به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب مشترک مهندس حسین عبدی و ایرج برنوسی

  • حسین عبدی، هادی علی پور*، ایرج برنوسی، جعفر جعفرزاده

    ارزیابی ساختار جمعیت، جهت درک الگوهای تنوع، انتخاب والدین مناسب برای تلاقی، شناسایی دقیق مکان های ژنومی کنترل کننده صفات، مطالعات تکاملی و روابط خویشاوندی ضروری است. در جریان تحقیق حاضر، ساختار ژنتیکی در جمعیتی متشکل از 383 ژنوتیپ گندم ایرانی از گونه های هگزاپلویید (ارقام زراعی و توده های بومی) و تتراپلویید بر اساس روش های مبتنی بر فاصله (تجزیه به مولفه های اصلی و تجزیه تابع تشخیص مولفه های اصلی) مورد مطالعه قرار گرفت. بدین منظور از 16270 نشانگر چندشکلی تک نوکلیوتیدی (SNP) به دست آمده توسط روش GBS، استفاده شد. بر اساس نتایج، تقریبا یک چهارم از واریانس کل به تنوع بین جمعیت ها تعلق داشت و ضریب Fst بین ارقام زراعی و توده های بومی برابر با 0.15 به دست آمد. در حالی که ضریب فوق بین نمونه های تتراپلویید و توده های بومی هگزاپلویید بالا و برابر با 0.44 بود. ژنوم D کمترین مقدار شاخص Fst را به خود اختصاص داد و کروموزوم 4B بیشترین میزان ضریب Fst و سایر شاخص تنوع ژنی را نشان داد. گرچه بای پلات PCA، ارقام زراعی و توده های بومی گندم های هگزاپلویید را به خوبی از هم تفکیک نمود، اما نتوانست تمایز روشنی بین نمونه های تتراپلویید با سایر ژنوتیپ ها ایجاد نماید. ارزیابی دقیق ساختار جمعیت با روش DAPC توانست به طور موفقیت آمیزی گروه های از پیش تعیین شده را شناسایی و تفکیک کند. این نتیجه بدان دلیل است که رویکرد DAPC تمایز بین گروه ها را به حداکثر و تغییرات درون گروه را به حداقل می رساند. اختلاط جزیی بین ارقام زراعی و توده های بومی هگزاپلویید را می توان به تبادل ژنی بین این دو گروه و یا شاید برچسب گذاری اشتباه آنان در زمان جمع آوری ارتباط داد. به طور کلی، نتایج حاصل از این مطالعه اطلاعات مفیدی درباره تمایز ژنتیکی نمونه های گندم تتراپلویید و هگزاپلویید ایرانی ارایه داد که می تواند در برنامه ریزی های آتی به نژادی گندم مورد استفاده قرار گیرد. همچنین حفاظت از این نمونه ها در بانک های ژن برای استراتژی های مختلف ضروری می باشد.

    کلید واژگان: ارقام زراعی, توده های بومی, شاخص تثبیت, گندم تتراپلوئید و هگزاپلوئید, نشانگرهای SNP}
    Hossein Abdi, Hadi Alipour*, Iraj Bernousi, Jafar Jafarzadeh

    Evaluating the population structure is essential for understanding diversity patterns, choosing proper parents for crossing, accurate identification of genomic regions controlling traits, and evolutionary and kinship relationship studies. In this research, the genetic structure of a wheat population was studied in a panel consisting of 383 Iranian wheat genotypes of hexaploid (cultivars and landraces) and tetraploid species based on distance-based methods (principal component analysis and discriminant analysis of principal component). For this purpose, 16270 single nucleotide polymorphism (SNP) markers obtained by the GBS technique were used. According to the results, almost a quarter of the total variance was belonged to the diversity between populations, and the Fst coefficient between cultivars and landraces was equal to 0.15. In contrast, the above coefficient between tetraploid samples and hexaploid landraces was high and equal to 0.44. Genome D had the lowest value of Fst index and chromosome 4B showed the highest Fst coefficient, and other genetic diversity indices. Although the PCA biplot distinguished hexaploid wheat cultivars from landraces, it was unable to distinctly separate tetraploid genotypes from other genotypes. Accurate evaluation of the population structure with the DAPC method was able to identify and separate the predetermined successfully groups, suggesting that the DAPC approach maximizes the differentiation between groups and minimizes the changes within the group. Partial admixture between cultivars and landraces of hexaploid wheat can be related to gene exchange between these two groups or perhaps their wrong labeling at the time of collection. In general, the results of this study provided valuable information about the genetic differentiation of Iranian tetraploid and hexaploid wheat, which can be used in future wheat breeding programs. Further, protecting these genotypes in gene banks is necessary for different strategies.

