به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « Kinase domain » در نشریات گروه « پزشکی »

  • Hima Vyshnavi, Krishnan Namboori
    Background and Purpose

    Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive subtype of breast cancer in which three hormone receptors are negative. This work aimed at identifying customized potential molecules inhibiting epidermal growth factor receptor (EGFR) by exploring variants using the pharmacogenomics approaches.

    Experimental approach: 

    The pharmacogenomics approach has been followed to identify the genetic variants across the 1000 genomes continental population. Model proteins for the populations have been designed by including genetic variants in the reported positions. The 3D structures of the mutated proteins have been generated through homology modeling. The kinase domain present in the parent and the model protein molecules has been investigated. The docking study has been performed with the protein molecules against the kinase inhibitors evaluated by the molecular dynamic simulation studies. Molecular evolution has been performed to generate the potential derivatives of these kinase inhibitors suitable for the conserved region of the kinase domain. This study considered variants within the kinase domain as the sensitive region and remaining residues as the conserved region.

    Findings/ Results

    The results reveal that few kinase inhibitors interact with the sensitive region. Among the derivatives of these kinase inhibitors molecules, the potential kinase inhibitor that interacts with the different population models has been identified .

    Conclusions and implications:

     This study encompasses the importance of genetic variants in drug action as well as in the design of customized drugs. This research gives way to designing customized potential molecules inhibiting EGFR by exploring variants using the pharmacogenomics approaches.

    Keywords: Conserved region, EGFR, Kinase domain, Sensitive region, TNBC}
  • Ramesh L. Sawant*, Jyoti B. Wadekar, Rushikesh D. Ukirde, Ganesh D. Barkade

    Polo-like kinase 1(Plk1) plays an essential role in inhibiting cell proliferation and comes under the family of serine/threonine-protein kinase, which is a particular target for cancer therapy. In some clinical studies, Plk1 has been identified as a target for cancer. Currently, so many scientists are developing the Plk1 inhibitors, and they are thinking about working on them. A recent strategy for Plk1 inhibition is the development of small-molecule inhibitors, which will inhibit the Plk1 through the ATP-binding site of the Plk1. Now new generation Plk1 inhibitors being tested clinically, which are targeting the polo box domain. This review highlights the recent progress made in the development of Plk1 inhibitors as anticancer agents

