بررسی چندشکلی ژنهای PPARGC1A و OPN در گاوهای هلشتاین استانهای تهران و اصفهان

PPARGC1A عضوی از خانواده فعال کننده های کمکی رونویسی میباشد که نقش اساسی در تنظیم متابولیسم انرژی ایفا مینماید. OPN نوعی فسفو پروتئین است که در بافتها و سلولهای مختلف سنتز شده و در مایعات بدن ترشح می شود. در این مطالعه، استخراج DNA از نمونه های خون جمعآوری شده از 893 راس گاو هلشتاین از استانهای تهران و اصفهان انجام شد. برای استخراج DNA از روش نمکی استفاده گردید. سپس SNPT>C در موقعیت 2391 و SNPA>C در موقعیت 8839 از ژن PPARGC1A و نیز SNPC>T در موقعیت 3328 از ژن OPN به روش PCR -RFLP تعیین ژنوتیپ شدند. با استفاده از نرم افزار Pop Gene، فراوانی ژنوتیپ های TT، TC و CC در موقعیت نوکلئوتیدی 2391 به ترتیب 0 محاسبه / 0 و 89 / 53 و 18 درصد و همچنین شاخص های شانون و نئی به ترتیب 53، 21 شد. فراوانی ژنوتیپهای AA، AC و CC 31 و 20 درصد و همچنین، در موقعیت نوکلئوتیدی 8839 به ترتیب 83 0 محاسبه شد. فراوانی ژنوتیپهای / 0 و 85 / شاخص های شانون و نئی به ترتیب 53 CC، CT و TT از ژن OPN به محاسبه شد. با استفاده از / 0 و 89 / 37 و 18 درصد و همچنین شاخص های شانون و نئی به ترتیب 59، ترتیب 29 آزمون مربع کای، حالت تعادل برای جمعیتها بررسی شد. ژنوتیپها در همه جایگاه ها از تعادل هاردی واینبرگ انحراف -نشان دادند.