فهرست مطالب
فصلنامه زیست شناسی جانوری تجربی
سال دهم شماره 2 (پیاپی 38، پاییز 1400)
- تاریخ انتشار: 1400/09/03
- تعداد عناوین: 7
-
-
صفحات 11-19سرطان سینه در زنان در حدود 10 درصد از کل سرطان های موجود و 30 درصد از کل سرطان های درگیری را شامل می شود. بنابراین تشخیص زودهنگام آن نقش بسزایی در درمان خواهد داشت. ازآنجا که lncRNAها در بافت های سرطانی نسبت به بافت های نرمال بیان متغیر دارد، پتانسیل این مولکول ها را به عنوان بیومارکر برای تشخیص بیماری بالا می برد. همچنین تغییرات بیان lncRNAها در بیماران با نوع سابتایپ سرطان و نژاد استفاده از این مولکول ها را به عنوان بیومارکر برای تشخیص بیماری تشدید می کند. لذا هدف از این پژوهش، بررسی میزان بیان lncRNAهای GAS5، NEAT1 و SRA در نمونه های توموری مبتلا به سرطان و و افراد سالم بود. در این مطالعه از بافت توموری 22 فرد مبتلا به سرطان سینه و هم چنین 22 نمونه بافت سالم از افراد تحت نظارت مستقیم پاتولوژیست و با توجه به علایم بالینی و یافته های آزمایشگاهی از بیمارستان های شهر اصفهان جمع آوری شدند. پس از استخراج RNA از بافت توموری و نرمال، ساخت cDNA طبق روش RT-qPCR انجام شد. سطح بیان lncRNA ژن های GAS5، NEAT1 و SRA با استفاده از روش CT∆∆ محاسبه گردید. الگوی بیان ها با استفاده از نرم افزار Rest 2009 و SPSS نسخه 16 مورد تحلیل قرار گرفت. نتایج Real Time Reverse transcription-PCR نشان داد میانگین میزان بیان نسبی ژن در نمونه های توموری، برای lncRNAهای GAS5 و NEAT1 به طور معنی دار کمتر از نمونه های نرمال بود. ولی برای lncRNA SRA هیچ تغییر بیانی مشاهده نگردید.کلیدواژگان: بیان ژن، تکنیک RT-qPCR، سرطان سینه، lncRNA، GAS5، NEAT1، SRA
-
صفحات 21-30فیکوسیانین دارای خصوصیات درمانی بدون اثر سمیتی می باشد. هدف این مطالعه بررسی اثر آنتی اکسیدانی و ضد سرطانی فیکوسیانین روی سلول های CT-26 و HT-29 و در موش های Balb/c می باشد. این سلول ها با غلظت های µg/ml100-1 فیکوسیانین به مدت 48 ساعت تیمار شدند و اثرات ضد تکثیری آن با روش های مورفولوژیکی، رنگ آمیزی AO/PI و DAPI، تست MTT، میکروسکوپ فلورسانس و فلوسایتومتری بررسی شد. در فاز حیوانی موش ها سرطانی شده و به چهار گروه 1- کنترل، 2- تیمار با فیکوسیانین mg/kg50، 3- تیمار با سیلیمارین mg/kg100 و 4- سیس پلاتین mg/kg 3 تقسیم شدند. بعد از گذشت 4 هفته سطوح سرمی MDA، TAC، بیلی روبین، پروتئین تام، آلبومین و فعالیت آنزیم های GPX، CAT، SOX، AST، ALT، LDH سنجش شدند. فیکوسیانین اثرات ضد تکثیری قابل توجه با میزان µg/ml4/47=50IC برای رده CT-26 و µg/ml4/49=50 IC برای رده HT-29 نشان داد. نتایج نشان داد که فیکوسیانین به طور معنادار 001/0P<، میزان MDA را کاهش و میزان آنزیم های آنتی اکسیدانی را افزایش داد.کلیدواژگان: آنتی اکسیدان، فیکوسیانین، موش
