مقایسه ترادف ژن پروتئین پوششی جدایه های ویروس زردی غربی چغندر آلوده کننده ی کلزا

ویروس زردی غربی چغندر (BWYV) از گونه های جنسPolerovirus و خانواده Luteoviridae یکی از ویروس های مهم کشاورزی می باشد که بیش از 150 گونه گیاهی متعلق به 23خانواده گیاهان دو لپه ای را در سطح دنیا آلوده می کند. ردیابی BWYV در مزارع کلزای استان های گلستان و تهران توسط آزمون الیزای غیرمستقیم 3/8% آلودگی را نشان داد. آلودگی نمونه های الیزا مثبت با تکثیرژن پروتئین پوششی ویروس توسط RT-PCR تایید شد. ترادف ژن پروتئین پوششی هفت جدایه منتخب تعیین و در سطوح اسید نوکلئیک و اسید آمینه با ترادف 12 جدایه از کشورهای متفاوت موجود در GenBank مقایسه شد. آنالیز مقایسه ای ترادف اسید نوکلئیک ژن پروتئین پوششی BWYV جدایه های ایرانی 4/93-100 درصد و در سطح اسید آمینه 2/93 - 100% مشابهت نشان داد. بیشترین تشابه جدایه های ایرانی با سایر جدایه ها بین جدایه هایIr8 و Ir100 از ایران با جدایه های فرانسه (X13063 وL39967) و انگلیس (L39973 و L39970) با 2/97% و 6/96% به ترتیب در سطح اسید نوکلئیک و اسید آمینه بود. آنالیز نوترکیبی هیچگونه رخداد نوترکیبی درون گونه ای را در بین ژن پروتئین پوششی BWYV نشان نداد. این اولین گزارش از تعیین ترادف، تجزیه و تحلیل بخشی از ژنوم جدایه-های ایرانی ویروس زردی غربی چغندر است.