فهرست مطالب

بیولوژی کاربردی - سال چهارم شماره 1 (پیاپی 13، بهار 1393)

نشریه بیولوژی کاربردی
سال چهارم شماره 1 (پیاپی 13، بهار 1393)

  • تاریخ انتشار: 1393/02/01
  • تعداد عناوین: 6
|
  • محبوبه سلیمانی ساسانی*، محمدرضا ذوالفقاری، محمد سلیمانی صفحات 1-20

    استفاده فراوان از اکسی آنیون های تلوریوم مانندتلوریت در صنایع مختلف مانند نساجی، دباغی وآبکاری آلودگی محیطی را افزایش داده است که برای میکروارگانیسم ها و همچنین یوکاریوت ها بسیارسمی هستند. بررسی احیاء زیستی اکسی آنیون های متالوئیدتلوریت در باکتری های مقاوم در طبیعت می تواند ابزار باارزشی در بیوتکنولوژی جهت تشخیص میکروارگانیسم ها برای پاکسازی زیستی مناطق آلوده باشد .تعداد 84 سویه باکتری مقاوم به تلوریت از پساب صنایع جدا شد. تعیین MIC باکتری ها ازغلظت1/0 تا 26میلی مولار تلوریت پتاسیم در دمای 34درجه سانتیگراد بمدت 7روز با روش رقت در آگار انجام شد وسویه QWTmb9 جداشد که قادر به تحمل غلظت بسیار بالای 22 میلی مولار بود که تحمل این غلظت در مقایسه با آستانه تحمل باکتری ها نسبت به تلوریت قابل توجه است. به منظور بررسی میزان حذف تلوریت در سویه های برتر، روش کالریمتریک با استفاده از اسپکتروفتومتر و معرف DDTC (سدیم دی اتیل دی تیوکاربامات تری هیدرات، جذب 340 نانومتر) استفاده شد.اثر فاکتورهای مختلف بر رشد بهینه این سویه و حذف بیشتر اکسی آنیون مانند غلظت تلوریت، pH، دما، میزان هوادهی و غلظت-های مختلف نمک سدیم کلراید بررسی شد.به علت ارتباط مستقیم مقاومت به اکسی آنیون و مقاومت به آنتی بیوتیک در سویه های مقاوم،تست مقاومت به آنتی بیوتیک های مختلف انجام شد.باسیل گرم منفی QWTmb9 جداشده از پساب نساجی پتو، در غلظت 4/0 تلوریت، دمای35درجه، 5/7pH= و دورشیک100RPM ومیزان 170میلی مولار نمک سدیم کلراید بیشترین میزان حذف را در 24ساعت نشان داده است. این سویه مقاوم به آنتی بیوتیک های پنی سیلین، آمپی سیلین، ریفامپیسین، تتراسیکلین، کلرآمفنیکل، نئومایسین، کانامایسین و اریترومایسین بود.سویه گرم منفی QWTmb9 می تواند کاندیدای مناسبی جهت حذف اکسی آنیون سمی تلوریت در بیوتکنولوژی صنعتی مطرح گردد.

    کلیدواژگان: اکسی آنیون، تلوریت، تصفیه سازی زیستی، زیست پالایی، احیاء زیستی
  • منصوره نرگسیان، محسن زرگر*، محمود صفاری صفحات 21-33
    کلبسیلا پنومونیه یک پاتوژن فرصت طلب و یکی از عوامل شایع عفونت های بیمارستانی به شمار می آید که باعث ایجاد بیماری های مختلفی از جمله عفونت مجرای ادراری می شود. امروزه شیوع پاتوژن های مولد بتالاکتامازهای وسیع الطیف (ESBLs) مهم می باشد، به طوری که عفونت با این باکتری ها با افزایش شیوع بیماری ها و افزایش هزینه های درمانی مرتبط است. هدف از این تحقیق تعیین فراوانی ژن blaTEM در باکتری های کلبسیلا پنومونیه جدا شده از عفونت مجرای ادراری در قم می باشد. پس از شناسایی جدایه ها با استفاده از روش های کشت و بیوشیمیایی، 140 جدایه کلبسیلا پنومونیه شناسایی شد. حساسیت این جدایه ها نسبت به آنتی بیوتیک های مختلف با روش دیسک در آگار براساس استاندارد(CLSI, 2013) مورد بررسی گرفت. تست تاییدی فنوتیپی جدایه های ESBL انجام گرفت و سپس با استفاده از روش PCRوجود ژن blaTEM مورد ارزیابی قرار گرفت.از 300 نمونه ادراری،140 جدایه کلبسیلا پنومونیه شناسایی شد که 52 (14/37 %) جدایه به عنوان ESBL مثبت شناسایی شدند. بیشترین مقاومت مربوط به آنتی بیوتیک سفتازیدیم (50/72 %) بود. از بین 52 جدایه ESBL مثبت، تعداد 32 (53/61 %) جدایه حاوی ژن blaTEM بودند.نتایج این پژوهش شیوع قابل توجه ژن TEM را در جدایه های کلبسیلا پنومونیه در بیمارستان مورد بررسی را نشان داد. از این رو ضرورت توجه بیشتر به منظور پایش گسترده مقاومت آنتی بیوتیکی و پیشگیری از انتشار ژن های مقاومت دارویی در این باکتری ها احساس می گردد.
    کلیدواژگان: کلبسیلا پنومونیه، عفونت ادراری، ESBL، مقاومت آنتی بیوتیکی
  • محمد دخیلی*، مجتبی حاجی علیزاده صفحات 34-41
    مقدمه

