فهرست مطالب

نشریه بیولوژی کاربردی
سال ششم شماره 3 (پیاپی 23، پاییز 1395)

  • تاریخ انتشار: 1395/09/01
  • تعداد عناوین: 6
|
  • پرویز زبده*، زهرا محمودزاده صفحات 1-7

    پوست انسان یک بافت سه لایه ی غیرهمگن است که خواص گرمایی و فیزیکی هر یک از لایه های آن شامل اپیدرم ، درم و هیپودرم با یکدیگر تفاوت دارند . در فرایندهای درمانی ، تعیین شدت منبع مولد پرتوی لیزر ، بر اساس میزان حرارتی است که در هر یک از سه لایه ی مختلف پوست تولید می کند و کنترل شدت ، بهینه سازی و پیش بینی شکل تپ لیزر به هنگام برخورد با بافت ، حائز اهمیت است ، چرا که با تابش لیزر دمای بافت افزایش می یابد و عدم کنترل آن، باعث آسیب حرارتی به بافت می گردد. در این پژوهش با توجه به معادله ی عمومی سالیتون جهت احراز شکل مناسبی از تپ خروجی در انتهای محیط انتقال دهنده (فیبر نوری) با استفاده از روش های محاسبات عددی ، ضرایب معادله ی سالیتون شامل ضریب پاشندگی (B) ، ثابت انتشار (β) و ضریب اتلاف بهنجار شده (Γ) بدست آمده است . این ضرایب می تواند در تعیین ساختار محیط انتقال لیزر یعنی جنس ، ضریب شکست ، قطر ، طول و... بکار رود . لذا طراحان قادر به تعیین محیط سالیتونی که تپ ورودی با حفظ شکل و بدون تغییر از انتهای فیبر نوری خارج گردد ، می باشند . انعطاف پذیری فیبرهای اپتیکی ، دسترسی به اندامهای مختلف داخلی بدن ، جهت درمان را مقدور می سازد . بنظر می رسد تعیین ساختار بهینه ی اجزای محیط انتقال می تواند افق جدیدی در درمانهای کنترل شده با لیزر را ارائه دهد .

    کلیدواژگان: لیزر، ساختارفیبر نوری، بافت، طراحی محیط سالیتون، ضرایب معادله سالیتون
  • شهلا محمدگنجی*، بهروز طوفان، ناهید مسعودیان صفحات 9-16
    مقدمه

    سرطان کولورکتال سومین سرطان شایع درمردان ودومین سرطان شایع درزنان دنیاونیزدومین عامل مرگ ومیر ناشی ازمیان سرطان های دنیا می باشد.میزان شیوع آن درآسیا به سرعت روبه افزایش است طوریکه سالانه1.2میلیون نفربه سرطان کولورکتال مبتلاوبیش ازنیمی ازاین مبتلایان می میرند.در ایران نیز طی30سال اخیر میزان شیوع سرطان کولورکتال درمردان بیش از50%و در زنان کمی کمتر ازآن می باشدوسن مبتلایان اکثرا بالای50سال است.دراین مطالعه به منظور شناسایی ژنهای دخیل درایجادCRC،به بررسی بیان ژنBCL9 در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال پرداخته شد.

     

    موادو روش

    دراین تحقیق از40بیمار مبتلا به سرطان کولورکتال با تکمیل رضایتنامه وپرسشنامه کتبی، نمونه بافت تازه تهیه شد.سپس mRNAآنها استخراج وسنتزcDNAانجام شد.سپس باپرایمرهای اختصاصی برای ژنهایBCL9وB-actin،آزمایش نیمه کمیRT-PCRانجام شد.

    نتایج

    نتایج این مطالعه نشان داددرتمامی نمونه های توموری باند مربوط به ژنcl9 مشاهده می شود درحالیکه درنمونه های نرمال یا باندی مشاهده نشدویااینکه باندبسیارضعیفی قابل مشاهده بود.دراین مطالعه،21مرد(52.5%)و19 زن(47.5%) با میانگین سنی 10±56.1 سال شرکت کردند و 77.5% ایشان (31 نفر) بالاتر از 50 سال سن داشتند. از نظر فاکتور T ، 96.5% بیماران دارای T2 و T3 بودند (P=0.025) و از لحاظ فاکتور N، در 48.3% بیماران تهاجم به غدد لنفاوی مشاهده شد و 22.5% بیماران متاستاز را نشان دادند P=0.013)).

