بررسی خصوصیات مولکولی و آنالیز فیلوژنیتک ژن نوکلئوپروتئین ویروس آنفولانزای پرندگان (H9N2) ایران

بررسی مولکولی ژن نوکلئوپروتئین در ویروس های آنفلوانزای (H9N2) پرندگان و تعیین رابطه ژنیتکی آن با ویروس های سایر نقاط ایران و آسیا کل ژن نوکلئوپروتئین در 4 ویروس از جدایه های سال 1387 با روش RT-RCR تکثیر و تعیین توالی شد و برمبنای قطعه قابل تبدیل به پروتئین، درخت فیلوژنتیک رسم شد.
بررسی نوکلئوتیدهای ژن نوکلئوپروتئین نشان می دهد که هیچ گونه حذف یا اضافه شدنی در ژن نوکلئوپروتئین ویروس های مورد مطالعه در مقایسه با ویروس A/turkey/winconsin/66 که پروتوتیپ ویروس های H9N2 است، مشاهده نمی شود ولی جدایه های این مطالعه همانند دیگر سویه های قبلی ایران چندین جهش نقطه ای را در طول این ژن نشان می دهند. تشابه 7/96- 6/99 درصد بین اسیدهای آمینه ویروس های مورد مطالعه وجود دارد. میزان شباهت ژن نوکلئوپروتئین ویروس های مورد مطالعه با ویروس های H9N2 جدا شده از انسان درهنگ کنگ، برای ویروس A/Hk/2108/2003 5/91- 92 درصد و برای ویروس A/HK/1073/99 9/91- 3/92 است. براساس آنالیز فیلوژنیتیک، ژن نوکلئوپروتئین ویروس های آنفلوانزای (H9N2) در زیرشاخه ویروس های A/Quail/Hong Kong/G1/97 که به نظر می رسد دهنده شش ژن داخلی به ویروس آنفلوانزای فوق حاد H5N1 است، قرار می گیرد.
نتایج این تحقیق نشان می دهد در طول سال های شیوع ویروس آنفلوانزا ژن نوکلئوپروتیئن ویروس های آنفلوانزای (H9N2) کشور به خوبی حفظ شده است و تغییرات ویروس های آنفلوانزای H9N2 کشور احتمالا در اثر تجمع جهش های نقطه ای، رخ داده است.