فصلنامه تازه های بیوتکنولوژی سلولی مولکولی
پیاپی 6 (بهار 1391)

RNAi) که ازسوی siRNA) Small interfering RNA) میانجیگری می شود، ابزار قدرتمندی برای مهار بیان ژن در رده های مختلف سلولی است. siRNA ها علاوه بر عمل خاموش کردن ژن در القای سایتوکاین های پیش التهابی (Pro-inflammatory) و اینترفرون نوع I نیز دخالت دارند. گیرنده های ایمنی شناسایی کننده RNA شامل (Toll-like receptor (TLR ها و پروتئین های سیتوزولی شناساگر RNA مانند: PKR1، RIG-I 2، MDA-5 3، 2''- 5''OAS4، IRF5، NF-κB6 می باشند. القای بیان اینترفرون ناشی از مسیرهای پیام رسانی است که به TLRها مربوط می شود. هرکدام از این رسپتورها در پاسخ به لیگاند های مختلف، توانایی القای پیام را دارند و سبب آغاز پاسخ سایتوکاین های پیش التهابی می شوند. در این مقاله درباره خاموش شدن ژن توسط siRNA، نقش فاکتورهای سلولی در تنظیم بیان ژن های سیستم ایمنی ذاتی و القای اینترفرون توسط siRNA دو رشته ای و تک رشته ای توضیح داده می شود.

اثر خاموش سازی ژن با siRNA به طور قابل توجهی به یک روش مناسب جهت عرضه آن به سلول ها بستگی دارد. در پژوهش حاضر، اثر لیپوزوم ها در انتقال کمپلکس siRNA - 177Lu به سلول های سرطانی کولون به طور کمی مورد مطالعه قرار گرفته است.
siRNA با p-SCN-Bn-DTPA کونژوگه و با لوتسیم نشاندار شد. کمپلکس های siRNA - 177Lu پس از تخلیص با ستون های Vivaspin و سفادکس G25، به منظور تعیین در صد خلوص و سالم بودن به ترتیب با ITLC و PAGE بررسی شدند. siRNA های نشاندار با استفاده از لیپوفکتامین و siPORT Neo FX به سلول های سرطانی کولون ترانسفکت شدند، سپس در صد ترانسفکشن با شمارشگر گاما به طور کمی محاسبه گردید. از تصاویر میکروسکوپی و شمارش سلولی برای بررسی اثرات سیتوتوکسیک کمپلکس های نشاندار روی سلول های سرطانی استفاده شد.
ITLC نشان داد که خلوص کمپلکس های siRNA - 177Lu تولید شده، بیش از %95 بود. در صد ترانسفکشن کمپلکس siRNA - 177Lu به سلول های سرطانی کولون توسط لیپوفکتامین در مقایسه با siPORT Neo FX به طور معنی دار بالا بود (P < 0.01). شمارش سلولی و تصاویر میکروسکوپی نشان داد که کمپلکس siRNA - 177Lu ضد IGF-1R اثر سیتوتوکسیک معنی داری روی سلول های مورد مطالعه نسبت به گروه کنترل دارد (P < 0.001).
پژوهش حاضر نشان می دهد که کارایی لیپوفکتامین در انتقال کمپلکس siRNA - 177Lu به سلول های سرطانی کولون در مقایسه با siPORT Neo FX بیشتر است و siRNA - 177Lu ضد IGF-1R اثر سیتوتوکسیک بر روی سلول های سرطانی کولون دارد.

نانو ذرات نقره به دلیل داشتن خواص آنتی باکتریال کاربردهای زیادی از جمله در صنایع نساجی، سرامیک های بهداشتی، تصفیه آب، رنگ، کشاورزی، دامپروری و در کامپوزیت های پلیمری به منظور کاربردهای صنعتی و خانگی به عنوان مثال در بدنه داخلی یخچال، انواع فیلترهای آب و هوا، ظروف پلاستیکی و غیره دارند. هدف از این تحقیق استفاده از قارچ فوزاریوم اگزیسپوروم و باکتری اشرشیا کلی برای تولید نانو ذرات نقره می باشد.
در این تحقیق به منظور بررسی خواص آنتی باکتریال کلوئیدهای نقره تولید شده به وسیله دو میکروارگانیسم از روش دیسک نفوذی استفاده گردید. برای بررسی اندازه و مورفولوژی نانو ذرات نقره حاصل، از میکروسکوپ الکترونی عبوری (TEM) استفاده شد.
وجود نانو ذرات نقره در کلوئید حاصل با استفاده از طیف سنجی نور فرابنفش- مرئی به اثبات رسید. میانگین سایز نانو ذرات بدست آمده از قارچ فوزاریوم اگزیسپوروم کوچک تر از میانگین آن در باکتری اشرشیا کلی بود.
نتایج بدست آمده از این مطالعه نشان داد که خواص آنتی باکتریال سطوح پوشیده با کلوئید نانو ذرات نقره سنتز شده به کمک قارچ فوزاریوم اگزیسپوروم به دلیل کوچکتر بودن اندازه نانو ذرات نسبت به کلوئید حاصل از باکتری اشریشیاکلی مطلوب تر می باشد.

