در پی ارتحال آیت الله آقای حاج آقا عزالدین حسینی زنجانی، رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی، درگذشت آن عالم جلیل القدر را به عموم ارادتمندان ایشان در مشهد و زنجان و به علمای اعلام و حوزه های علمیه و بیت مکرم ایشان تسلیت گفتند. متن پیام حضرت آیت الله خامنه ای به این شرح است:

رحلت عالم جلیل القدر مرحوم آیت الله آقای حاج آقا عزالدین حسینی زنجانی رضوان الله تعالی علیه را به عموم ارادتمندان ایشان در مشهد و زنجان و به علمای اعلام و حوزه های علمیه و بطور ویژه به آقازادگان محترم و بیت مکرم ایشان تسلیت میگویم. این بزرگوار که از عالمان برجسته و ذیفنون به شمار می رفتند، از زنجان و نیز دوران اقامت طولانی در مشهد مقدس، کانون توجه فرزانگان و اصحاب اندیشه و هنر نیز قرار داشتند و محفل گرم هدایت و افاده ی ایشان محل حضور طبقات گوناگون بود. خداوند متعال بر علو درجات این عالم جلیل بی فزاید و بازماندگان را مشمول اجر و فضل خود قرار دهد. سید علی خامنه ای،24 اردیبهشت 92