آنالیز بیوانفورماتیکی خانواده ژنی MYB در گستره ژنوم تک لپه ای ها و دولپه ای ها
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
ابرخانواده عامل رونویسی MYB در رشد و نمو گیاه، فعال سازی ژن های پاسخ دهنده به تنش و در مواردی بیوسنتز متابولیت های کلیدی نقشی اساس دارند. در دسترس بودن توالی های ژنومی سیب زمینی، آرابیدوپسیس، ذرت و جو این فرصت را فراهم کرد تا به ترتیب 121، 139، 190 و 144 ژن MYB غیرتکراری در ژنوم این گیاهان شناسایی شود. در بررسی خصوصیات تکاملی، دامنه های حفاظت شده ی MYB در دو گیاه تک لپه ای ذرت و جو از نظر همردیفی و ترتیب قرار گرفتن، شباهت چشمگیری با یکدیگر داشتند. این خصوصیت در رابطه با دو گیاه دولپه ای سیب زمینی و آرابیدوپسیس نیز صادق بود ولی تفاوت دامنه های حفاظت شده ی MYB در تک لپه ای ها و دولپه ای قابل توجه بود. اعضای 2R-MYB رایج ترین زیرگروه از خانواده ی MYB در گیاهان تک لپه ای و دولپه ای بودند و فقط یک عضو از زیرخانواده 4R-MYB در ذرت مشاهده شد. در هر چهار گیاه دلیل اصلی تمایز عملکردی ژن ها در این خانواده ی ژنی segmental duplication بود که منجر به گزینش تکاملی مثبت و منفی گردیده است. خانواده ی ژنی MYB روی تمامی کروموزوم های سیب زمینی، آرابیدوپسیس، ذرت و جو با پراکنش غیریکنواخت قرار گرفته اند. وجود عناصر تنظیمی همسو متنوع و متعدد پاسخ به تنش ها و هورمون ها در ناحیه ی راه انداز ژن های MYB و بررسی پروفایل های بیانی این خانواده ژنی در تنش های زیستی و غیرزیستی در آرابیدوپسیس دلالت بر تنوع کارکردی ژن های این ابرخانواده دارد. بررسی بیوانفورماتیکی ابرخانواده ژنی MYB در تک لپه ای ها و دولپه ای ها چارچوبی برای مطالعات مقایسه ای، تکاملی و عملکردی اعضای این ابرخانواده ی ژنی مهم فراهم می کند.
کلیدواژگان:
زبان:
فارسی
انتشار در:
صفحات:
13 تا 29
لینک کوتاه:
magiran.com/p2691908
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!