تثبیت بیومولکول ها بر روی بسترهای مختلف به گونه ای که خاصیت آن حفظ گردد و بازدهی افزایش یابد اساسی ترین پیش نیاز برای طراحی و ساخت حسگرهای زیستی می باشد. آنتی بادی ها از دسته مهم ترین مولکول های کارا برای نیل به این منظور می باشد. این مطالعه با هدف افزایش کار آمدی تثبیت آنتی بادی بر روی بسترهای نیترو سلولز و نایلون انجام پذیرفت.
در این تحقیق جهت پردازش (فعال سازی و بلاکینگ) سطح بسترهای نیتروسلولز و نایلون از مواد و لایه های پلیمری مختلف نظیر PEI و MAMEC استفاده گردید. افزایش تعداد گروه های عاملی در بستر نیتروسلولز و ایجاد گروه فعال جدید بر سطح نایلون از مهم ترین تغییرات انجام شده بر روی بسترها بودند. پس از تثبیت آنتی بادی بر روی بسترها، کارامدی فرایند مورد سنجش قرار گرفت و با نمونه های کنترل مقایسه گردید.
نتایج نشان داد که تغییرات اعمال شده روی سطح بسترها، باعث افزایش ظرفیت تقریبی 2 و 3 برابری تثبیت آنتی بادی به ترتیب بر روی بستر های نیتروسلولز و نایلون شده است.
بسته به نوع بستر نوع پردازش ممکن است متفاوت باشد، همچنین این امکان وجود دارد که خواص فیزیک و شیمیایی بستر نظیر خاصیت موئینگی، انعطاف پذیری، بارهای سطحی و غیره دچار تغییر شده و بر روی کیفیت تثبیت اثرات منفی بگذارد.

جنس Salsola با داشتن 100 گونه بزرگترین جنس در زیر خانواده Salsoloideae می باشد. برتری این جنس بر سایر جنس ها در این است که علاوه بر خشبی بودن، جزو گیاهان علوفه ای بوده و قدرت تولید بذر آن خوب و میزان تولید علوفه بالایی دارد.
شناسایی گونه های مختلف این جنس به خاطر نداشتن ویژگی های قابل تشخیص ساده، زیستگاه های خیلی متغیر، اختلافات مورفولوژیکی گیاهان جوان و گیاهان بالغ برای گیاه شناسان مشکل می باشد. وجود سیستم ریشه ای عمیق، فشار اسمزی بالا، کارایی بالا در استفاده آب و شکل های زیستی مختلف به عنوان یک گیاه مهم علوفه ای در زمین های خشک محسوب شده و برای کاشت در زمین های شور جایی که محصولات دیگر تولید خوبی ندارند و یا در نواحی که آبیاری فقط با آب شور امکان دارد حائز اهمیت است.
در این تحقیق اکولوژی بعضی از گونه های جنس سالسولا در استان گلستان مورد بررسی قرار گرفته است گونه های مختلف این جنس یکی از عناصر اصلی پوشش گیاهی مراتع منطقه بوده که رویشگاه گونه های مختلف آن از اراضی پست مسطح تا کوه های پوشیده از خاک های شنی متفاوت است. گونه های یک ساله در اراضی پست با شیب حداکثر 15 % پراکنده شده اند.
رویشگاه سه گونه S. tomentosa S. arbusculiformis، S. orientalis، از نظر شرایط اکولوژیکی با دیگر گونه متفاوت بوده و در ارتفاعات و اراضی کوهستانی و کوهپایه ای می رویند.