-
صفحات 31-38
اوریکاز آنزیمی تترامر و کروی از گروه اکسیدوردوکتازها و فاقد کوفاکتوراست. تاکنون تحقیقات زیادی در مورد این آنزیم به دلیل کاربردهای آن در علم پزشکی به عنوان یک عامل درمانی و تشخیصی انجام شده است. اوریکاز تخریب اسید اوریک و تولید آلانتویین را کاتالیز می کند. قسمتی از کیت تشخیصی که برای سنجش غلظت اسید اوریک در خون استفاده می شود، اوریکاز است. در این تحقیق، تاثیر مایع یونی غیر ایمیدازولی تری اتیل آمونیوم مالیات بر عملکرد آنزیم اوریکاز بررسی شد. مایعات یونی نمک هایی با خواص مهمی مانند پایداری حرارتی زیاد، قدرت حلالیت زیاد و قطبیت زیاد هستند. برخی ازمایعات یونی به عنوان تثبیت کننده برای ذخیره طولانی مدت پروتئین ها استفاده می شوند و ماندگاری پروتئین هایی مانند پروتئین های درمانی یا صنعتی را افزایش می دهند. در این مطالعه، آنزیم را با غلظت های مختلف مایع یونی تری اتیل آمونیوم مالیات تیمار کردیم. درصد حجمی این مایع یونی 1%، 2%، 5%، 10% و 15% می باشد. نتایج نشان می دهد که تری اتیل آمونیوم مالیات تاثیر وابسته به غلظت بر فعالیت آنزیم اوریکاز دارد. استفاده از مایع یونی تری اتیل آمونیوم مالیات با غلظت 5 درصد باعث افزایش فعالیت کاتالیزوری آنزیم در مقایسه با آنزیم تیمارنشده می شود. همچنین دما و pH بهینه برای فعالیت آنزیم به واسطه تیمار با مایع یونی مذکور تغییر می کند. بروز تغییرات در میانکنش های داخل ساختاری آنزیم از جمله تغییر در پیوندهای هیدروژنی، الکترواستاتیک و فعل و انفعالات واندروالس و در نتیجه تغییرات ساختاری آنزیم باعث افزایش فعالیت اوریکاز و بهبود کارایی کاتالیزوری و همچنین تغییر دما و pH بهینه آنزیم می شود. درضمن با توجه به نتایج، اوریکاز تیمارشده در pHهای قلیایی فعالیت بیشتری نسبت به اوریکازآزاد دارد و در برابر pHهای قلیایی مقاومت نشان می دهد و هیچ گونه کاهش فعالیت که ناشی از به هم ریختگی ساختار آنزیم و دناتوراسیون است نشان نمی دهد. این نتیجه برای استفاده از تری اتیل آمونیوم مالیات درزمینه هایی که باید یوریکاز در pH های قلیایی استفاده شود کاربردی است.
کلیدواژگان: اوریکاز، تاثیر، مایع یونی -
صفحات 39-54تالاب بین المللی انزلی یکی از زیستگاه های مهم برای پرندگان در ایران و منطقه خزری است، اما تاکنون مطالعه جامعی در خصوص شناسایی و تعیین وضعیت پرندگان آن انجام نشده است. در این پژوهش با هدف شناسایی غنای گونه ای و تغییرات جمعیت پرندگان از دی ماه 1393 تا آذرماه 1394 همه بخش های تالاب انزلی هر ماه حداقل یک بار بررسی شد. در مجموع 243 پرنده شامل 51 گونه آبزی، 61 گونه کنارآبزی و 131 گونه خشک زی شناسایی شد. به ترتیب بیشترین و کمترین تعداد گونه در ماه های فروردین و خرداد و بیشترین و کمترین جمعیت در ماه های دی (134167 فرد) و اردیبهشت (6979 فرد) شناسایی و شمارش شد. بیش از 70 درصد پرندگان مهاجر عبوری و زمستانه بودند. 