    بحث

    دراین مطالعه بیان ژنBCL9 در نمونه های توموری افزایش 3.5 برابری نسبت به نمونه های نرمال داشت. میتوان گفت ژنBCL9 می تواند ، بعنوان یکی از ژن های دخیل درسرطان کولورکتال عمل کند که با برخی از ژنها مثل TCF،LEF،B-catenin،Pygo برهمکنش دارد.

    کلیدواژگان: سرطان کولورکتال، Bcl9، RT-PCR
  • محسن شیخ حسن، مریم فرجی، مهدیه قیاثی* صفحات 17-23
    زمینه و هدف

    خون بند ناف به عنوان یک منبع مهم و اساسی برای دستیابی به سلول های بنیادی خونساز جهت درمان انواع بیماری های خونی استفاده شده است. احتمال ایجاد آلودگی باکتریایی در زمان خونگیری از بند ناف و نیز در طی فرآیندهایی مربوط به پردازش آن وجود دارد. هدف از این پژوهش، بررسی و تعیین منشا و نوع آلودگی باکتریایی نمونه های آلوده بانک خون بند ناف جهاد دانشگاهی قم می باشد.

    روش بررسی

    در این مطالعه، تعداد 370 واحد خون بند ناف جمع آوری شد و از نظر آلودگی باکتریایی مورد بررسی قرار گرفت. به منظور شناخت منشا آلودگی، از هر دو مرحله خونگیری و در نهایت قبل از ذخیره سازی، کشت باکتریایی تهیه و تعیین سویه شد. نتایج توسط نرم افزار spss آنالیز شد.

    یافته ها

    از مجموع 370 واحد خون بند ناف، تعداد 5 (1.35%) واحد آلودگی باکتریایی داشتند. تعداد 2 واحد (0.54%) آن در مرحله خون گیری از نظر کشت باکتریایی مثبت بودند و 3 مورد (0.81%) پس از انجام فرایند پردازش مثبت شده بودند.

    نتیجه گیری

    در این بررسی، میزان آلودگی باکتریایی 1.35% گزارش شد و در هر دو مرحله خون گیری و پردازش ایجاد شده بود و اکثریت این باکتری های جدا شده از نوع استافیلوکوک اورئوس و استافیلوکوک اپیدرمیدیس بودند، لذا با توجه به اهمیت و ارزش بالای سلول های بنیادی خون بند ناف و عوارض خطرناک ناشی از پیوند نمونه عفونی، تدوین برنامه هایی به منظور آموزش جهت اخذ استریل سازی نمونه، ضروری می باشد.

    کلیدواژگان: خون بند ناف، سلول های بنیادی خون ساز، آلودگی باکتریایی
  • رضا یاری*، محمدرضا مهرابی، نیلوفر قربان پور صفحات 25-32
    سابقه و هدف

    سویه های استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متیسیلین MRSA تهدیدی جدی در عفونتهای بیمارستانی به شمار می آیند. در تشخیص آنها روش PCR هزینه بر می باشد ولی روش انتشار دیسک، روشی ساده و ارزان بوده و دارای اختصاصیت بالایی می باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی روش دیسک دیفیوژن با استفاده از دیسک های سفوکسیتین و اگزاسیلین و مقایسه آن با روش PCR برای شناسایی ژن mecA بوده است.

    مواد و روش ها

    دراین مطالعه 150 ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس از نمونه بالینی پوست بیماران و کارکنان بیمارستان های شهر قم جمع آوری شد. سپس مقاومت به متی سیلین با روش های انتشار دیسک اگزاسیلین و سفوکسیتین تشخیص داده شد و با استفاده از روش PCR ژن mecA در جدایه های استافیلوکوکوس اورئوس شناسایی گردید و داده های دو روش مقایسه شدند.

    نتایج

    در روش دیسک دیفیوژن اگزاسیلین 33 درصد و در روش دیسک سفوکسیتین 28 درصد ایزوله ها مقاوم به متی سیلین بودند. روش دیسک اگزاسیلین در مقایسه با دیسک سفوکسیتین در 14 درصد دارای جواب کاذب (مقاومت کاذب به متی سیلین) در شناسایی سویه MRSA بوده است.

    نتیجه گیری

    در آزمایشگاه هایی که روش مولکولی به عنوان روش معمول در تشخیص MRSA استفاده نمی شود روش دیسک سفوکسیتین به عنوان روشی ساده و کم هزینه می تواند جانشینی مطلوب برای شناسایی ایزوله های مقاوم به متی سیلین باشد.

