جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « شناسایی ژنتیکی » در نشریات گروه « زیست شناسی »

تکرار جستجوی کلیدواژه « شناسایی ژنتیکی » در نشریات گروه « علوم پایه »

انتخاب همه

شناسایی و آنالیز فیلوژنتیکی سویه های Vibrio harveyi جداشده از میگو های پرورشی سفید غربی (Litopenaeus vannamei Boone، 1931) - منطقه تیاب-هرمزگان

محمدرضا صادقی، سعید تمدنی جهرمی، امیر هوشنگ بحری، محسن گذری*

فصلنامه بوم شناسی آبزیان، سال هفتم شماره 2 (پیاپی 702، پاییز 1396)، صص 59 -65

در مطالعه حاضر باکتری های Vibrio harveyi از هپاتوپانکراس میگوهای پرورشی سفید غربی Litopenaeus vannamei جمع آوری شده از منطقه تیاب جداسازی و شناسایی گردیدند. نمونه های میگو از دو مزرعه شامل 5استخر در سایت های تیاب شمالی و جنوبی جمع آوری شدند. مرحله جداسازی با رقیق سازی و تلقیح نمونه های هپاتوپانکراس با استفاده از محیط تیوسولفات سیترات بایل سوکروز آگار انجام گرفت. پس از خالص سازی، شناسایی فنوتیپی ایزوله های به دست آمده بر اساس خصوصیات مورفولوژیک، بیوشیمیایی و فیزیولوژیک انجام شد. به دنبال آن 5 سویه منتخب Vibrio harveyi پس ازاستخراج DNA و تکثیر ژن 16S rRNA مورد شناسایی ژنتیکی قرار گرفتند. مقایسه توالی ژن 16S rRNA تکثیر شده از جدایه های منتخب با توالی های ثبت شده در بانک ژن NCBI با استفاده از نرم افزار Megablast ضمن تایید تعلق سویه های جدا شده به Vibrio harveyi بیانگر تشابه بالای سویه های جدا شده با سویه Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 بود. مطالعات آنالیز فیلوژنتیک با استفاده از نرم افزار MEGA6بر اساس روش Joining Neighbour نشان داد سویه های مورد بررسی دارای منشا منوفیلتیک یکسانی بودند. نتایج این مطالعه حضور گونه های Vibrio harveyi در هپاتوپانکراس میگوهای پرورشی سفید غربی منطقه تیاب را تایید نمود.

کلید واژگان: آنالیز فیلوژنتیک, شناسایی ژنتیکی, هپاتوپانکراس, Vibrio harveyi}

چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی

Molecular identification and phylogenetic analysis of Vibrio harveyi strains isolated from Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei Boone, 1931) in Tiab region, Hormozgan province

MohammadReza Sadeghi, Saeid Tamadoni Jahromi, AmirHoushang Bahri, Mohsen Gozari *

Journal of Aquatic Ecology, Volume:7 Issue: 2, 2017, PP 59 -65

In this research Vibrio harveyi strains were isolated and identified from hepatopancreas of Litopenaeus vannamei from Tiab region, Hormozgan province. Shrimps samples were collected from five different ponds in northern and southern Tiab shrimp culture sites. Isolation phase was performed by dilution and inoculation of hepatopancreas samples on thiosulfate citrate bile salts sucrose agar medium. Purified isolates were identified phenotypically based on morphological, biochemical and physiological methods. Genomic DNA of five selected Vibrio harveyi strains were extracted and their 16S rRNA genes were amplified. Comparison of amplified 1000 bp sequence of 16srRNA genes with registered sequences in NCBI gene bank by megablast software exhibited high homology between isolated strains and Vibrio harveyi ATCC BAA-1116. Phylogenetic analysis by MEGA 6 sofware based on neighbour Joining method showed that isolated strains had similar monophyletic origin. According to these results presence of V. harveyi strains in hepatopancreas of Litopenaeus vannamei from Tiab region were genetically confirmed.

Keywords: Vibrio harveyi, Litopenaeus vannamei, Genetic identification, Phylogenetic analysis}

Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian

نکته

نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.

به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « شناسایی ژنتیکی » در نشریات گروه « زیست شناسی »