بررسی تاثیر بیان رونوشت وابسته به نهفتگی ویروس هرپس سیمپلکس تیپ 1 بر مسیر TGF-β در سلول های نوروبلاستومای انسانی

ویروس هرپس سیمپلکس تیپ یک پس از آلوده کردن میزبان به صورت طبیعی در گانگلیون نورون تریژمینال به صورت خفته در می آید. در این وضعیت تنها رونوشتی که از ویروس در سلول قابل تشخیص است رونوشت وابسته به نهفتگی (LAT) است که این رونوشت microRNAهایی را تولید می کند که قادر است مسیرهای پیام رسانی در سلول را دستخوش تغییر نماید. یکی از مسیرهای کلیدی پیام رسانی سلول مسیر فاکتور رشد تومور (TGF-β) است. در این مسیر ژن Smad4 به عنوان یک پروتئین مهم رابط بین گیرنده های غشایی کینازهای سیتوپلاسمی و فاکتورهای رونویسی هسته ای است. این تحقیق با بررسی بیان microRNAهای ویروسی در سلول میزبان هدف گیری ژن Smad4 با این microRNAها را بررسی نموده است.
پس از ترانسفکت ژن LAT به داخل سلول های BE-2(c)، بیان microRNAهای وابسته به LAT در این سلول ها به کمک واکنش زنجیره ای پلیمراز کمی (Real-Time PCR) ارزیابی شد و به کمک روش های مبتنی بر بیوانفورماتیک امکان هدف گیری ژن Smad4 با این microRNAها نیز بررسی و در ادامه بیان ژن Smad4 و ژن های پایین دست آن به کمک واکنش زنجیره ای پلیمراز کمی مطالعه شد.
شواهد و نتایج نشان می دهد که رونوشت LAT در سلول میزبان تولید microRNAهایی می کند که تجزیه و تحلیل های بیوانفورماتیکی دو الگوریتم متفاوت گواهی بر هدف گیری ژن Smad4 توسط این microRNAها می دهد این در حالی است که نتایج واکنش زنجیره ای پلیمراز کمی نیز تاییدی بر این ادعاست.
نتایج مبتنی بر تجزیه و تحلیل های بیوانفورماتیک و بررسی بیان رونوشت Smad4 و پروتئین های پایین دستش همانند CyclinD، CDK2 و Myc نشان دهنده کنترل بیان این ژن توسط microRNAهای ویروس هرپس سیمپلکس تیپ یک است.