به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « Gene expression » در نشریات گروه « ریاضی »

تکرار جستجوی کلیدواژه « Gene expression » در نشریات گروه « علوم پایه »
  • سیده یلدا بنی اسماعیلی، آرش اکبرزاده*، غلامحسین ریاضی، فرزین عبدالهی، محمد نیرومند
    امروزه با توجه به مشکلات متعددی که در زمینه بروز بیماری در مزارع پرورش میگو به وجود آمده است، به استفاده از مکمل های غذایی تقویت کننده پاسخ ایمنی و کنترل کننده بیماری های متداول در پرورش متراکم میگو بسیار توجه شده است. در این راستا در پژوهش حاضر، تاثیر فرمولاسیون جیره پایه با سطوح مختلف تیمارهای پودر برگ مورینگا Moringa oleifera (25، 50 و 100 g/kg)، عصاره (25/0، 5/0و 1 g/kg) و گروه شاهد بدون افزودن مورینگا بر بیان ژن های ایمنی میگوی سفید غربی Litopenaeus vannamei در قالب هفت تیمار و هر تیمار شامل سه تکرار، بررسی شد. پس از 8 هفته تغذیه با درصدهای مختلف پودر و عصاره برگ مورینگا، بیان 4 ژن ایمنی شامل a2macroglobulin (a2-M)، Lipopolysaccharide and B1,3- glucan binding protein  (LGBP)،  Peroxinectin (PX) و integrinß با روش Real-time PCR بررسی شد. نتایج اختلاف معنی دار آماری را در میزان بیان ژن های a2-M، LGBP، PX در تمام تیمارها نشان داد (05/0>p). میزان بیان ژن a2-M در تیمارهای عصاره 25/0و 5/0g/kg  و تیمار پودر 25g/kg   برگ مورینگا به طور معنی دار بیش از دیگر تیمارها بود (05/0>p). بیشترین مقدار بیان ژن LGBP مربوط به تیمار عصاره 5/0 و 1g/kg  برگ مورینگا و بیشترین میزان بیان ژن PX در تیمار عصاره 5/0 و 1g/kg  و تیمار پودر 25g/kg   برگ مورینگا بود که به طور معنی دار بیش از دیگر تیمارها و گروه شاهد مشاهده شد (05/0>p). در مجموع نتایج این تحقیق اثرات مثبت استفاده از 5/0 و 1 g/kg عصاره و 25g/kg   پودر برگ گیاه مورینگا بر عمکرد دستگاه ایمنی در میگوی سفید غربی را نشان داد.
    کلید واژگان: Moringa oleifera, بیان ژن, میگو, سیستم ایمنی}
    Seyedeh Yalda Baniesmaeeili, Arash Akbarzadeh *, Gholamhossein Riazi, Farzin Abdollahi, Mohamad Niromand
    Nowadays, given the numerous disease problems that have arisen in shrimp farms, the utilization of nutritional supplements to strengthen the immune response and controlling the common diseases in dense shrimp farming have been highly regarded.  So, the present study aimed to investigate the effect of basic diet formulated with different levels of Moringa oleifera leaf powder (25, 50 and 100g/kg) and ethanolic extract (0.25, 0.5 and 1g/kg) in seven treatments each with three replicates on the expression of immune genes in the Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei. After 8 weeks, the mRNA expression of four immune genes, including alpha-2-macroglobulin (α2M), Lipopolysaccharide and B1,3-glucan binding protein (LGBP), Peroxinectin (PX) and integrinß, were measured in the hepatopancreas using Real-time PCR technique. The results showed a statistically significant differences in the expression levels of the α2M, LGBP, PX genes in all treatments (p<0.05). The expression level of α2M in treatments of 0.25 and 0.5 g/kg extracts and 25 g/kg Moringa leaf powder were significantly higher than that of the other treatments (p<0.05). The highest levels of LGBP expression were observed in 0.5 and 1g/kg Moringa leaf extract and the highest level of PX gene expression was observed in 0.5 and 1g/kg Moringa leaf extract and 25g/kg Moringa leaf powder treatments, which was significantly higher than other treatments and the control treatment (p<0.05). In conclusion, the results of this study showed the positive effects of using 0.5 and 1 g/kg Moringa leaf extract and 25 g/kg leaf powder on the functioning of the immune system in L. vannamei.
    Keywords: Moringa oleifera, Gene Expression, shrimp, Immune System}
  • Ameer K. AL Mashanji *, Sura Z. AL Rashid

