آنالیز بیوانفورماتیکی خانواده ژنی ‏MYB‏ در گستره ژنوم تک لپه ای ها و دولپه ای ها

ابرخانواده عامل رونویسی MYB در رشد و نمو گیاه، فعال سازی ژن های پاسخ دهنده به تنش و در مواردی بیوسنتز متابولیت های کلیدی نقشی اساس دارند. در دسترس بودن توالی های ژنومی سیب زمینی، آرابیدوپسیس، ذرت و جو این فرصت را فراهم کرد تا به ترتیب 121، 139، 190 و 144 ژن MYB غیرتکراری در ژنوم این گیاهان شناسایی شود. در بررسی خصوصیات تکاملی، دامنه های حفاظت شده ی MYB در دو گیاه تک لپه ای ذرت و جو از نظر همردیفی و ترتیب قرار گرفتن، شباهت چشمگیری با یکدیگر داشتند. این خصوصیت در رابطه با دو گیاه دولپه ای سیب زمینی و آرابیدوپسیس نیز صادق بود ولی تفاوت دامنه های حفاظت شده ی MYB در تک لپه ای ها و دولپه ای قابل توجه بود. اعضای 2R-MYB رایج ترین زیرگروه از خانواده ی MYB در گیاهان تک لپه ای و دولپه ای بودند و فقط یک عضو از زیرخانواده 4R-MYB در ذرت مشاهده شد. در هر چهار گیاه دلیل اصلی تمایز عملکردی ژن ها در این خانواده ی ژنی segmental duplication بود که منجر به گزینش تکاملی مثبت و منفی گردیده است. خانواده ی ژنی MYB روی تمامی کروموزوم های سیب زمینی، آرابیدوپسیس، ذرت و جو با پراکنش غیریکنواخت قرار گرفته اند. وجود عناصر تنظیمی همسو متنوع و متعدد پاسخ به تنش ها و هورمون ها در ناحیه ی راه انداز ژن های MYB و بررسی پروفایل های بیانی این خانواده ژنی در تنش های زیستی و غیرزیستی در آرابیدوپسیس دلالت بر تنوع کارکردی ژن های این ابرخانواده دارد. بررسی بیوانفورماتیکی ابرخانواده ژنی MYB در تک لپه ای ها و دولپه ای ها چارچوبی برای مطالعات مقایسه ای، تکاملی و عملکردی اعضای این ابرخانواده ی ژنی مهم فراهم می کند.