    این مطالعه به منظور بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در بیماران مبتلا به UTI انجام شده است.

    مواد و روش کار

    این مطالعه به صورت یک بررسی توصیفی مقطعی انجام شده است. در این تحقیق با استفاده از مدارک و پرونده های موجود در بیمارستان گلپایگانی استان قم 741 نفر از 055 بیمار مبتال به UTI از آذرماه 98 تا اردیبهشت ماه 85 از نظر ارگانیسم دخیل در ایجاد بیماری و همچنین یافته های میکروبیولوژی و آنتی بیوگرام آنها مورد بررسی قرار گرفتند. فراوان ترین باکتری جدا شده 74.8 %Ecoli شایعترین باکتری می باشد.

    کلیدواژگان: مقاومت آنتی بیوتیکی، بیماران مراجعه کننده سرپایی و بستری، عفونت ادراری
  • حسین وحیدی نژاد*، احمد علی پوربابایی، محمدحسین رضویان صفحات 42-58

    متابولیت ها و آنزیم های ارکئا به دلیل ماهیت اکسترموفیلی و دوام و فعالیت مناسب انها در شرایط سخت صنعتی کاربرد وسیعی در صنایع مختلف دارند. با توجه به اهمیت انزیم های لیپولیتیک تحمل کننده شرایط شور و قلیائی در صنایع غذایی, دارویی و بهداشتی، این مطالعه انجام شده است. بنابراین هدف از این تحقیق, بررسی تاثیر نوع و درصد سوبسترا ، درصد نمک , pH , دما و زمان انکوباسیون بر رشد سویه آرکئا و همچنین بر روی تولید آنزیم لیپاز بوده است . بهینه شرایط برای رشد سویه و تولید آنزیم لیپاز با روش تاگوچی بترتیب در 8pH= و 8, درصد سوبسترا 0.5 % و 1.5 %، زمان 6 روز و 7 روز ، درصد نمک 19 و 25%، دمای cº 45 و cº35 در حضور روغن توئین و روغن بادام شیرین بعنوان تنها منبع کربن بدست آمدبا توجه به نتایج فوق می توان از این سویه در صنایع دباغی و استحصال روغن استفاده کرد.

    کلیدواژگان: لیپاز، هالو ارکئا، تاگوچی، بهینه سازی
  • نرگس داوود آبادی، مژگان سقازاده*، مجید ریاضی پور صفحات 59-68
    زمینه وهدف

    مبتلایان به گاستریت و دئودنیت مزمن بعلت استفاده از آنتی اسید به مدت طولانی ممکن است دچار کلونیزاسیون قارچ ها در دستگاه گوارش به ویژه معده شده باشند. شناسایی و حذف آن میتواند در درمان موترتر باشد. هدف از انجام این مطالعه تعیین میزان فراوانی کلونیزاسیون قارچ ها در بیماران مبتلا به گاستریت مزمن، دئودنیت با سابقه مصرف آنتی اسید و به مدت طولانی وجود دارد میباشد.

    مواد و روش

    این مطالعه توصیفی و مقطعی و اینده تگراست که بر روی 140بیمار مراجعه کننده به بیمارستانهای استان قم که مبتلا به اولسر پپتیک مزمن بودند طی 8ماه انجام شده است. پس از نمونه گیری از طریق اندوسکوپی نمونه ها نظرتحت آزمایش مستقیم میکروسکوپی ، کشت ، برش و رنگ آمیزی بافتی قرار گرفته و نتایج به دست آمده ثبت گردید. داده ها با استفاده از نرم افزار آماری SPSS و Excel و Chi-Square Tes مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.

