)، عناصر پاسخ دهنده به کم آبی (DRE)، عناصر پاسخ دهنده به دمای پایین (LTRE) و بسیاری از عناصر تنظیم کننده دیگر می باشد. از آنجایی که بیان این ژن در هر دو رقم افزایش معنی داری نشان داده است، احتمال می رود این ژن فقط در تنظیمات سلولی گیاه در شرایط تنش نقش فعالی را ایفا نماید و یا دارای نقش دوگانه در کنترل تنش سرما و بیماری کپک برفی باشد.