    کلیدواژگان: استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متیسیلین، سفوکسیتین، اگزاسیلین، mecA
  • محبوبه طاهرخانی*، مجید قربانی، مرضیه حسینی صفحات 33-41

    گیاه چشم خروس (Adonis aestivalis L.) متعلق به قبیله Ranunculeae و از تیره آلاله (Ranunculaceae) می باشد. وجود ترکیبات تترا ترپنوییدی، فنولی و گلیکوزیدهای قلبی در جنس Adonis گزارش شده است. مهم ترین مزیت این گیاه، کاربرد آن در درمان بیماری های ناشی از ضعف عضلات قلبی می باشد. همچنین در گذشته از این گیاه جهت درمان ناراحتی های جنسی استفاده می شده است. هدف از این مطالعه بررسی اثرات آنتی اکسیدانی، محتوای تام فنلی و فلاونوییدی عصاره متانولی 80% و عصاره اتیل استاتی این گیاه و مقایسه این دو عصاره با یکدیگر می باشد. محتوای تام فنولی عصاره های این گیاه نیز با استفاده از معرف فولین سیوکالتیو و گالیک اسید به عنوان استاندارد انجام شد. همچنین محتوای تام فلاونوییدی عصاره ها به روش اسپکتروفوتومتری و توسط کاتچین به عنوان استاندارد انجام شد. فعالیت آنتی اکسیدانی عصاره ها از روش آنتی اکسیدانی- احیا کنندگی فریک(FRAP) به دست آمد. محتوای تام فنولی (2/35 ± 607/26میلی گرم گالیک اسید بر گرم نمونه) و فلاونوئیدی (0/007 ± 97/81میلی گرم کاتچین در گرم نمونه) عصاره متانولی 80% بیشتر از عصاره اتیل استاتی به دست آمد. همچنین عصاره متانولی 80% دارای خاصیت آنتی اکسیدانی- احیاء کنندگی فریک (0/001 ± 3/985 میلی گرم گالیک اسید در گرم نمونه) بیشتری نسبت به عصاره اتیل استاتی (0/0004 ± 3/494 mg GAE/g) می باشد. نتایج نشان داد که عصاره متانولی 80% گیاه آدونیس از اثرات آنتی اکسیدانی و محتوای فنولی و فلاونوئیدی بالایی برخوردار بوده و به عنوان یک آنتی اکسیدان طبیعی مستلزم تحقیقات بیشتر و جامع تری می باشد.

    کلیدواژگان: Adonis aestivalis L، اثرات آنتی اکسیدانی، خانواده آلاله، محتوای فنول و فلاونویید
  • فاطمه ابراهیمی*، کامبیز روشنایی، فاطمه جمالو صفحات 43-50
    مقدمه و هدف

    با افزایش روز افزون مصرف گیاهان دارویی در درمان طبی، این شاخه از طب مکمل، جایگاه ویژه‏ای در درمان بیماری ها پیدا کرده است. این مطالعه به منظور مقایسه اثر عصاره ی هیدروالکلی گیاه کاسنی و داروی نیستاتین بر رشد قارچ کاندیداآلبیکنس جداشده از عفونت واژینیت در شرایط آزمایشگاهی و مقایسه آن با سوش استاندارد مورد بررسی قرارگرفت.

    مواد و روش ها:

    کاندیدا آلبیکنس در محیط سابرو دکستروز آگار حاوی کلرامفنیکل،کشت داده شد. سه سری 10 تایی از عصاره گیاه کاسنی و یک سری 10 تایی از دیسک آغشته به نیستاتین آماده شد. داخل هر پلیت، 1 دیسک عصاره گیاهی،1 دیسک نیستاتین به عنوان کنترل مثبت و یک دیسک متانول و 1 دیسک خالی به عنوان کنترل منفی گذاشته شد. بعد از 24 ساعت، میزان قطر هاله عدم رشد عصاره گیاه با میزان قطر هاله عدم رشد کنترل مثبت با آنالیز ANOVA مقایسه شد(p<0.05).

    یافته ها:

    میزان هاله عدم رشد نیستاتین (28) میلی متر با تفاوت معنی داری از کاسنی (17) میلی متر بیشتر بودو میزان هاله عدم رشد در ترکیب کاسنی و نیستاتین (45) میلی متر از کاسنی (17) میلی متر و نیستاتین (28) میلی متر بیشتر بود(p≤0.05).

