داروسازی نیز همانند بسیاری از رشته های دیگر مشکلات عام آموزش دارد. به این معنا که نظام آموزشی ما به جای بحث و گفتگو و درک عمیق مطلب بیشتر مبتنی بر حفظ کردن است. اما جز این مشکل عام مشکلات خاصی نیز در این رشته وجود دارد.

در یک نظام مناسب سلامت رشته داروسازی باید بتواند نیازهای ملی را برآورده کند و نظام آموزشی نیز به تعداد مناسب متخصصان این رشته را تربیت کند.اما متاسفانه یکی از مهم ترین مشکلات نظام آموزشی داروسازی ناهماهنگی میان نیاز کشور و تربیت داروساز در نظام آموزشی کشور است. طبیعتا نظام آموزشی داروسازی باید بر اساس نیازهای کشور ورودی خود را تنظیم و کیفیت محصول انسانی خود را تعریف کند.