بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جدایه های قارچ Macrophomina phaseolina با استفاده از نشانگر های مولکولی PCR-RFLP و RAPD

پوسیدگی ذغالی با عامل Macrophomina phaseolina یکی از بیمار‎ی های مهم اقتصادی می‎باشد که سبب کاهش عملکرد در گیاهان زراعی و باغی می‎شود. تعداد 33 جدایه از قارچ M. phaseolina بدست آمده از میزبان های متفاوت مانند سویا، خربزه، لوبیا، نخود، کاج، کوکب‎کوهی، کیوی، پنبه و کنجد جمع آوری شدند. شدت بیماریزایی جدایه ها روی بذور خربزه در شرایط آزمایشگاه ارزیابی شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی جدایه ها از نشانگرهای مولکولی RAPD و PCR-RFLP استفاده شد. تکثیر نواحی ITS با استفاده از آغازگر های ITS5 و LR5 تنها یک قطعه DNA 1600 جفت بازی را تولید کرد. نتایج نشان داد که با کاربرد نشانگر‎های RAPD تنوع ژنتیکی بین جدایه ها وجود دارد. داده های RAPD بر اساس پنج آغازگر تصادفی در 16 جدایه، درجه بالایی از چندشکلی را در جدایه های مختلف نشان دادند. دندروگرام به روش UPGMA که با داده های RAPD رسم شد، نه گروه در سطح شباهت 70 درصد ایجاد کرد. جدایه های که از مناطق مشابه بودند تمایل به گروه های نزدیک را داشته که نشان دادند که از نظر ژنتیکی به هم مرتبط اند.