اثر Codon Usageبر بیان ژن فاکتور رشد بازی فیبروبلاست (hbFGF) در Escherichia coli

با وجود این که تمامی موجودات از 61 کدون جهت تولید پروتئین ها استفاده می نمایند، اما هر ارگانیسمی تمایل به استفاده از کدون های خاصی دارد که این امر، بیان پروتئین های نوترکیب را در میزبان های هترولوگوس، با مشکل مواجه می سازد. با توجه به این که اغلب اسیدهای آمینه، دارای بیش از یک کدون جهت شناسایی توسط tRNA هستند، این امکان وجود دارد که بدون تغییر در نوع یک اسیدآمینه، کدون مربوط به آن را بر اساس استفاده (Usage) آن در یک میزبان خاص مانند E. coli تغییر دهیم. اعمال Codon Usage در ناحیه N-terminal از ژن hbfgf توسط روش Site Directed Mutagenesis انجام و میزان بیان hbFGF با استفاده از تکنیک‎های SDS-PAGE و Western Blot اندازه‎گیری و با ژن وحشی، مقایسه شد. تفاوت میزان تولید ژن موتانت و ژن وحشی، بسیار قابل توجه و معنی دار بود؛ به طوری که در بررسی ها توسط SDS-PAGE عملا باند مشخصی برای محصول ژن موتانت مشاهده نشد. در حالی که در مورد ژن وحشی، باندهای مربوطه بسیار مشخص و دارای شدت رنگ بالایی بودند. با توجه به این که تا مرحله قبل از رونویسی ژن (ساخت mRNA) شرایط هر دو ژن موتانت و وحشی، مشابه در نظر گرفته شده بود، این اختلاف فاحش در میزان بیان دو ژن را می توان به کارآمدی mRNA برای ترجمه ارتباط داد. نتایج به دست آمده بیانگر جلوگیری از شروع ترجمه کارآمد توسط ساختارهای ثانویه پایدار در ناحیه '' 5 از mRNA می باشد.