آغازگرهای دژنره ردیابی و تشخیص پوتی ویروس ها را از شمال غرب ایران تسهیل می کنند

پوتی ویروس ها عامل 40% بیماری های ویروسی در محصولات مختلف از جمله سبزیجات و حبوبات می باشند. پوتی ویروس ها از طریق شیره گیاهی، بذر و گونه های متعدد شته انتقال می بایند. به لحاظ آسانی سرایت این ویروس ها، ردیابی این چنین ویروسها به منظور کنترل بیماری های ناشی از آنها خیلی مهم می باشد..
این مطالعه، بررسی کارآیی دو جفت آغازگر در ردیابی پوتی ویروس های آلوده کننده سبزیجات در شمال غرب ایران می باشد..
برای تشخیص پوتی ویروس های آلوده کننده سبزیجات، آر ان ای کل تهیه شده از برگ های بیمار مورد نسخه برداری معکوس با آغازگر Oligo d(T)15،M4T یا یکی از آغازگر اختصاصی پوتی ویروس قرار داده شد و متعاقبا واکنش زنجیره ای پلیمرآز با یک جفت آغازگر دژنره شامل Sprimer/M4 یا NIb2F/NIb3R قرار داده شد که انتظار می رفت قطعات حدود 1700 یا 350 جفت باز، به ترتیب، تولید کنند. تکثیر با Sprimer/M4 از تعداد 7 نمونه انجام گرفت اما قطعات غیراختصاصی هم مورد تکثیر قرار گرفتند. با وجود این، تکثیر اختصاصی از تعداد 31 نمونه با استفاده از NIb2F/NIb3R انجام گرفت. قطعات 350 جفت باز حاصل از پی سی آر با NIb2F/NIb3R مورد همسانه سازی و ترادف یابی قرار داده شدند..
بررسی با BLAST روی داده های ترادف نوکلئوتیدی آشکار نمود که قطعات حاصله متعلق به ویروس موزاییک معمولی لوبیا (از لوبیا سبز)، ویروس موزاییک زرد لوبیا (از باقلا)، ویروس وای سیب زمینی (از سیب زمینی)، ویروس موزاییک هندوانه (از کدو، طالبی یا هندوانه)، ویروس موزاییک زوکینی (از کدو) و ویروس موزاییک سویا (از لوبیا) بوده است..
این مطالعه کارایی بالای NIb2F/NIb3R درردیابی پوتی ویروس ها را ثابت نمود و آلودگی ها به تنوعی از گونه های پوتی ویروس در شمال غرب ایران را آشکار کرد. در این مطالعه، ویروس موزاییک سویا برای اولین بار در ایران با پی سی آر مورد ردیابی واقع شد..