اولین گزارش از وقوع ویروس وای سیب زمینی در برخی از گیاهان زینتی در ایران

طی بررسی های انجام شده از فضای سبز شهر شیراز در تابستان 1401، علائمی شامل موزاییک و کلروز روی برگ های گیاهان زینتی کوکب کوهی (Rudbeckia hirta)، یک گونه کوکب (Dahlia sp.) و پتونیای مکزیکی (Ruellia brittoniana) مشاهده شد. آر ان ای کل بطور جداگانه از برگ های 10 نمونه ی دارای علائم و یک نمونه بدون علائم بعنوان کنترل منفی استخراج و با استفاده از یک جفت آغازگر دژنره پوتی ویروس ها (Nib2F, Nib3R) در واکنش رونویسی معکوس- زنجیره ای پلی مزار (RT-PCR)  بکار رفت. RT-PCR منجر به تکثیر یک قطعه دی ان ای با اندازه مورد انتظار (حدود 350 جفت باز) در تمام نمونه های دارای علائم شد، در حالی که هیچ قطعه ی دی ان ای از گیاه بدون علائم مورد آزمایش تکثیر نشد. ترادف نوکلئوتیدی  به روش توالی یابی سنگر اندازه قطعه دی ان ای تکثیرشده را دقیقا 350 جفت باز تعیین و  تایید نمود که متعلق به ژن Nib ویروس وای سیب زمینی (PVY) است. مقایسه توالی نوکلئوتیدی آمپلیکون های جدایه های مورد مطالعه با توالی نوکلئوتیدی همان ناحیه از ژنوم برخی دیگراز جدایه های PVY موجود در بانک ژن نشان داد که جدایه PVY آلوده کننده پتونیای مکزیکی (R. brittoniana) بیشترین شباهت (8/98%) را با جدایه ی PVY از آمریکا با رس شمارKY_848029.1  و جدایه های PVY کوکب کوهی (R. hirta) و یک گونه کوکب (Dahlia sp.) بیشترین شباهت (بترتیب 3/98% و 4/98) را با یک جدایه PVY از قزاقستان با رس شمار ON_583980.1 دارند.