مالکیت همزمان وزارت ورزش و جوانان بر دو قطب اصلی فوتبال ایران همواره بخش قابل توجهی از منابع مادی و معنوی مدیران این وزارتخانه را درگیر می کند مثل شائبه رنگی بودن وزیر ورزش و جوانان که سلطانی فر ناگزیر به رد این موضوع شد.

در شرایطی که ناظران و کارشناسان ورزش همواره بر این عقیده بوده اند که بالاترین رکن اجرایی ورزش یعنی وزارتش ورزش و جوانان یا سازمان تربیت بدنی سابق باید دست از باشگاهداری کشیده و به نقش اصلی حاکمیتی خود یعنی نظارت بر مجموعه ورزش بپردازند، اما عملا این موضوع هیچ گاه محقق نشده است. در این رابطه از پاره ای ملاحظه کاری های غیرورزشی تا شیرینی مدیریت این دو باشگاه که شهرت خوبی برای مسئولان ورزش داشته جملگی مانع واگذاری استقلال و پرسپولیس به بخش خصوصی بوده اند.