26 درصد پرندگان در فهرست گونه های در خطر انقراض جهانی، در معرض تهدید جهانی و حمایت شده قرار داشتند. نه گونه به نام های خروس کولی شکم سیاه در فهرست بحرانی، اردک سرسفید، بالابان و عقاب صحرایی در فهرست در خطر انقراض و اردک سرحنایی، کشیم گوش دار، عقاب تالابی، عقاب شاهی و قمری معمولی در طبقه آسیب پذیر IUCN بودند. جوجه آوری اردک بلوطی، سسک ساوی، یلوه کوچک و پرستوی دریایی کوچک برای نخستین بار در این تالاب شناسایی شد. بیش از یک درصد جمعیت جهانی پرستوی دریایی تیره، خوتکا، اردک سرسبز، اردک ارده ای، قوی فریادکش، باکلان کوچک، باکلان بزرگ و پلیکان خاکستری در این تالاب شمارش شد. این بررسی نشان داد تالاب انزلی با وجود قرارگیری در فهرست مونترو همچنان یکی از زیستگاه های مهم پرندگان آبزی است و تمامی معیارهای تالاب بین المللی از حیث پرندگان آبزی را دارد. بنابراین حفظ کیفیت و کمیت تالاب و خرد زیستگاه های آن ضروری می باشد.کلیدواژگان: انزلی، پرندگان، تالاب، غنای گونه ای، جمعیت
-
صفحات 55-66
ظهور پزشکی شخص محور با تکیه بر تکنیکهای مولکولی، از جمله ترادفیابی نسل بعدی، درک ما را از محرکهای موثر بر بیماریهای پیچیده، از جمله سرطان افزایش داده است. در بسیاری از موارد به دلیل پیچیدگی سرطان، تصمیمگیری فقط بر اساس اقدامات بالینی یا شواهد آزمایشگاهی برای پزشکان و زیستشناسان امری دشوار است. بنابراین، رویکرد پزشکی شخصی وارد عمل میشود و دادههای انبوه و ارزشمندی را در اختیار متخصصان قرار می دهد. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل داده ها با ابزارهای بیوانفورماتیک، افق جدیدی را در روند پیش آگهی و غربالگری افراد در معرض خطر گشوده است. این امر باعث پیشرفتهای چشمگیر اخیر در فناوری تشخیص شده و درمانهای هدفمند را بهبود بخشیده است. در مطالعه حاضر، نمونه بایگانی شده از بافت تثبیت شده با فرمالین و جاسازی شده در پارافین مربوط به یک بیمار زن ایرانی مبتلا به سرطان پستان تهاجمی به طور موردی بررسی شد. به این ترتیب که پس از استخراج و خالصسازی DNA ، ترادفیابی کل اگزوم انجام شد و دادههای جهش مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. اطلاعات به دست آمده می تواند به غنی سازی پایگاه های داده ژنوم ایرانی کمک کند. در پرتو این پژوهش و با مطالعه نمونه های ایرانی بیشتر، ما میتوانیم یک نقشه راه بهینه برای زیستشناسان پژوهشگر در حیطه سرطان و آنکولوژیستهای دقیق ارایه دهیم تا امید به زندگی بیماران مبتلا به سرطان پستان افزایش یابد.