    نتیجه گیری

    کاسنی تاثیرات ضد قارچی روی کاندیدا آلبیکنس را نشان داد اما تاثیر داروی نیستاتین بر روی عدم رشد سویه های کاندیدا آلبیکنس نسبت به کاسنی بیشتر بود و ترکیب دارو با عصاره بر روی عدم رشد سویه های کاندیدا آلبیکنس نسبت به نیستاتین بیشتر بود

    کلیدواژگان: تاثیر ضد قارچی، عصاره هیدروالکلی کاسنی، نیستاتین
|
  • Parviz Zobdeh *, Zahra Mahmoodzadeh Pages 1-7

    Human skin has three-layer non-homogeneous tissue. The thermal and physical properties of each layer including Epidermis, dermis, and hypodermis are different from each other. In treatment procedures, laser source intensity is adjusted based on thermal amount which produced in each skin layer; furthermore, intensity control, optimization, and prediction of pulse shape before the interaction with tissue, is very important. Since, during the Laser-tissue irradiation, tissue temperature increases, and so uncontrollable temperature enhancement causes thermal harm on tissue.In this research, the Solitons general equation was considered. In order to having a predefined Gaussian shape of output laser pulse at the end of the transfer medium (optical fiber), numerical calculation was used. Solitons coefficients equation, include the dispersive coefficient, propagation constant, and coefficient of normalized loss has been obtained. The results could be used in determination of laser transfer medium structure, such as kind of material, coefficient of refractive, diameter and longitude length and etc. Recognition of fiber medium helps designers to provide a medium in order to establish Soliton, which input pulses are gained as output at the end of the fiber without any changes in shape. Access to different internal human organs could be possible by flexibility of optical fibers, as an important advantage. It seems, optimum parts determination of transfer medium may provide new horizon in controlled laser therapy.

    Keywords: Laser, Optical fiber, tissue, Soliton medium design, Solitons coefficients equation
  • Shahla Mohammadganji* Pages 9-16
    Background

    Colorectal cancer(CRC)is the third most common cancer in men and the second most common cancer in women and the second leading cause of mortality among cancers in the world.Its incidence is increasing rapidly in Asia so about1.2 million people with CRC and more than half of these patients die.In Iran during the past30years the incidence of CRC in men is more than and it is mostly in people over50years.The aim of this study is investigation of gene expression of BCL9 in patients in order to identify genes involved in CRC.

    M&M

    In this study,the fresh tissue obtained from40patients with CRC after filling the consent form and questionnaire.The RNAextraction and cDNAsynthesis carried out.Then using specific primers for genes BCL9andB-actin,semi-quantitative RT-PCR experiments were performed.

    Findings

    The results showed that the band of Bcl9 genes in all tumor samples while in normal samples or the band was not observed or a very weak band was visible.21men(52.5%)and19women(47.5%)with mean age of10 ± 56.1 years participated in this study, while77.5% of them (31out of 40) were over 50years of age.In point of TandN Factors,96.5% were patients withT2&T3(P=0.025) and 48.3% of patients showed lymph node invasion and22.5% showed metastasis (P=0.013).

    Conclusion

    In this study BCL9 gene expression in tumor samples was increased 3.5-fold compared to normal samples. We suggest that BCL9 gene may act as one of the genes involved in colorectal cancer. Bcl9 interacts which with some genes, such as TCF, LEF, B-catenin and Pygo.

    Keywords: Bcl9, Colorectal cancer, RT-PCR
  • Mohsen Sheykhhasan, Maryam Faraji, Mahdieh Ghiasi * Pages 17-23
    Background and Objectives

    Umbilical cord blood has been used as a major source of hematopoietic stem cells to treat a variety of blood diseases. There is bacterial contamination risk during sampling from the umbilical cord and the processing related to it. The aim of this study was to determine the origin and type of bacterial contamination contaminated samples available in cord blood bank of the Academic Center for Education, Culture and Research (ACECR), Qom.

    Materials and Methods

    In this study, 370 units of cord blood were collected and examined for bacterial contamination. In order to identify the source of pollution, preparation and determination culture strains was carry out in both blood sampling and finally to storage levels. Results were analyzed by SPSS software.

    Results

    A total of 370 cord blood units, 5 units had bacterial contamination. The number of units in phase 2 was positive for bacterial cultures and 3 blood samples were also positive after processing.

    Conclusions

    In this study, the rates of bacterial infections were reported as 5% in both the blood sampling and the processing, and the majority of isolated bacteria were of Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis, however, due to the high value and importance of blood stem cell cord and the risk of septic transplantation, develop training programs in order to obtain a sterile preparation is necessary.

    Keywords: Umbilical cord blood, hematopoietic stem cells, bacterial contamination
  • Reza Yari *, Mohammad Reza Mehrabi, Niloufar Gorbanpoor Pages 25-32
    purpose

    Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA strains can pose a serious threat as nosocomial infections in various communities. In detection of these strains, PCR is an expensive method, whereas disk diffusion can provide a simple, inexpensive method with a high specificity. This study attempted to evaluate the disk diffusion method using cefoxitin and oxacillin discs compared with the PCR for detecting mecA gene.

