شناسایی microRNAهای مرتبط با تنش خشکی در ریشه برنج در مرحله ابتدایی رشد

تنش خشکی یکی از مهمترین تنش های غیرزنده است که کشاورزی برنج در ایران را تهدید می کند. یکی از روش های مفید برای ایجاد تحمل به تنش خشکی در گیاهان، تنظیم بیان ژن پس از نسخه برداری توسط miRNAها است. miRNAها، RNA های تنظیم کننده کوچک 24-19 نوکلئوتیدی هستند که در تنظیم پاسخ گیاه به تنش های زنده و غیرزنده نقش دارند. در این تحقیق، پنج miRNA برای بررسی ناحیه بالادست آن ها و ارزیابی تغییر بیان در شرایط تنش خشکی در ریشه برنج انتخاب شدند. از این پنج miRNA، miR1425 و miR1880 اختصاصی برنج و miR162، miR169 و miR172 در بسیاری از گیاهان، حفاظت شده هستند. همچنین، ارزیابی ژن های miRNA مورد بررسی نشان داد که بعضی از آن ها مثل miR172، دارای عناصر تنظیم کننده مهمی مثل DRE و ABRE در بالادست خود هستند. بررسی تغییر بیان miRNAهای مورد ارزیابی در این تحقیق با استفاده از Realtime-PCR کمی انجام شد. نتایج بررسی تغییر بیان نشان داد که در شرایط تنش خشکی در ریشه miR169 افزایش بیان و miR172 کاهش بیان داشته است؛ اما سایر miRNAهای مورد ارزیابی تغییر معنی داری نداشته اند. NF-YA و AP2 به عنوان مهمترین ژن های هدف miR169 و miR172 می توانند نقش مهمی را در پاسخ به تنش خشکی ایفا کنند.