کلیدواژگان: بیوانفورماتیک، پزشکی شخص محور، ترادفیابی نسل بعدی، دادههای جهش، کارسینومای پستان تهاجمی شده -
صفحات 67-76
پارکینسون یک اختلال عصبی تخریب کننده مزمن و شایع است. در این مطالعه اثرات تمرین شنا و مکمل دهی اولیورپین بر استرس اکسیداتیو بافت مغزی در مدل تجربی بیماری پارکینسون بررسی گردید. در این مطالعه تجربی، 40 سر موش صحرایی نر بالغ نژاد ویستار، انتخاب و به پنج گروه شامل گروه کنترل، گروه پارکینسون، تمرین شنا، مصرف اولیوروپین، تمرین شنا همراه با مصرف اولیوروپین تقسیم شدند. گروه ها به مدت چهار هفته (پنج جلسه در هفته و هر جلسه 30 دقیقه) شنای اجباری کردند و گروه های 4 و 5 به مدت چهار هفته، روزانه اولیوروپین را به میزان 20 میلی گرم به ازای هر کیلوگرم وزن بدن، به صورت اورال دریافت کردند. سطوح سرمی متغیرها با استفاده از روش تیوباربیتوریک اسید مورد ارزیابی قرار گرفت. داده ها با استفاده ازآزمون های آماری واریانس یک طرفه و تعقیبی توکی تجزیه و تحلیل شدند (05/0≥p). در این مطالعه، اولیوروپین- پارکینسون، تمرین شنا- پارکینسون و تمرین شنا همراه با مصرف اولیوروپین- پارکینسون، کاهش معنی داری بر سطح مالون دی آلدهید، افزایش معنی داری بر میزان فعالیت گلوتاتیون پراکسیداز و افزایش معنی داری بر میزان تیول در مقایسه با گروه پارکینسونی داشتند (001/0<p). تمرین شنا همراه با مصرف اولیوروپین می تواند دفاع آنتی اکسیدانی را بهبود بخشیده و پراکسیداسیون لیپیدی را کاهش دهد. بنابراین، احتمالا این اثر تعاملی بتواند شیوه درمانی موثر و پیشگیرانه ای برای جلوگیری از بیماری های مرتبط با استرس اکسایشی باشد.
کلیدواژگان: استرس اکسیداتیو، اولئوروپین، پارکینسون، تمرین شنا، موش صحرایی -
صفحات 77-92زردپرماهیان Luciobarbus یکی از جنس های مهم و اقتصادی خانواده کپورماهیان (Cyprinidae) است که اغلب گونه های آن از لحاظ ریخت ظاهری شبیه به یکدیگر هستند و این امر باعث دشواری شناسایی گونه های این جنس شده است. در پژوهش حاضر نمونه برداری در طی سال های 1398-1390 از هفت حوضه آبریز کاسپین، نمک، ارومیه، هریرود، تیگریس، پرسیس و هرمز با استفاده از تور، الکتروفیشر و قلاب به عمل آمد. در مجموع حضور نه گونه L. barbulus، L. brachycephalus،L. capito ، L. conocephalus، L. esocinus ،L. kersin ، L. mursa، L. subquincunciatus وL. xanthopterus از 519 ایستگاه در آب های داخلی ایران تایید شد. همچنین برای اعضای قابل تایید این جنس در ایران، کلید شناسایی ارایه و نقشه پراکنش آن ها تهیه شد. همچنین پس از بررسی وضعیت حفاظتی اعضای این جنس، پیشنهاد گردید یک برنامه مدون، اصولی و علمی برای شناسایی جمعیت ها، مکان های مناسب جهت تکثیر و رهاسازی لاروهای حاصل از تکثیر در اسارت در نظر گرفته شود.کلیدواژگان: ایران، حفاظت، حوضه آبریز، سس ماهیان، ویژگی های ریختی
-
Pages 11-19Breast cancer accounts for about 10% of all cancers in the world and accounts for 30% of all cancers in women. Therefore, its early detection will play an important role in its treatment. Because lncRNAs are expressed differently in cancerous tissues than in normal tissues, they increase the potential of these molecules as biomarkers for disease diagnosis. Also, changes in the expression of lncRNAs in patients with different types of cancer subtypes and different races intensify the importance of using these molecules as biomarkers for disease diagnosis. Therefore, the aim of this study was to investigate the expression of GAS5, NEAT1 and SRA lncRNAs in cancer specimens with cancer and in healthy individuals. In this study, from the tumor tissue of 22 patients with breast cancer and also 22 samples of healthy tissue from individuals under the direct supervision of a pathologist and according to clinical signs and laboratory findings were collected from hospitals in Isfahan. After RNA extraction from tumor and normal tissue, cDNA