    Keywords: Kinase domain, Polo-like kinase 1, Polo box domain, Small molecule inhibitors}
  • بنیامین علیمحمدی، فائزه سید عطاران، میلاد ولی شیرین، حسین پیری *
    زمینه و هدف
    اثرات فلاونوئید ها تنها مربوط به خاصیت آنتی اکسیدانی آن ها نمی باشد؛ بلکه این ترکیبات روی مسیرهای سیگنالی سلولی نیز تاثیر می گذارند. هدف از این مطالعه، بررسی تاثیر فلاونوئید کوئرستین بر ساختار سوم ناحیه کینازی پروتئین FGFR2b در شرایط آزمایشگاهی می باشد.
    روش تحقیق: در این مطالعه از تکنیک اسپکتروسکوپی فلوئورسانس یا فلوئورسانس ذاتی برای بررسی ساختار سوم پروتئین تخلیص شده در شرایط مختلف استفاده گردید. به منظور ارزیابی پایداری کنفورماسیونی پروتئین تخلیص شده و با کمک غلظت های مختلفی از گوانیدین هیدروکلرید (GnHCl) در دامنه غلظتی صفر تا 6 مولار و طول موج تحریکی 280 نانومتر، دناتوراسیون شیمیایی پروتئین مذکور مورد بررسی قرار گرفت.
    یافته ها
    بررسی SDS-PAGE نشان داد که پروتئین به دست آمده خالص بوده و عاری از آلودگی پروتئین های باکتریایی بود. نتایج حاصل از آزمایشات اسپکتروسکوپی فلوئورسانس نشان داد که شدت نشر فلوئورسانس در حضور کوئرستین و با افزایش تدریجی غلظت آن ها کاهش می یابد. دناتوراسیون ساختمان پروتئین نشان داد که نشر فلوئورسانس در حضور کوئرستین و با افزایش تدریجی غلظت آن کاهش یافت که نتیجه ی آن، تغییر ساختار سوم ناحیه کینازی بر اثر دناتوراسیون شیمیایی می باشد.
    نتیجه گیری
    کوئرستین می تواند موجب تغییر ساختار سوم دومین کینازی و در نتیجه ناپایدار شدن آن گردد. این ناپایداری در سطح مولکولی می تواند موجب اختلال در مسیر پیام رسانی سلول شده و در نتیجه مهار رشد و تکثیر سلول های سرطانی گردد.
    کلید واژگان: اسپکتروسکوپی, دومین کینازی, فلوئورسانس, فیبروبلاستی, کوئرستین, گیرنده عامل رشد}
    Benyamin Alimohammadi, Faezeh Seyyed-Attaran, Milad Vali-Shirin, Hossein Piri *
    Background And Aim
    Antioxidants are compounds that protect cells from attacks of free radicals. Lack of balance between antioxidants and free radicals results in oxidative stress, which ultimately results in cell damage. The effects of flavonoids are not related solely to their antioxidant properties, but also to their effects on cellular signal pathways. The present study was conducted to evaluate the effect of Quercetin on the structure of the third region of FGFR2b kinase using fluorescence method.
    Materials And Methods
    Using SDS-PAGE, expression of the protein was determined and its constant concentration was used in the present study. Using different concentrations of Quercetin in the presence of a constant concentration of pure protein, the fluorescence spectrum and chemical denaturation were evaluated.
    Results
    In the last studies, SDS-PAGE analysis of the purified proteins had confirmed that no contamination and unwanted bacterial proteins were co-eluted with the protein. Studying the spectrum of various concentrations of Quercetin in the presence of constant concentration of proteins showed a decrease in the intensity of the release; and also, the chemical denaturation changed the third structure of the kinase domain.
    Conclusion
    The tertiary structural change of FGFR2b kinase domain represents a conformational change that may have a critical role in signal transduction cascade. Thus, this molecular transduction inconsistency can lead to cellular transduction complication; and as a result, inhibit the development and multiplication of cancerous cells.
    Keywords: Fibroblast growth factor receptor, Kinase domain, Flouresence spectroscopy, Quercetin}
  • مریم توده روستا، نعمت الله غیبی *، داریوش ایلغاری، مجید سیرتی ثابت
    پیش زمینه و هدف
    گیرنده فاکتور رشد فیبروبلاستی نوع دو در مسیر پیام رسانی سلولی و تنظیم فرآیندهای مهم زیستی ازجمله تمایز و تکثیر سلولی نقش اساسی دارد. اختلال در انتقال پیام این گیرنده با چندین اختلال پاتولوژیکی انسانی مرتبط می باشد. عوامل مختلف ازجمله فلزات سمی می توانند مسیرهای سیگنالینگ را دستخوش تغییر کنند.
    هدف
    این مطالعه به منظور اثر فلز سمی نیکل بر ساختار ناحیه کینازی رسپتور فاکتور رشد فیبروبلاستی نوع دو انجام شد.
    مواد و روش ها
    در این مطالعه تجربی پروتئین نوترکیب با استفاده از پلاسمید pLEICS-01، باکتری BL21 القائ IPTG، الکتروفورز و ستون حاوی Ni2+ -NTA بیان و خالص شد. سپس اثر نیکل تا غلظت 100 میلی مولار بر ساختار ناحیه کینازی پروتئین با استفاده از تکنیک های دو رنگ نمایی حلقوی(CD) و اسپکتروفلوریمتری (فلوئورسانس) بررسی شد.
    یافته ها
    مطالعه نیکل در غلظت های زیر 100 میلی مولار بر روی ساختارهای منظم دوم بدون تغییر ولی باعث تغییر جزئی در نشر ذاتی تریپتوفان در ساختار سوم می شود.
    نتیجه گیری
    ساختار اصلی و پایداری ناحیه کینازی گیرنده فاکتور رشد فیبروبلاستی نوع دو در برابر نیکل تغییر نمی کند.
    کلید واژگان: گیرنده فاکتور رشد فیبروبلاستی, ناحیه کینازی, نیکل, سیگنالینگ}
    Maryam Toudehrousta, Nematollah Gheibi *, Darioosh Ilghari, Majid Sirati, Sabet
    Background and Aims
    Fibroblast growth factor receptor type II (FGFR2b) is the essential factor of cellular signal transduction that regulates important biological processes including cell proliferation and differentiation. The inpairment in the signaling of these receptors is associated with several human pathology. Various factors including toxic metals can change the signaling pathways. This study was aimed to investigate the effects of Nickel as the toxic metal on the structure of FGFR2b.
    Materials and Methods
    In this study, by using plasmid pLEICS-01, BL21 bacterial, induction of IPTG, electrophoresis and column containing Ni2+ -NTA the recombinant FGFR2b was expressed and purified. The effects of Ni concentrations under 100 mM on the structure of the protein kinase domain by Spectrofluorometer and Circular dichroism (CD) was studied.Resultas: The nickel concentrations (under 100 mM) do not have a significant impact on the regular secondary structure of the protein. But they show a minor change in natural emission of tryptophan in the tertiary structure.
    Conclusion
    The main structure and stability kinase domain of the fibroblast growth factor receptor type II does not change by nickel.
    Keywords: Fibroblast growth factor receptor, Kinase domain, Nickel, Signaling}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال