فهرست مطالب

Biotechnological Journal of Environmental Microbiology
Volume:1 Issue: 2, Summer 2022

  • تاریخ انتشار: 1401/04/10
  • تعداد عناوین: 6
|
  • امیررضا محمودی*، عباس تقوایی، سیده مهشید میری بالاجورشری صفحات 60-67
    در این تحقیق، نتایج پروژه ژنوم انسانی (HGP) و مشکلات اخلاقی احتمالی که امکان دارد ایجاد نماید، از طریق مثال های عینی مورد ارزیابی قرار گرفت. در این مطالعه سعی شده است به تفصیل آشکار گردد که چگونه حقوق و آزادی های اجتماعی، اخلاق، هنجارهای اجتماعی و ارزش های فرد تحت تاثیر قرار داده و مرزهای خطرات احتمالی که پروژه ژنوم انسانی به همراه دارد، از کجا شروع و به کجا ختم می شوند. در مورد این مسیله که مداخلات ژنتیکی فرد می تواند مورداستفاده ابزاری قرار بگیرد و به کالا تبدیل شود، بحث شده و متاسفانه مشخص شد که مداخلات در ساختار ژنتیکی می تواند به عنوان مداخله در حقوق و آزادی های اساسی فرد درنظر گرفته شود. هدف از این مطالعه نشان دادن زمینه های استفاده از پروژه ژنوم انسانی و بررسی نتایج این پروژه ازنظر پیامدهای اخلاقی ،تکنیک ها و کاربردهای مورداستفاده هست.
    کلیدواژگان: اخلاق، پروژه ژنوم، مداخله ژنتیکی، مداخلات ژنتیکی در کاربردهای پزشکی، حقوق و آزادی ها
  • ریحانه کوچکی نژاد، شهاب شریعتی*، جعفر ابوالحسنی، ابراهیم قربانی کلهر، محمدتقی وردینی صفحات 68-77
  • آزیتا تیشه یار، محمد فائزی قاسمی*، نور امیر مظفری صفحات 78-88
    سودوموناس آیروژینوزا عامل اصلی عفونت های بیمارستانی و مقاوم به اکثر آنتی بیوتیک ها است. این مطالعه باهدف بررسی تاثیر شرایط مختلف تنش بر رشد، مشخصات پروتیینی و ویژگی های بیوشیمیایی این باکتری انجام شد. سلول های  27853 Pseudomonas aeruginosa ATCC در فاز لگاریتمی در معرض تنش های متفاوت مانند غلظت سوکروز، اتانول، اسید، فشار اسمزی و CoCl2 قرار گرفتند. پس از هر شرایط تنش، رشد و بقای سلول های باکتری تعیین شد. مشاهدات میکروسکوپی تغییرات مورفولوژی را در شرایط مختلف تنش نشان داد. 27853 P. aeruginosa ATCC تا   3 pH ،  (V/V) % 55  اتانول و        CoCl2  را تا  (W/V) %7  تحمل کرد ولی فراتر از این مقادیر، باکتری توانایی خود را برای زنده ماندن از دست داد. حداکثر تحمل به سوکروز حدود 35 درصد (W/V) بود. نتایج نشان داد که شرایط تنش های مختلف نمی تواند بر ویژگی های اصلی بیوشیمیایی تاثیر بگذارد. تصویر میکروسکوپ الکترونی روبشی سلول های  P. aeruginosa ATCC 27853   که در معرض شرایط تنش مختلف قرار گرفتند، تغییرات گسترده ای را در مورفولوژی سلول ها نشان داد. علاوه بر این، پس ازتیمار با تنش های مختلف، تغییرات قابل توجهی در الگوی کلی پروتیین P. aeruginosa 27853   براساس تجزیه وتحلیل SDS-PAGE مشاهده شد. می توان نتیجه گرفت که تنش های شدید محیطی تاثیرات زیادی بر الگوی رشد، ویژگی های فنوتیپی والگوی پروتیین این باکتری  دارد. اگر تنش ها به یک باره ایجاد شوند، باعث مرگ می شوند، اما اگر به آرامی تحت تاثیر قرار گیرند و برای مدت طولانی تر، اکثر باکتری ها قادر خواهند بود قسمت های آسیب دیده را ترمیم کنند و رشد دوباره از سر گرفته شود.
  • فاطمه هنرجوی بارکوسرایی*، رویا مافی غلامی، غلام خیاطی صفحات 89-99
    تحقیقات در مورد پسماند خطرناک لجن رنگ بیشتر بر بازیابی لجن و کنترل آلودگی با روش هایی مانند جامد سازی متمرکز است. این تحقیق با هدف بررسی مقایسه حذف بیولوژیکی فلز روی از لجن رنگ با استفاده از سویه بومی Pseudomonas aeruginosa و Acidithiobacillus thiooxidans PTCC 1692 انجام شد. نمونه هایی از لجن رنگ مبتنی بر آب در شرایط آسپتیک جمع آوری شد. جداسازی سویه های بومی در محیط Bushnell-Haas (BH) از لجن رنگ انجام و A. thiooxidans PTCC 1692 در محیط 119 کشت شد. بهینه سازی پارامترهای فرآیند حذف بیولوژیکی روی با استفاده از روش طراحی آزمایشات (DOE)برای هر دو موجود زنده انجام شد. نتایج نشان داد که A.thiooxidans قادر به حذف بیولوژیکی روی با تراکم پالپ بالاتر و با دوره بیولیچینگ طولانی تر است. نتایج آنالیز شیمیایی حذف فلز روی به میزان57/76درصد در مقایسه با P. aeruginosa 36/39 درصد، و حذف سایر فلزات همچون کروم، نیکل، سرب و کادمیوم در لجن باقیمانده از فرایند را نشان می دهد. تجزیه و تحلیل پرتو ایکس انرژی (EDX) اثر مطلوب این باکتری را در کاهش فلزات سنگین نشان داد.
    کلیدواژگان: صنعت خودروسازی، لجن رنگ، فروشویی زیستی، سودوموناس آئروژینوزا، اسیدوباسیلوس تیواکسیدانس PTCC1692
  • فاطمه شمس معطر*، میرساسان میرپور، نغمه همتی صفحات 100-106
    Pimpinella saxifraga تیره ای از گیاهان معطر بومی شمال ایران است. برخی از فواید دارویی آن در حال حاضر شناخته شده است. هدف از این مطالعه بررسی اثر عصاره گیاه Pimpinella saxifraga L بر روی برخی از جدایه های محیطی انتروکوکوس فکالیس و رده سلولی HeLa می باشد. پس از جمع آوری گیاه و خشک شدن آن، عصاره های متانولی و آبی تهیه شد. از آنجایی که ترکیبات فنلی دارای اثرات متعددی هستند، تعداد ترکیبات فنلی موجود در عصاره متانولی به روش Folin-ciocalteu اندازه گیری شد. فعالیت ضد باکتریایی علیه E. faecalis ابتدا با دیسک دیفیوژن و سپس MIC و MBC با روش Microdilution اندازه گیری شد. در نهایت، فعالیت ضد تکثیری عصاره های گیاهی بر روی رده سلولی سرطان دهانه رحم (HeLa) با استفاده از روش MTT مورد بررسی قرار گرفت. حجم ترکیبات فنلی عصاره متانولی 968.33 میلی گرم بر میلی لیتر بود. بررسی اثر ضد میکروبی نشان داد که عصاره متانولی اثرات قابل توجهی بر باکتری E. faecalis دارد. MIC و MBC این عصاره به ترتیب 25 و 100 میلی گرم بر میلی لیتر بود و با استفاده از غلظت MIC از رشد رده سلولی سرطان دهانه رحم (HeLa) حدود 13 درصد مهار شد. نتایج آزمایش ها نشان داد که عصاره متانولی P. saxifraga L اثر مهاری بر رشد و تکثیر Enterococcus faecalis و رده سلولی HeLa دارد.
  • ناهید معصومی*، سید رضا حسینی دوست، مرتضی عزیزالهی، مریم میان آبادی صفحات 107-116
    میکروپلاستیک ها (MPs) در اقیانوس حامل مجموعه های میکروبی هستند و هنگامی که در اقیانوس رها می شوند به سرعت توسط میکروب ها احاطه می شوند.  نقش برهمکنش های میکروبی با میکروپلاستیک ها در اکوسیستم های دریایی اخیرا به تفصیل بررسی شده و حضور میکروپلاستیک ها در محیط های دریایی توجه جهانی را به خود جلب کرده است. میکروپلاستیک ها جوامع بیوفیلم های میکروبی را که از محیط اطراف متمایز هستند، انتقال می دهند. اگرچه میکروارگانیسم های کلونیزه شده روی میکروپلاستیک ها پلاستیک برای سرنوشت آنها در اکوسیستم های مختلف مهم هستند، اما تاثیر آن بر سرنوشت آنها تا حد زیادی ناشناخته است. در این بررسی، ما بر ایجاد بیوفیلم های خاص پلاستیکی (plastisphere) تمرکز کردیم. غنی سازی باکتری های بیماری زا همراه با عملکرد  میکروپلاستیک ها و تخریب میکروبی میکروپلاستیک ها در محیط دریایی، درک بهتری از گسترش پلاستی کره و بیوفیلم در محیط های دریایی ارایه می دهد و در مورد تجزیه زیستی پلاستیک ها بحث می کند. همچنین، شناسایی «هیچ هایکر» بالقوه بیماری زا در پلاستی کره در نظر گرفته شده است.