    یافته ها

    از مجموع 140 بیمار مورد بررسی، تعداد 10مورد(1/7%) آلوده به قارچ مخمری بودند .که همگی مربوط به گروه کاندیداآلبیکنس بوده است. میزان آلودگی به قارچ در زنان (7.1%) و در مردان (7.3%) بود. بیشترین میزان آلودگی در گروه سنی 59-49 سال گزارش شد واز نظر آماری ارتباط معناداری بین سن افراد،سابقه مصرف ،آنتی اسید وهمچنین درد اپیگا ستر و ابتلا آنها به کاندیدیازیس معده وجود داشت. در این بررسی مشخص شد که در(70%)افرادی که دارای آلودگی قارچی بودند سابقه مصرف آنتی اسید را داشتند و اختلاف معنی داری با گروهی که سابقه مصرف دارو نداشتند وجود داشت.

    کلیدواژگان: کاندیدا، گاستریت، اولسرپپتیک مزمن، هلیکوباکتر پیلوری، دئودنیت مزمن
  • معصومه برجیان، مریم خوش سخن مظفر*، معصومه خسروی رینه صفحات 69-84

    کادمیوم یک فلز آلاینده محیطی است که در طبیعت منتشر می شود. منابع مختلف شامل صنایع، فاضلاب شهری و مواد سوختی غلظت این آلاینده را افزایش می دهند. تنش فلزات سنگین از رشد گیاهان ممانعت نموده و با ایجاد اختلال در تعادل بین تولید گونه های فعال اکسیزن وفعالیت های دفاعی انتی اکسیدانی گیاه ایجاد تنش اکسیداتیو می کند.این مطالعه به منظور تاثیر کادمیوم بر تغییرات انتی اکسیدانی انزیمهای سوپراکسیددیسموتاز ،کاتالاز، پلی فنول اکسیداز و میزان مالون دی الدهید همچنین میزان کلروفیل و انتوسیانین مورد بررسی قرار گرفت.نمونه های مورد نظر از بافت های برگ و ریشه گیاهان 30 روزه برداشت شدندوجهت سنجش پارامتر های بیوشیمیایی مورد استفاده قرار گرفت.نتایج نشان داد که کادمیوم در شرایط تنش اکسیداتیو بر روی سیستم آنتی اکسیدانی گیاه اثر مثبت داشته است .میزان فعالیت آنزیم های سوپراکسید دیسموتاز در اندام هوایی و کاتالاز در اندام هوایی و ریشه و همچنین میزان پراکسیداسیون لیپیدهای غشایی در اندام هوایی و ریشه افزایش معنی داری نشان داد. پلی فنل اکسیداز افزایش معنی داری در غلظت 5 کادمیوم و همچنین کاهش معنی داری در غلظت 5/0 کادمیوم در اندام هوایی نشان داد.همچنین میزان آنتوسیانین کل و کلروفیل a و b برگ ها با افزایش غلظت کاهش معنی داری نشان داد.

    کلیدواژگان: کادمیوم، تنش اکسیداتیو، براسیکا اولراسه
|
  • Mahboubeh Soleimani Sasani *, Mohammad Reza Zolfaghary, Mohammad Soleimani Pages 1-20

    The extensive use of tellurium oxyanions, such as Tellurite,in various industries such as textile, tanning and plating ,which are highly toxic to microorganisms and eukaryotes , has increased environmental pollution. Potential application of Tellurite oxyanions bioreduction in resistant bacteria in surroundings can be a valuable tool in biotechnology for Biological removing of tellurite from contaminated areas by microorganisms. 84 strains of resistant bacteria to tellurite was separated from industry's wastewater. Tellurite resistance activity was evaluated using the minimum inhibitory concentration (MIC)method, concentration 0/1 to26mM potassium tellurite at 34°C for 7 days by the agar dilution method and QWTmb9 was isolated which able to tolerate and reduction very high concentration of 22 mM. This tolerance to tellurite compared with the threshold concentration of other isolated bacteria is remarkable. In order to evaluate strain's Tellurite removal, colorimetric method using a spectrophotometer and DDTC reagent (sodium-diethyldithiocarbamatetri-hydrate, A340 nm) was used. The effects of various factors on the optimal growth and tellurite removal were investigated conditions Tellurite concentration, pH, temperature, aeration rate and different concentrations of NaCl. Due to the direct connection to oxyanions resistance and resistance to antibiotics, Antibiogram test was conducted. QWTmb9 isolated from wastewater of blanket textile, which maximum removal rates in 24h is in 0.4 concentrations of Tellurite, temperature 35°C, pH7.5 , 100RPM aeration and 170mM NaCl concentration. This strain is resistant to antibiotics penicillin, ampicillin, rifampin, tetracycline, chloramphenicol, neomycin, kanamycin and erythromycin. Gram-negative strains QWTmb9 can be a good candidate for elimination of toxic tellurite in industrial biotechnology.

