با عنایت دفتر حضرت آیت الله العظمی سیستانی در سال 1376 کتابخانه تخصصی تفسیر و علوم قرآنی افتتاح شد. در این کتابخانه حدود 20هزار جلد و عنوان کتاب و 800 جلد پایان نامه و نشریه به زبان های مختلف فارسی، عربی، اردو، انگلیسی و سایر زبان ها جمع آوری شده است. یکی از مهم ترین فعالیت های این کتابخانه، گردآوری و انتشار مجموع مقالات قرآنی از تمامی نشریات دینی جهان است که در آن، علاوه بر فهرست مقالات قرآنی تا حد امکان اصل مقالات نیز انتشار می یابد. در این کتابخانه همه کتاب هایی که به نحوی با دانش قرآن مرتبط باشند جمع آوری می شود، البته در کنار این مجموعه دو گونه آثار دیگر هم برای محققان فراهم می شود: یکی کتاب های کلیدی نظیر دایرة المعارف و فرهنگنامه ها و معجم ها در حدودی که محقق اطلاعات اجمالی نسبت به مدخل مورد نیازش را پیدا کند. دوم کتاب های مربوط به عهد عتیق و عهدین است. یعنی هرآنچه مربوط به این کتاب ها می شود اعم از شرح و تحلیل و تفسیر و متن جمع آوری می شود تا در مطالعات تطبیقی مورد استفاده واقع شوند. اکثر کتاب ها به زبان عربی و بعد هم فارسی است ولی محدودیتی درباره زبان های دیگر وجود ندارد و تا جایی که امکان داشته باشد کتاب های مرتبط با علوم قرآنی به زبان انگلیسی، آلمانی و غیره در این کتابخانه جمع آوری می شود.