microarray
در نشریات گروه برق-
داده های ریزآرایه نقش موثری در طبقه بندی و تشخیص انواع بافت های سرطانی ایفا می کنند. با این حال در پژوهش های مرتبط با سرطان، تعداد نسبتا کم نمونه ها در مقایسه با تعداد بسیار زیاد ژن ها ، باعث ایجاد مشکلاتی از قبیل کاهش کارایی طبقه بندها، افزایش هزینه های محاسباتی و پیچیدگی در طبقه بندی سلول های سرطانی خواهد شد. یک راهکار مناسب جهت افزایش کارایی طبقه بندها، حذف ژن ها ی نامربوط و انتخاب نمونه های مناسب برای آموزش طبقه بندها است. در این مقاله یک مدل ترکیبی بر پایه الگوریتم بهینه سازی جستجوی فاخته چندهدفه و خوشه بندی فازی برای طبقه بندی داده های ریزآرایه پیشنهاد شده است. در این مطالعه از نسخه دودویی الگوریتم جستجوی فاخته چندهدفه به منظور انتخاب ویژگی های مرتبط با بیماری و از نسخه پیوسته آن برای انتخاب تعداد نمونه های مناسب برای آموزش طبقه بندها استفاده شده است. به منظور تسریع در فرایند بهینه سازی و جلوگیری از گیرافتادن الگوریتم در بهینه های محلی، راهکار های ابتکاری جدیدی نیز به الگوریتم اضافه شده اند. برای بررسی عملکرد مدل پیشنهادی، شبیه سازی های متعددی بر روی شش مجموعه داده سرطانی انجام گرفته و نتایج آن با دیگر مقالات مقایسه شده است. نتایج به دست آمده نشان می دهند در بسیاری از موارد مدل پیشنهادی قادر است در مقایسه با سایر روش ها، با انتخاب مجموعه کوچک تری از ژن ها ی متمایز، منجر به افزایش کارایی طبقه بندها شود.
کلید واژگان: انتخاب ویژگی، انتخاب نمونه، داده کاوی، ریزآرایه، الگوریتم جستجوی فاخته چندهدفه، خوشه بندی فازیMicroarray datasets have an important role in identification and classification of the cancer tissues. In cancer researches, having a few samples of microarrays in cancer researches is one of the most concerns which lead to some problems in designing the classifiers. Moreover, due to the large number of features in microarrays, feature selection and classification are even more challenging for such datasets. Not all of these numerous features contribute to the classification task, and some even impede performance. Hence, appropriate gene selection method can significantly improve the performance of cancer classification. In this paper, a modified multi-objective cuckoo search algorithm is used to feature selection and sample selection to find the best available solutions. For accelerating the optimization process and preventing local optimum trapping, new heuristic approaches are included to the original algorithm. The proposed algorithm is applied on six cancer datasets and its results are compared with other existing methods. The results show that the proposed method has higher accuracy and validity in comparison to other existing approaches and is able to select the small subset of informative genes in order to increase the classification accuracy.
Keywords: Feature selection, instance selection, microarray, multi-objective Cuckoo search algorithm, fuzzy clustering
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.