was fabricated according to RT-qPCR method. The lncRNA expression level of GAS5, NEAT1 and SRA genes was calculated by ∆∆CT method. The expression pattern was analyzed using Rest 2009 software as well as SPSS version 16. Real Time Reverse transcription-PCR results showed that the mean relative gene expression in tumor samples was significantly lower for GAS5 and NEAT1 lncRNAs than normal samples. But no expression change was observed for lncRNA SRA.Keywords: breast cancer, GAS5, Gene expression, lncRNA, NEAT1, Technique RT-qPCR, SRA
-
Pages 21-30C-Phycocyanin has been demonstrated to have a series of pharmacological attributes without leading to toxicity. The aim of this study was to evaluate potential of anti-cancer and antioxidant C-PC on CT-26 and HT-29 cell lines in vitro and in Balb/c mice. The CT-26 and HT-29 cells were treated with various concentrations of C-PC extract (1-100µg/ml) in 48hr. Antiproliferative effect was measured by morphological observations, DAPI and AO/PI Staining, MTT assay, fluorescence microscope and Flow cytometry assays. Antioxidant effects of C-PC on CT-26 tumor cells transplanted in Balb/c mice was also checked out invivo. Male Balb/c mice were tested in four groups.group1 was considered as control. Group 2 were fed by C-Phycocyanin (50mg/kg) daily. In groups 2-4, cisplatin (3mg/kg) was injected, and group 3 silymarin (100mg/kg) was injected daily. Finally serum levels of MDA, TAC, and Total Billirubin, Total Protein and Albumin and activities of GPX, Catalase, SOD, ALT, AST, and LDH were assayed. C-PC showed considerable anti-proliferative effect on CT-26 and HT-29 tumor cell lines with IC50 =47.4 µg/ml and IC50=49.4 µg/ml respectively. In addition, C-PC because of its antioxidant potential, significantly (P<0/001), decreased MDA and increased levels of liver antioxidant enzymes.Keywords: antioxidant, Mice, Phycocyanin
-
Pages 31-38
Urate oxidase or uricase (UOX) (EC 1.7.3.3) is an globular tetramer oxidoreductase enzyme which lacks cofactor. Much research on this enzyme has been done so far due to its biomedical applications as a therapeutic and diagnostic agent. Urate oxidase catalyzes uric acid degradation and produces allantoin. An imbalance in the excretion of uric acid causes the hyperuricemia. Part of a clinically important diagnostic kit used to measure the concentration of uric acid in the blood is the enzyme uricase. In this research, efforts are made to investigate the effect of triethylammonium maleate (TEAM) ionic liquid on the function of urate oxidase (UOX). Ionic liquids are salts with important properties like high thermal stability, high solvating capacity and high polarity. These salts have been considered in biochemical and biomedical fields. They can also be utilized as a stabilizer for long-term protein storage and they can extend the shelf life of some proteins such as therapeutic or industrial proteins. In this study, we treated the enzyme in different concentrations of triethylammonium maleate ionic liquid. The volume percentages of TEAM in the solvent phase are 1%, 2%, 5%, 10% and 15%. The results indicate that TEAM has a concentration-dependent effect on the activity of UOX enzyme. The use of 5% TEAM ionic liquid increased the enzymatic activity in comparison to untreated enzyme. We concluded that this ionic liquid was able to alter the structure of the uricase in a way that increased the activity and improve its catalytic efficiency of uricase.
