آنالیز شبکه هم بیان ژنی وزن دار برای یافتن ماژول های تنظیم شونده توسط هورمون جاسمونیک اسید در آرابیدوپسیس

شرایط محیطی منجر به ساخت ملکول های پیام رسان از جمله فیتوهورمون ها در گیاهان می گردد که وظایف مهمی بعنوان پیام رسان اولیه در مسیر ترارسانی و تنظیم فعالیت های سوخت و ساز سلول را بعهده دارند. هورمون جاسمونیک اسید با کنترل عامل های رونویسی در فرآیندهای نموی و پاسخ گیاهان به تنش های مختلف نقشی کلیدی ایفا می کند. با وجود مطالعات فراوان صورت گرفته، پاسخ گیاهان به این هورمون به طور کامل شناخته نشده است. در اینجا، داده های ریزآرایه مربوط به گیاه آرابیدوپسیس از پایگاه داده GEO برای آنالیز شبکه همبیانی مورد استفاده قرار گرفت. از تجزیه تحلیل آن ها با روش WGCNA (شبکه هم بیانی ژنی وزن دار)، 25 گروه ژنی (ماژول ) بدست آمد که پروفایل بیانی آنها در پاسخ به جاسمونیک اسید با یکدیگر دارای همبستگی معنی دار بالایی بود. برای بررسی معنی داربودن آماری هر ماژول از نظر زیستی از تجزیه و تحلیل هستی شناسی ژن استفاده شد. نتایج نشان داد که فرآیندهای زیادی از جمله فتوسنتز، مرگ برنامه ریزی شده سلول و پاسخ به تنش های مختلف به وسیله جاسمونات کنترل شدند. علاوه براین، تعداد زیادی عامل رونویسی، برای مثال 11 ژن از خانواده NAC و 12 ژن از خانواده bHLH، در تنظیم پاسخ های جاسمونیک اسید نقش داشتند و فرآیندهایی هم چون پاسخ به تنش های زیستی و غیر زیستی، نمو گل و پاسخ به نور را کنترل نمودند.