تجزیه توالی 5 UTR در انسان، گوسفند و گیاه آرابیدوپسیس و بررسی علت عبور ماشین ریبوزوم از uAUG

توالی mRNA در یوکاریوت ها از5 Cap شروع شده و به پلی A ختم می شود و در بین آن ها توالی تنظیمی 5 UTR توالی ساختاری ORF و توالی تنظیمی دیگر به نام UTR 3 قرار می گیرند. در توالی 5 UTR در بسیاری از موجودات یک یا تعدادی ATG قبل از ATG شروع کننده ترجمه وجود دارد که ریبوزوم از آن ها عبور کرده تا به ATG شروع کننده ترجمه برسد. تجزیه محاسباتی uATG در منطقه 5 UTR در 80 ژن با محصول های متفاوت در انسان، گوسفند و گیاه آرابیدوپسیس مورد بررسی قرار گرفت که 66/26 درصد از 5 UTR زیر 100 جفت باز، 24 درصد بین 100 تا200 جفت باز، 36 درصد بین200 تا500 جفت باز، 8 درصد بین 500 تا 1000 جفت باز و 33/5 درصد بزرگتر از 1000 جفت باز بودند، نتایج نشان داد یکی از دلایل عبور ماشین ریبوزوم از uATG تفاوت در توالی های مجاور آن با ATG شروع کننده ترجمه بوده، که سیگنالی برای شناسایی ماشین ریبوزوم است. همچنین برای نشان دادن محدوده وسیع تری از منطقه اطرافuATG توالی های قبل و بعد از آن به صورت اسید آمینه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که بیش تر اسید آمینه های قبل و بعد از متیونین از نوع اسید آمینه های بازی، سرین، لوسین و آلانین بیش ترین تعداد را دارا بوده و از نظر حجم مولکولی نیز در جایگاه های اول، دوم و سوم قبل از ATG آغازین اسید آمینه های با حجم کم تر بیش ترین تعداد را داشتند، با این حال این روال در اسید آمینه های بعد ازATG آغازین نظم خاصی را نداشتند. به طورکلی اسیدهای آمینه قبل و بعد از ATG آغازگر قطبی بوده، اما اسیدهای بعد از uATG غیر قطبی و قبل از آن قطبی بودند.