    کلیدواژگان: میکروپلاستیک ها، میکروارگانیسم ها، جوامع بیوفیلم، تجزیه میکروبی
|
  • Amirreza Mahmoudi *, Abbas Taghvaee, Seyedeh Mahshid Miri Balajorshari Pages 60-67
    In this research, the results of the Human Genome Project (HGP) and the possible ethical problems it may cause were evaluated through concrete examples. In the study, it has been tried to reveal in detail how the social rights and freedoms, ethics, social norms and values of the individual will be affected and where the borders will begin and end in the event of the potential risks that HGP carries. Discussions have been made on the problem that the individual can be instrumentalized and turned into a commodity as a result of genetic interventions, and unfortunately, it has been determined that genetic interventions are in a structure that can lead to an intervention in the fundamental rights and freedoms of the individual. The aim of this study is to show the usage areas of the human genome project and to examine the results of this project in terms of the ethical consequences of the techniques and applications used.
    Keywords: Ethic, genome, Project, Genetic Intervention, freedom, Rights
  • Reyhaneh Kouchakinejad, Shahab Shariati *, Jafar Abolhasani, Ebrahim Ghorbani-Kalhor, MohammadTaghi Vardini Pages 68-77

    Azolla Filiculoides fern was utilized as a natural adsorbent to develop a magnetic solid phase extraction method for the preconcentration and determination of trace amounts of chlorpyrifos pesticide, which is a primary environmental concern. In this study, the magnetic solid phase extraction (MSPE) method using magnetite-modified azolla nanocomposites (azolla@Fe3O4 NCs) was developed to preconcentrate trace amounts of chlorpyrifos pesticide prior to UV-Vis spectroscopy. The structural characteristics of the synthesized nanocomposites (NCs) were investigated by X-ray diffraction (XRD), field emission scanning electron microscopy (FESEM), Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR), and vibrating sample magnetometry (VSM) methods. In the proposed MSPE method, after optimizing the adsorption/desorption variables in MSPE and obtaining the optimum level of each variable (adsorption step: Vsample = 50 mL, contact time = 15 min, solution pH = 3, adsorbent mass = 0.05 g, ionic strength = 0.01 mol L-1; desorption step: eluent type and volume = ethanol (2 mL) for 10 min), the desorbed ethanolic solution was spectrophotometrically investigated in the UV-Vis region. The results confirm the developed MSPE method can be used for the preconcentration and determination of trace amounts of chlorpyrifos in the aqueous samples.

    Keywords: Azolla filiculoides, Magnetic Solid phase Extraction, nanocomposite, Pesticide, Chlorpyrifos
  • Azita Tisheyar, Moahmmad Faezi Ghasemi *, Nour Amirmozafari Pages 78-88
    Pseudomonas aeruginosa is the main cause of nosocomial infections, and is resistant to most antibiotics, this study aimed to evaluate the effects of different stress conditions on growth, the protein profile, and biochemical characteristics of this bacterium. The cells of P. aeruginosa ATCC 27853 in the logarithmic phase were exposed to different stress factors such as sucrose concentration, ethanol, acid, osmotic pressure, and CoCl2. Following each stress condition, the growth and the survival of bacterial cells were determined. Microscopic observation showed morphological changes in different stress conditions. P. aeruginosa ATCC 27853 tolerated up to pH 3, 55% (V/V) ethanol, and CoCl2 up to 7% (W/V), and beyond these amounts, the bacterium lost its ability to survive. Maximum tolerance to sucrose was about 35% (W/V). The results showed that different stress conditions could not effect on the main biochemical characteristics of P. aeruginosa ATCC 27853. Scanning electron microscopy of the cells exposed to different stress conditions showed wide changes in the morphology of cells. In addition, upon treating to different stresses significant changes were observed in the protein profile of P. aeruginosa ATCC 27853 according to SDS-PAGE analysis. It can be concluded that severe environmental stresses have great effects on the growth pattern, phenotypic characteristics, and protein profile of P. aeruginosa ATCC 27853. If the stresses induced all at once, they will cause the death, but if they are affected slowly and for longer period, most bacteria will be able to repair the damaged parts, and the growth of will resume.