Keywords: Effect, ionic liquid, uricase -
Pages 39-54Anzali International Wetland is one of the most important bird sites in Iran and the region, but so far no comprehensive study has been conducted to determine the diversity and status of its birds. In this study, all parts of the wetland were monitored monthly from January 2014 to December 2015 with the aim of identifying and surveying the status of the birds in the wetland. A total of 243 bird species including 112 waterbirds and 131 terrestrial species were identified. The highest number of species was recorded in April and the lowest number in June, and more than 70% of the birds in the wetland were passage and wintering migrants. The highest number of birds was counted in January (134,167 individuals) and the lowest number in May (6,979 individuals). Twenty-six percent of the birds were globally threatened, near-threatened and nationally protected in Iran, and nine species of were named: Sociable Lapwing in the critically endangered, White-headed Duck, Saker Falcon and Steppe Eagle in the endangered, and Common Pochard, Horned Grebe, Greater Spotted Eagle, Eastern Imperial Eagle and European Turtle Dove in the vulnerable category. Breeding of Ferruginous Duck, Savi’s Warbler, Little Crake and Little Tern was recorded for the first time in this wetland and more than one percent of the global population of Whiskered Tern, Teal, Mallard, Gadwall, Whooper Swan, Pygmy Cormorant, Great cormorant and Dalmatian Pelican occur in this wetland. This study shows that Anzali wetland, despite being included in the Ramsar Convention’s Montreux Record of listed sites experiencing change in ecological character, is still one of the most important sites for birds, especially waterbirds, and still satisfies all the waterbird-related criteria of the Ramsar Convention. Therefore, maintaining the quality and extent of the wetland and its valuable habitats is essential.Keywords: Anzali, Birds, density, Species richness, Wetland
-
Pages 55-66
The emergence of personalized medicine based on molecular techniques, such as next-generation sequencing, has increased our understanding of drivers of complex diseases, including cancers. In many cases due to the complexity of cancer, it is difficult for human physicians and biologists to make decisions on the basis solely of clinical practice or laboratory evidence. Thus, the personalized medicine approach comes into play and provides large volumes and valuable data for experts. Further, data analysis with bioinformatic tools has opened a new horizon in the process of prognosis and screening of in risk individuals. It has caused significant recent advances in diagnostic technology and improved targeted treatments. In the present study, archived formalin-fixed paraffin-embedded tissue from an Iranian female patient with invasive breast carcinoma was investigated. In this way, after DNA extraction and purification, the whole exome was sequenced and the mutation data were analyzed. Obtained information could help to the enrichment of the Iranian genome databases. In the light of this research and by studying other Iranian samples, we can provide an optimized roadmap for precision oncologists to increase the life expectancy of breast cancer patients.
Keywords: Bioinformatics, Invasive breast carcinoma, Mutation data, Next-generation sequencing, Personalized medicine -
Pages 67-76
Parkinson is a chronic and widespread neurodegenerative disorder. In this study, the effects of swimming exercise and oleuropein supplementation on oxidative stress of brain tissue in experimental model of Parkinson's disease in rat were investigated. In this experimental study, 40 adult male Wistar rats were selected and divided into five groups including: control group, Parkinson's group, swimming exercise, oleuropein consumption, swimming exercise with oleuropein consumption. The groups were forced to swim for 4 weeks (five sessions per week for 30 minutes each session) and groups 4 and 5 received 20 mg of oleuropein daily per kilogram of body weight orally for 4 weeks. Serum levels of the variables were evaluated using the thiobarbituric acid method. Data were analyzed using one-way ANOVA and Tukey post hoc tests (p≥0.05). In this study, oleuropein-Parkinson, swimming exercise-Parkinson, and swimming exercise with oleuropein-Parkinson consumption significantly decreased Malondialdehyde levels, significantly increased glutathione peroxidase activity and thiol compared to Parkinson's group (P<0/001). Swimming exercise with oleuropein consumption can improve antioxidant defense and decrease lipid peroxidation. Therefore, this interactive effect may necessitate more therapeutic and preventive treatment to prevent oxidative stress-related diseases.
Keywords: Oleuropein, oxidative stress, Parkinson, Rat, Swimming Exercise -
Pages 77-92Luciobarbus is one of the most important and economical genus of the Cyprinidae family, most of them are similar in appearance, making it difficult to identify species. In the present study, 519 stations in seven basins, including: Caspian, Namak, Urmia, Hari, Tigris, Persis and Hormuz basins were sampled using nets, electro fisher and jigging, during the years 2011-2011. In total, the presence of nine species including L. barbulus, L. brachycephalus, L. capito, L. conocephalus, L. esocinus, L. kersin, L. mursa, L. subquincunciatus and L. xanthopterus was confirmed in Iran's inland waters. For the approved members of this genus in Iran, the identification key were presented and their distribution map were prepared. Also, after examining the conservation status of the members of this genus, it was suggested that a well-codified, principled and scientific program be considered to identify populations, suitable places for reproduction and release of larvae from reproduction in captivity.Keywords: Barbels, Basin, Conservation, Iran, Morphological characters
©2000-2024 magiran.com All Rights Reserved.