    Keywords: Cultivars, Landraces, Fixation index, Tetraploid, hexaploid wheat, SNP markers}
  • حسین عبدی، هادی علیپور*، ایرج برنوسی، جعفر جعفرزاده

    غربالگری سریع ژرم پلاسم گیاهی در مراحل اولیه رشد و شناسایی مبنای ژنتیکی شاخص پژمردگی برگ گندم در مرحله گیاهچه ای برای برنامه های اصلاحی گندم ضروری است. در تحقیق حاضر، تعداد 290 ژنوتیپ گندم نان ایرانی شامل 90 رقم زراعی و 200 توده بومی در سال 1400 در گلخانه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه در شرایط تنش خشکی در مرحله گیاهچه ای از نظر شاخص پژمردگی برگ مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که بین ژنوتیپ های مورد مطالعه به لحاظ میزان پژمردگی برگ تنوع وجود داشت و توده های بومی به طور معنی داری، (حدود 12 درصد) از نمره پژمردگی بیشتری نسبت به ارقام زراعی برخوردار بودند که این موضوع می تواند نتیجه مستقیم یا غیرمستقیم گزینش باشد. از نظر شاخص پژمردگی برگ حدود نه درصد از ارقام زراعی و سه درصد از توده های بومی در گروه متحمل به تنش خشکی قرار گرفتند. تجزیه ارتباطی با دو روش GLM و MLM تقریبا نتایج یکسانی داشت. کروموزم های 3B، 2A، 7B، 1A، 3A، 4B، 5B، 6A و 6B به ترتیب بیشترین تعداد ارتباط نشانگر با شاخص پژمردگی برگ را در کل جمعیت داشتند که تنوع فنوتیپی صفت را از 6 الی 20 درصد توجیه می کردند. حاشیه نویسی نشانگرهای معنی دار، تاییدکننده نتایج تجزیه GWAS بود و نشان داده شد که تعداد پنج نشانگر روی کروموزوم های 1A، 2A، 3A و 7B با ژن هایی که در تحمل گیاه گندم به تنش خشکی نقش دارند، هم ردیفی داشتند. جزء جدایی ناپذیر غشا بودن، فسفوریلاسیون پروتیین ها، فعالیت آنزیم های متیل ترانسفراز و اتصال یون روی (Zn2+) بخشی از کارکردهای مولکولی و فرآیندهای زیستی ژن های یاد شده بودند. یافته های تحقیق حاضر، بینشی عمیق در رابطه با پژمردگی برگ گندم های نان ایرانی در شرایط تنش خشکی ارایه می دهد که می توان از آن در برنامه های گزینشی آتی گندم نان استفاده کرد.

    کلید واژگان: تجزیه ارتباطی در سطح ژنوم, شاخص پژمردگی برگ, کروموزوم, گندم نان و نشانگرهای مولکولی}
    Hossein Abdi, Hadi Alipour*, Iraj Bernousi, Jafar Jafarzadeh

    Rapid screening of plant germplasm in the early stages of growth and determining the genetic basis of wheat leaf wilting index at the seedling stage is necessary for wheat breeding programs. In the present research, leaf wilting index for 290 Iranian bread wheat genotypes, including; 90 cultivars and 200 landraces were studied under drought stress conditions at the seedling stage in 2021 in research greenhouse of faculty agriculture of Urmia University, Urmia, Iran. The results showed that there was variation between the studied genotypes for leaf wilting index, and the landraces had significantly 12% more wilting scores than cultivars. This can be attributed to direct or indirect selection by breeders. The leaf wilting index of about 9% of cultivars and 3% of landraces were identified in drought stress tolerant group. GWAS had nearly the same results as general lineare model and MLM methods. Chromosomes 3B, 2A, 7B, 1A, 3A, 4B, 5B, 6A and 6B, respectively, had the highest number of marker-trait associations in the entire population which explained the phenotypic variation of the trait from 6 to 20%. Annotation of significant markers confirmed the results of GWAS analysis and showed that five markers on chromosomes 1A, 2A, 3A and 7B were aligned with different genes involved in drought stress tolerance. An integral component of membrane, protein phosphorylation, methyltransferase activity and zinc ion binding were part of the molecular functions and biological processes of the identified genes. The findings of this research provide a deep insight into the variation of leaf wilting traits in Iranian bread wheat germplasm under drought stress conditions, which can be used as selction criterium in the national bread wheat improvement programs.

    Keywords: Bread wheat Chromosome, Genome wide association study, Leaf wilting index, and Molecular markers}
فهرست مطالب مشترک: 2 عنوان
  • مهندس حسین عبدی
    عبدی، حسین
    دانشجوی دکتری ژنتیک و به نژادی گیاهی، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه
  • نویسندگان همکار
  • ایرج برنوسی
    برنوسی، ایرج
    دانشیار اصلاح نباتات، دانشگاه ارومیه
بدانید!
  • این فهرست شامل مطالبی از ایشان است که در سایت مگیران نمایه شده و توسط نویسنده تایید شده‌است.
  • مگیران تنها مقالات مجلات ایرانی عضو خود را نمایه می‌کند. بدیهی است مقالات منتشر شده نگارنده/پژوهشگر در مجلات خارجی، همایش‌ها و مجلاتی که با مگیران همکاری ندارند در این فهرست نیامده‌است.
  • اسامی نویسندگان همکار در صورت عضویت در مگیران و تایید مقالات نمایش داده می شود.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال