بررسی لایحه بودجه سال آینده نشان می دهد اجرای قانون هدفمندی یارانه ها مغایر با برنامه ششم توسعه است. کمیسیون تلفیق مجلس در جریان بررسی تبصره های 14 و 18 لایحه بودجه97 با پیشنهاد دولت مبنی بر افزایش قیمت بنزین به 1500 تومان و به صورت کلی هرگونه افزایش قیمت بنزین و سایر حامل های انرژی مخالفت کرد، ولی پیشنهاد دیگر دولت مبنی بر کاهش درآمد سازمان هدفمندی یارانه ها به 37 هزار میلیارد تومان که به معنای حذف حدود 34 میلیون نفر از دریافت یارانه نقدی است را به تصویب رساند. فارغ از انتقادهایی که به این مصوبات کمیسیون تلفیق مجلس مطرح است، در این مصوبات به ماده 39 قانون برنامه ششم توسعه درباره شفاف سازی منابع و مصارف هدفمندسازی یارانه ها بی توجهی شده است.