    Keywords: Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, Stress, Protein profile, Biochemical characteristics, Growth pattern
  • Fatemeh Honarjooy Barkusaraey *, Roya Mafigholami, Gholam Khayati Pages 89-99
    Research on the hazardous waste of paint sludge is mostly focused on recovering the sludge and pollution control with methods such as solidification. This research aimed to study the comparison of biological removal of zinc from paint sludge using a native Pseudomonas aeruginosa strain and Acidithiobacillus thiooxidans PTCC 1692. Samples of water-based paint sludge were collected under aseptic conditions. Isolation of endogenous strains was performed in Bushnell-Haas (BH) medium from paint sludge, and A. thiooxidans PTCC 1692 was cultured in the medium 119. Optimization of the process parameters for the biological removal of zinc was performed using the design of the experimental (DOE) method for both organisms. The results showed that A. thiooxidans is capable of biological removal of zinc with a higher pulp density and with a more extended bioleaching period. The results of the chemical analysis show the removal of zinc metal by 57.76% compared to P. aeruginosa by 36.39%, and, the removal of other metals such as Cr, Ni, Pb, and Cd were observed in the residual sludge from the process. Energy Disperse X-Ray Analysis (EDX) showed the more favorable effect of this bacterium in reducing heavy metals.
    Keywords: Automotive Industry, Paint Sludge, Bioleaching, Pseudomonas aeruginosa, Acidithiobacillus thiooxidans PTCC 1692
  • Fatemeh Shams Moattar *, Mirsassan Mirpour, Naghmeh Hemmati Pages 100-106
    Pimpinella saxifraga L. is a genus of aromatic plants native to northern Iran. Some of its medicinal benefits are already known. The purpose of this study is to investigate the effect of Pimpinella saxifraga L. plant extract on some environmental isolates of Enterococcus faecalis and the HeLa cell line. After collecting the plant and drying it, methanolic and aqueous extracts were prepared. Since phenolic compounds have multiple effects, the number of phenolic compounds in the methanolic extract was measured by the Folin-ciocalteu method. Antibacterial activity against E. faecalis was first measured by disk diffusion, and then MIC and MBC were measured by the Microdilution method. Finally, the anti-proliferative activity of plant extracts on the cervical cancer cell line (HeLa) was investigated using the MTT method. The volume of phenolic compounds in the methanolic extract was 968.33 mg/ml. The investigation of the antimicrobial effect showed that the methanolic extract has significant effects against E. faecalis. The MIC and MBC of this extract were 25 and 100 mg/ml, respectively, and the growth of the cervical cancer cell line (HeLa) was inhibited by about 13% by using MIC concentration. The results of the experiments demonstrated that the methanolic extract of P. saxifraga L. has an inhibitory effect on the growth and proliferation of Enterococcus faecalis and the HeLa cell line.
    Keywords: Pimpinella saxifraga L, Enterococcus faecalis, antibacterial effect, Methanolic extracts, Hela cell line
  • Nahid Masoumi *, Seyed Reza Hosseini Doust, Morteza Azizollahi, Maryam Miyanabadi Pages 107-116
    We have known that microplastics (MPs) in the ocean are carriers of microbial dominated assemblages and rapidly are colonized by microbes when released into ocean. However, the role of microbial interactions with microplastics in marine ecosystems has been investigated in detail recently. The presence of microplastics in the marine environment has been raising global attention. Microparticles transport biofilm communities that are distinct from the surrounding environment. Although plastic-colonizing microorganisms are important for the fate of MPs in different ecosystems but its influence on the fate of microplastics is largely unknown. In this review, we focused on the establishment of plastic-specific biofilms (plastisphere); enrichment of pathogenic bacteria coupled to a vector function of microplastics; and the microbial degradation of microplastics in the marine environment. In addition providing a better understanding of plastisphere and biofilm expansion in marine environment, and discuss plastic biodegradation. Also, identification of potentially pathogenic “hitchhikers” in the plastisphere considered.
    Keywords: Microplastics, microorganisms, Biofilm communities, Microbial degradation