    Materials and Methods

    In this study, 150 Staphylococcus aureus isolates were collected from clinical skin samples from the patients and personnel in Qom. Next, methicillin resistance was diagnosed using oxacillin and cefoxitin disk diffusion method. Using PCR, mecA gene was identified in Staphylococcus aureus isolates and the data of both disk diffusion method and PCR were compared.

    Findings

    Among the 150 isolates, 33% were methicillin-resistant in oxacillin disk diffusion, while 28% were methicillin-resistant in cefoxitin disc diffusion. The results revealed that oxacillin disk diffusion yielded false resistance to methicillin by 14% in detection of MRSA strains as compared to cefoxitin disk diffusion.

    Conclusions

    In laboratories where molecular methods are not employed as a routine procedure for MRSA detection, cefoxitin disk diffusion can provide a simple, low-cost and promising alternative technique for detection of methicillin-resistant isolates. Keywords:MRSA, Cefoxitin, Oxacillin, mecA

    Keywords: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, cefoxitin, oxacillin, mecA
  • Mahboubeh Taherkhani * Pages 33-41

    Adonis aestivalis L. belongs to the Ranunculoidae sub family of Ranunculaceae family. Up to now many reports has proven the presence of tetraterpenoids, phenolic compounds and cardiac glycoside in the genus Adonis. The most important mentioned effect of A. aestivalis is it's uses in the treatment of cardiac arrhythmia or sexual problems. The aim of this study was to evaluate the antioxidant activity, total phenolic and flavonoid content of the methanolic (%80) and ethyl acetate extract of A. aestivalis and compare them with each other. The total phenolic content (TPC) of the extracts of A. aestivalis was determined using the Folin ciocalteau assay at the presence of galic acid as standard and also the total flavonoid content (TFC) was determined using spectrophotometer methods at the presence of catechin as standard. Antioxidant activity of the extracts of A. aestivalis was determined upon Ferric-Reducing-Antioxidant power (FRAP) assay. The result showed that the total phenolic content of the methanolic extract was determined to be 607.26±2.35 mg GAE/g sample and total flavonoid content 97.81±0.007 mg catechin equivalent/g sample more than ethyl acetate extract (378.37±8.64 mg GAE/g sample, 89.73±0.003 mg catechin equivalent/g sample, respectively). Also the FRAP properties of the methanolic extract of A. aestivalis was determined to be 3.985±0.001 mg GAE/g sample more than ethyl acetate extract (3.494±0.0004) mg GAE/g sample. The results showed that the methanolic extract of A. aestivalis has high antioxidant activity, total phenolic and flavonoid content. Therefore further comprehensive investigation is required to determine the antioxidant properties of A. aestivalis.

    Keywords: Adonis aestivalis L, Antioxidant Activity, Ranunculaceae family, Total phenolic, flavonoid content
  • Kambiz Roshanaii, Fatemeh Jamallo Pages 43-50

    Background & Objective:

    With the increasing consumption of medical plants for medical treatment ,this topic of complementary medicine found a unique place. This study is the comparison of Cichorium intybusL. hydroalcoholic extract and Nystatin on the isolated Candida albicans from vaginal infection under in vitro conditions.

    Materials and Methods

    C.Albicans was cultured on sabouraud dexterose agar containing chloramphenicol. Three series of 10 plant Cichorium intybusL. extract and a series of 10 of the disk impregnated with nystatin was prepared. On each plate, one plant extract disc, one nystatin disc (as positive control) and one blank disc (as negative controls) were placed. The mean diameter of non-growth halo around each plant extract was compared with the mean diameter of non-growth halo of positive control discs after 24 hours. Data was analysed by ANOVA statistical test (p<0.05).

    Results

    The diameter of non-growth halo in nystation discs (28 mm) nystation were also more than Cichorium intybusL. discs(17 mm) (p<0.05). As well as the diameter of non-growth halo in Combination Cichorium intybusL and Nystatin discs(45 mm) was more than that for Cichorium intybusL discs(17 mm) and Nystatin discs(28 mm).

    Conclusion

    Cichorium intybusL exhibited antifungal effects on C. Albincans But the effect of Nystatin on the lack of growth of Candida Albicans strains was greater than that in Cichorium intybusL. and combining the drug with extract on the lack of growth of Candida Albicans strains was greater than that in Nystatin.

    Keywords: Antifungal effect, hydroalcoholic extract Cichorium intybusL, Nystatin