باکتریمی با لیستریا منوسیتوژن در زنان حامله می تواند به عوارض مختلف در جنین از جمله سقط منجر شود. گر چه تشخیص لیستریوز می تواند با کشت نمونه و جدا سازی باکتری صورت گیرد ولی به دلیل وقت گیر بودن، راندمان پایین ناشی از تعداد کم باکتری و مشکل در تشخیص افتراقی از سایر باکتری ها در بسیاری از آزمایشگاه ها از این روش به طور معمول استفاده نمی شود و هم چنین روش های ایمونولوژی نیز کمتر اهمیت پیدامی کند، لذا تشخیص مولکولی باکتری در نمونه های بیمار و یا مواد غذایی مشکوک از اختصاصیت بالایی برخوردار است. در این مطالعه روش مولکولی در مقایسه با روش های دیگر در افتراق باکتری بکار رفته است.
در این مطالعه، 152 مورد مشکوک به لیستریوز مراجعه کننده به آزمایشگاه مسعود که از مواد غذایی آلوده مصرف کرده بودند نمونه اخذ شد و از نظر آنتی بادی های ضد لیستریا مونوسیتوژن به روش IFA تحت بررسی قرار گرفتند. در ضمن نمونه ها با استفاده ازکشت و روش مولکولی بعد از استخراج DNA با روش PCR مورد ارزیابی قرار گرفتند که تمام روش های مولکولی مورد استفاده از روش استاندارد بوده است.
از تمام نمونه ها 47 % (71) آن ها در رقت 100/ 1 و 400/ 1 در روش ایمونولوژی مثبت گزارش شد. در روش کشت باکتری 41 مورد مثبت شدند ولیکن در روش مولکولی از کل نمونه های مشکوک به تعداد 53 مورد مثبت گزارش گردید.
با توجه به افزایش آمار بیماری زایی لیستریا و هم چنین در ارتباط بودن عفونت با سقط جنین، اهمیت بررسی آلودگی در منابع غذایی توسط باکتری اهمیت بالایی داشته و اخیرا اغلب پزشکان غربالگری زنان باردار را از نظر آلودگی به لیستریا توصیه می نمایند. بر اساس برآورد های WHO استفاده از روش آنتی سرم قابل اطمینان نبوده و روش کشت و مولکولی از اهمیت بالایی برخوردار است، بالاخص در خصوص غربالگری زنان باردار روش مولکولی از اختصاصیت بالایی برخوردار می باشد.

کلاژن دارای کاربرد های فراوانی در زمینه داروسازی و پزشکی، تهیه محصولات بهداشتی و آرایشی و صنایع غذایی می باشد. در سال های اخیر توجه زیادی به جداسازی کلاژن از موجودات دریایی شده است که علت آن عدم محدودیت استفاده از آن در رژیم غذایی و عدم ابتلا به بیماری های TSE1 و2 BSE می باشد. هدف از انجام این تحقیق استخراج کلاژن از دیواره خیار دریایی Holothuria parva و مقایسه ساختاری آن با کلاژن نوع I مهره داران می باشد.
در این تحقیق جهت مقایسه ساختاری کلاژن حل شده با پپسین (PSC3) استخراج شده از دیواره خیار دریایی جنس Holothuria parva و کلاژن نوع I مهره داران (Type I Calf skin) از آزمون های سدیم دو دسیل سولفات پلی آکریل آمید ژل الکتروفورز 4(SDS-PAGE)، طیف بینی مادون قرمز تبدیل فوریه (5 FT-IR) و کالری متری روبشی دیفرانسیلی6(DSC) استفاده شده است.
الگوی پروتئینی SDS-PAGE کلاژن حل شده با پپسین استخراج شده از دیواره خیار دریایی و نمونه کلاژن نوع I مهره داران نشان می دهد که قسمت عمده در هر دو کلاژن از زنجیره 1 α با وزن تقریبی kDa 130 و مقدار جزئی β وγ تشکیل شده اند با این تفاوت که درPSC استخراج شده از خیار دریایی به صورت ساختار 3(α1) و در کلاژن نوع I مهره داران به صورت 2α2 (α1) می باشد. طیف FT-IR کلاژن حل شده با پپسین دارای یک باند پهن در ناحیه 1-cm 3420 و باند تیز در ناحیه1-cm 11638 می باشد که شباهت زیادی به طیف FT-IR کلاژن نوع I مهره داران دارد. از آزمون DSC ماکزیمم دمای انتقالیPSC، 94/46 درجه سانتی گراد تعیین گردید که نشان دهنده پایداری حرارتی کمتر نسبت به کلاژن نوع I مهره داران (62 درجه سانتی گراد) می باشد.
کلاژن استخراج شده از خیار دریایی Holothuria parva نوع I تعیین شده و با توجه به پایداری حرارتی مناسب می تواند در مصارف صنعتی مورد استفاده قرار گیرد. همچنین پایین بودن ماکزیمم دمای انتقالی کلاژن استخراج شده نشان دهنده محتوی کمتر ایمنو اسیدهای پرولین و هیدروکسی پرولین نسبت به کلاژن نوع I مهره داران می باشد.

