بررسی بیوانفورماتیکی اعضای خانواده ژنی CBL در گیاه کنجد (Sesamum indicum) تحت تنش خشکی

یکی از زیرخانواده های ژنی حسگرهای کلسیم، پروتیین های شبه کالسینیورین B (CBLs) بوده که به عنوان یک مولکول پیام رسان ثانویه در بسیاری از فرایندهای بیولوژیکی و عملکردهای مولکولی سلول های گیاهی نقش ایفا می کنند. در این تحقیق، بررسی گستره ژنومی زیرخانواده ژنی CBL در گیاه کنجد مورد بررسی قرار گرفت. تعداد نه ژن SiCBL در ژنوم کنجد شناسایی گردید که بر پایه روابط اورتولوگی با ژن های گیاه مدل آرابیدوپسیس، در قالب شش گروه پروتیینی SiCBL1، SiCBL2، SiCBL3، SiCBL4، SiCBL8 و SiCBL10 طبقه بندی شدند. وزن مولکولی پروتیین های SiCBL در محدوده 4/24 الی 9/37 کیلو دالتون، محدوده pH ایزوالکتریک اسیدی، شاخص ناپایداری 99/33 الی 46/47 درصد و شاخص آلیفاتیک 29/80 الی 89/106 و GRAVY در محدوده 420/0- الی 061/0 متغیر بود. پیش بینی تغییرات پس از ترجمه توالی پروتیینی CBL نشان داد موتیف پالمیتوییلاسیون در همه پروتیین های CBL گیاه کنجد مشاهده شد، در حالی که اکثر آنها فاقد موتیف میریستویلاسیون بودند. در بررسی ساختار ژنی، 11 درصد ژن های SiCBL دارای نه اگزون، 11 درصد دارای هشت اگزون و 77 درصد دارای هفت اگزون بودند. تجزیه و تحلیل الگوی RNA-seq زیرخانواده SiCBL تحت تیمار PEG نشان داد اگرچه اعضای این خانواده در دو رقم حساس و متحمل، الگوی بیان به نسبت مشابه ای داشتند ولی هر یک از اعضای این خانواده ژنی به دلیل انشقاق عملکردی، از الگوی بیان منحصربفردی برخوردار بودند. مطالعات تکمیلی بیان ژن های خانواده ژنی SiCBL و SiCIPK تحت تنش های غیر زیستی مختلف در تحقیقات آتی می تواند در درک مکانیسم تنظیمات بیان ژن های مرتبط با مسیر SOS مفید باشد.