به کار گیری روش High Resolution Melting در شناسایی چند شکلی های نوکلئوتیدی ژرم لاین ژن STK11 در مبتلایان به انواع سرطان های دستگاه گوارش

آنالیز HRM (High Resolution Melting) تکنیکی است که میزان کاهش فلورسنت را در طی فرایند شیب حرارتی ذوب DNA در اثر خروج رنگ اندازه گیری می نماید. ژن STK11 یکی از پروتئین های خانواده سرین- ترئونین کیناز سلولی را رمز می نماید که تنظیم کننده قطبیت سلولی بوده و هم چنین به عنوان پروتئین مهار کننده تومور عمل می نماید. موتاسیون های ژرم لاین در این ژن همراه با سندروم Peutz-Jeghers واستعداد ابتلاء به انواع نئوپلازی ها می باشند.

در این مطالعه تجربی، DNA ژنومی از 56 بیمار مبتلا به انواع سرطان های دستگاه گوارش استخراج گردید. سپس ما تغیرات نوکلئوتیدی را در تمام طول ژن با استفاده از تکنیک Real-time PCR و High(HRM) resolution melting بررسی نمودیم.

غربالگری نوکلئوتیدی با تکنیک HRM دو نوع SNP در اینترون های 6 و 7 در 10 بیمار را نشان داد. 4 بیماردارای تغییر نوکلئوتیدی C/T [cluster id/dsSNP/rs9282860] در اینترون 6 به صورت هموزیگوس و شش بیمار دارای تغییر نوکلئوتیدی C/G [cluster id/dsSNP/rs2075607] در اینترون 7 بصورت هتروزیگوس بودند. همچنین مقایسه نتایج HRM با نتایج تعیین توالی یک مطابقت 100 درصدی را نشان داد.

هر چند در این مطالعه موتاسیونی در بخش اگزون ژن مشاهده نگردید، به هر حال نتایج این مطالعه نشان می دهد غربالگری اولیه ژن STK11هم برای شناسایی تغییرات نوکلئوتیدی ناشناخته ژرم لاین و هم سوماتیک در مبتلایان به نئوپلازی به منظور تشخیص علت بیماری از طریق روش HRM به سهولت و با هزینه نسبتا اندک قابل اجراء می باشد.