اندومتریوزیس یک اختلال ژنیکولوژی شایع است که اطلاعات کمی در موردش وجود دارد. این بیماری با وجود بافت اندومتریال رحمی، در فضای بیرون رحمی مشخص می شود و عمدتا با درد شدید لگن و یا نازایی همراه ست. ما فرض کردیم که عفونت های ویروسی آندومتر نظیر Human Papillomavirus) HPV)، می توانند توانایی تهاجم لایه بازال را خصوصا همراه با بدرون برگشتگی قاعدگی بداخل شکم یا درون عضلات رحمی افزایش دهند.
در این تحقیق 46 بلوک پارافینی اندومتریوزیس و50 بلوک پارافینی نرمال اندومتر به عنوان شاهد انتخاب شدند. پس از استخراج DNA، همه نمونه ها برای حضور ژن بتاگلوبین بررسی شده و نمونه های مناسب برای حضور ژن L 1 HPV- Common با (PCR (Polymerase Chain Reaction جستجو شدند.
HPV بوسیله PCR در 11 مورد از 43 (58/25 %) نمونه بافت اندومتریوزیس و 7 مورد از 43 (27/16 %) نمونه بافت اندومتر شناسایی شد. در مجموع از 86 نمونه، 18 مورد (93/20 %) با مارکرهای عمومی HPV مثبت بودند.
عفونت HPV در ضایعات اندومتریوزیس مشابه بافت های کنترلی بوده و از گسترش ویروس بوسیله سلول های اندومتر آلوده به HPV از طریق بدرون برگشتگی قاعدگی حمایت می کند. بخاطر ارتباط HPV با سرطان ها، پایداری عفونت HPV در ضایعات اندومتریوزیس نیز می تواند به پیشرفت بدخیمی کمک نماید.

مرحله جوانه زنی گیاهان یکی از مراحل مهم در طول دوره رشدی آن ها است که اغلب تحت تاثیر تنش های محیطی به ویژه شوری قرار می گیرد. لذا هدف از این مطالعه بررسی اثرات شوری کلرید سدیم بر جوانه زنی ارقام بومی برنج و شناسایی مقاوم ترین رقم نسبت به شوری می باشد.
به منظور بررسی جوانه زنی سه رقم برنج به نام های غریب، موسی طارم و ابجی بوجی در سطوح مختلف شوری آزمایشی در قالب طرح پایه بلوک های کامل تصادفی با 4 تکرار به اجرا در آمد. تیمارهای شوری (0، 4، 8 و 12) دسی زیمنس بر متر بودند. از کلرید سدیم برای ایجاد تنش شوری استفاده گردید.
اختلاف بین ژنوتیپ ها برای کلیه صفات معنی دار بود. تجزیه واریانس داده ها نشان داد که اثرات شوری بر جوانه زنی، رشد ریشه چه و ساقه چه در ارقام مختلف مورد مطالعه برنج و نیز اثر متقابل آن ها در سطح 1% معنی دار بود. با افزایش شوری درصد و سرعت جوانه زنی کاهش یافت.
اختلاف موجود بین ارقام در تمامی صفات از نظر آماری معنی دار بود. همچنین با افزایش تنش شوری طول ریشه چه، ساقه چه، درصد و سرعت جوانه زنی کاهش معنی داری پیدا کرد.

بیوسنتز نانو ذرات با روش های زیستی توسط میکروارگانیسم ها، بدلیل سازگاری بالا با محیط زیست و کاهش مصرف انرژی و هزینه ها از جایگاه ویژه ای برخوردار هستند. زمانی که روش های تولید بر اساس فناوری های زیستی مطرح شدند، نظر بسیاری از محققین را بخود جلب کردند. یکی از مهم ترین ابعاد این بحث استفاده از میکروارگانیسم ها در فناوری نانو است.
سویه های مختلفی از لاکتوباسیل های جدا شده از محصولات لبنی بومی ایران تحت شرایط کنترل شده، در معرض تیتانیوم دی اکساید قرار گرفته و نتایج با میکروسکوپ های الکترونی SEM و AFM و همچنین پراش پرتو ایکس (XRD) بررسی شدند.
در این مطالعه، شاهد شکل گیری نانوذرات تیتانیوم در ابعاد مختلف توسط برخی لاکتوباسیلوس پلانتاروم های جدا شده از محصولات لبنی بومی ایران هستیم.
پس از بررسی و مطالعه سازوکار مولکولی بیوسنتز نانو ذرات توسط باکتری ها و احیای اکسیدهای فلزی توسط آنان، تحت عنوان فرایندی دفاعی که احتمالا به دلیل فقدان سوپراکسید دیسموتاز در برخی از این سویه ها است، تفصیر می گردد.