    With the rapid development of technology, this development led to the emergence of microarray technology. It has the effect of studying the levels of gene expression in a way that makes it easier for researchers to observe the expression levels of millions of genes at the same time in a single experiment. Development also helped in the emergence of powerful tools to identify interactions between target genes and regulatory factors. The main aim of this study is to build models to predicate the relationship (Interaction) between Transcription Factors (TFs) proteins and target genes by selecting the subset of important genes (Relevant genes) from original dataset. The proposed methodology comprises into three major stages: the genes selection, merge datasets and the prediction stage. The process of reducing the computational space of gene data has been accomplished by using proposed mutual information method for genes selection based on the data of gene expression. In the prediction, the proposed prediction regression techniques are utilized to predict with binding rate between single TF-target gene. It has been compared the efficiency of two different proposed regression techniques including: Linear Regression and Random Forest Regression. Two available data sets have been utilized to achieve the objectives of this study: Gene’s expression data of Yeast Cell Cycle dataset and Transcription Factors dataset. The evaluation of predictions performance has been performed depending on two performance prediction measures (Root Mean Square Error (RMSE) and Mean Absolute Error (MAE) with (10) Folds-Cross Validation.

    Keywords: Microarray Technology, Gene Expression, Genes Selection, Prediction Techniques, Transcription Factors Proteins}
  • فریده ریگی، محمد سوداگر*، حامد پاک نژاد، سیامک یوسفی سیاهکلرودی
    مطالعه حاضر برای ارزیابی تاثیر سطوح مختلف پروتئین و چربی جیره بر بیان ژن های درگیر در ایمنی (لایزوزیم و TNF- 1α) و اشتها (گرلین) در گورخر ماهی انجام شد. به این منظور 9 جیره با سه سطح پروتئین (25، 30 و 35%) و سه سطح چربی (4، 8 و 12%) تهیه و 135 قطعه بچه ماهی به صورت گروه های 5 تایی با میانگین وزن بدن (± انحراف معیار) 02/0 ± 23/1 گرم به طور تصادفی در 27 آکواریوم 30 لیتری توزیع و 3 بار در روز به مدت 4 ماه تغذیه شدند. طرح آزمایش به صورت فاکتوریل بود و نتایج نشان داد با افزایش پروتئین جیره شاخص های رشد (وزن نهایی، افزایش وزن بدن، درصد افزایش وزن بدن، نرخ رشد ویژه و ضریب تبدیل غذایی) و میزان بیان ژن های ایمنی و اشتها در تیمار 35 % پروتئین افزایش معنی داری داشت (05/0p<). شاخص های رشد و بیان ژن لایزوزیم در تیمار 12% چربی نسبت به دیگر تیمارها و بیان ژن گرلین در تیمار 12 % چربی نسبت به 4% (05/0p<) و بیان ژن TNF- 1α با افزایش سطوح چربی جیره افزایش یافت (05/0p>). اثر متقابل پروتئین و چربی نیز باعث افزایش شاخص های رشد و بیان ژن های ایمنی و گرلین شد (05/0p<)، به طوری که بالاترین میزان رشد و بیان ژن در تمامی ژن های مورد بررسی در تیمار 35% پروتئین و 12% چربی مشاهده شد. یافته های تحقیق حاضر مشخص کرد که پروتئین و چربی جیره می توانند در بهبود عملکرد دستگاه ایمنی و اشتها در گورخر ماهی نقش داشته باشند.
    کلید واژگان: گورخر ماهی, تغذیه, ایمنی, رشد}
    Farideh Riki, Mohammad Sudagar *, Hamed Paknejad, Siamak Yousefi Siyahkalrudy
    The present study was conducted to evaluate the effects of different levels of dietary protein and lipid on the expression of genes involved in immunity (lysozyme and TNF- 1α) and appetite (Ghrelin) in zebrafish, Danio rerio. So that, 9 diets with 3 protein levels (25, 30 and 35%) and 3 lipid levels (4, 8 and 12%) were prepared. One hundred and thirty five fish, 5 in each group, with an average weight of 1.23 ± 0.02 (g) were randomly distributed into 27 aquaria (20-liter) and fed 3 times daily during 4 months. A factorial experimental design was used for this study. The results revealed that the growth parameters (final weight, body weight gain, body weight gain percentage, specific growth rate and feed conversion ratio) and expression of immune and appetite genes increased significantly by increasing dietary protein levels in the treatment fed with 35% protein (p<0.05(. Increasing dietary lipid increased lysozyme expression and growth indices in fish fed with 12% lipid compared to other treatments; increased ghrelin gene expression in 12% compared to 4% significantly (p<0.05) and also insignificant increased TNF-1α expression (p>0.05). The combined effects of protein and lipid increased the lysozyme, TNF- 1α and ghrelin gene expression (p<0.05). The highest gene expression among all genes was observed in the diets containing 35% protein and 12% lipid. These findings revealed that dietary protein and lipid can enhance the function of immune system and appetite in zebrafish.
    Keywords: Zebrafish, nutrition, Immunity, Growth, Gene Expression}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال