مطالعه فیلوژنیتیکی و ژنوتیپی سویه های ویروس برونشیت عفونی گله های گوشتی به روش RT- PCR و تعیین توالی ژن گلیکوپروتئینS1

تکامل و ایجاد سروتیپهای جدید و مختلف ویروس برونشیت عفونی بطور مستمر در حال انجام است که این امر هر ساله ضررهای اقتصادی فراوانی به صنعت طیور وارد می کند، لذا تعیین سریع و صحیح سروتیپ ها جهت انتخاب و توسعه ی واکسنهای مناسب سویه های هر منطقه به عنوان یک اصل مهم و تعیین کننده در کنترل این بیماری است. در این مطالعه نمونه ها از نای، ریه و کلیه از گله هایی با علائم تنفسی، مشکوک به بیماری برونشیت عفونی از گله های پرورش مرغ گوشتی استان فارس و چهارمحال و بختیاری به تعداد 40 نمونه بصورت تجمیع از 40 گله جمع آوری شدند. نمونه پس از آماده سازی برای ردیابی ویروس برونشیت عفونی با آزمایش RT-PCR انتخاب شد، سپس محصول PCR خالص شده برای تعیین توالی قطعه ای به طول 464 جفت باز از ژن S1 به شرکت MWG آلمان ارسال شد. پاسخ توالی های اخذ شده بررسی و تصحیح شد. نتایج این مطالعه نشان داد سویه ی variant 2 تبدیل به سویه ی غالب در این دو منطقه شده است. بیشترین شیوع جدایه ها مربوط به سویه ی variant 2 بود که شامل 75% نمونه ها (9 نمونه) می گردید و پس از آن سویه ی ماساچوست قرار داشت که در این بین 6/16% نمونه ها (2 نمونه) و یک نمونه (8%) هم متعلق به سویه واکسن H120 بود. بنابراین با توجه به متفاوت بودن سویه های غالب در مناطق مورد مطالعه واکسنهای موجود در بازار نمی تواند محافظت ایمنی مناسبی ایجاد کند و نیازمند توسعه ی واکسنهای جدید است.