    Keywords: oxyanion, Tellurite, biological purification, Bioremediation, bioreduction
  • Mohsen Zargar *, Mahmoud Saffari Pages 21-33
    Klebsiella is opportunistic pathogen and one of the most common causes of nosocomial infections this pathogen cause a variety of diseases including urinary tract infections.Today, the prevalence of ESBL-producing pathogens (ESBLS) is important, so these infections are associated with prevalence of diseases and increase healthcare costs associated. The aim of this study was to determine the prevalence of genes blaTEM isolates of Klebsiella pneumoniae isolated from urinary tract infections in Qom.After identification of isolates using culture and biochemical methods, 140 isolates of Klebsiella pneumoniae was identified. The sensitivity of the isolates to different antibiotics was performed by disk diffusion method based on the standard (CLSI2013). The phenotypic confirmatory test ESBL strains have done followed by PCR method to detection of blaTEM gene. Out of 300 samples, 140 isolate identified as Klebsiella pneumoniae that 52 (%37.14) isolates were ESBL. The most antibiotic resistance was related to ceftazidime (%50.72). Out of 52 ESBL positive strains, 32 (61.53%) strains were shown to have blaTEM gene.Considering the high prevalence of ESBL-producing isolates in hospitals, early detection and follow-up to prevent the spread of resistant isolates it all the more essential. It must also change in the pattern of antibiotics, hospital infection control measures are highly recommended.
    Keywords: Klebsiella pneumoniae, Urinary Tract Infection, ESBL, Antibiotic resistance
  • Hossein Vahidinejad *, Ahmadali Purbabaei, Mohammad Hossein Razavian Pages 42-58

    Archaea metabolites and enzymes widely used in various industries ,Because of the extremophiles nature and solidity And appropriate activities in the Hard industrial conditions. This study has been conducted According to the importance of lipolytic enzymes tolerance saline and alkaline conditions In the food, pharmaceutical and health Industry .Therefore Survey Influence Type and percent of substrate, percent of salt, pH, temperature and incubation time on the growth of Arkia strain Also Lipase Enzyme production was The aim of this study. Optimal conditions for strain growth and lipase enzyme production with a Taguchi method was concluded Respectively in the pH8 and 8, substrate 0.5 % & 1.5% ,time 6 and 7 day , salt 19% & 25% , temperature 45 ºC & 35 ºC in the presence of tween oil and sweet Almond oil as the sole carbon source.According to above results ,can use this strain in the tanning industry and extraction of oil.

    Keywords: lipase, Haloarchaea, Taguchi, optimization
  • Narges Davood Abadi, Mojgan Saghazadeh *, Majid Riazipour Pages 59-68
    Introduction

    Prolonged antiacid and antibiotic usage in peptic ulcer diseases mayPredispose fungi colonization in stomach., detect and eradication of it may prevent delayed treatment. In order to isolate and diagnosis of fungi infestions in patients with gastroduodenitis and gastric ulcer This study has been planned..

    Methods

    This is a prospective crossectional study. We studied140 biopsy specimens of patients with chronic peptic ulcer diseases (morthan12 month) referred to Qum province hospitals, during 8 month. The biopsies selected for 1: direct examination with KOH10%.2: culture of specimens3: tissue staining with H&E

    Results

    7.1% cases of yeasts were isolated in this investigation. Isolated yeastshave been identified as follows: 10 cases of C.albicance7.1% of The patients were male and the rest were female.

    Conclusion

    All the patients that had a positive history of long lasting antacid taking for gastric ulcer or gastritis. Candidacies must be investigated. duodenitis and gastric ulcer, who are refractory to classic therapies and also in patients Who have the chronic disease, fungi infestations must be roll out.

    Keywords: Candida, peptic ulcer, gastritis, duodeni
  • maryam khoshsokhan mozafar* Pages 69-84

    Cadmium is a heavy metal which accumulates in soil because of using chemical fertilizers & industrial stir. Heavy metals tension prevents the growth of plants due to mainly disturbance of the balance between production of reactive oxygen species and antioxidant defense and thereby causing oxidative stress. purpose of this study is determine the effect of cadmium on the activity of Superoxide dismutase, Polyphenol Oxydase, catalase and malondialdehyde also the content of Anthocyanin and chlorophyll a and b in were measured.The samples picked up in 30th day and used it for determination of biochemical parameters.the activity of SOD in aerobiosis bodies and CAT in aerobiosis bodies and in roots also Malondialdehyde has been significant increasing in shoot. The cadmium treatment have showed the meaningfull inclucreasing of PPO in 5cadmium and also the significant decreasing in 0.5 cadmium in aerobiosis bodies .Anthocyanin and a and b chlorophylls significant has decreased.

    Keywords: Masoumeh borjian, Maryam Khoshsokhan Mozaffar*, Masoumeh khosravireyneh